植物的分子生物学分类系统：APG IV系统

现代植物APG分类系统是被子植物系统发育研究组（Angiosperm Phylogeny Group）

基于分子系统学研究的被子植物分类体系，其核心特点是以分支分类学的单系原则界定植物分类群（尤其是目和科）的范围‌。

1998年首次提出APG I系统，以分子数据为基础，将被子植物分为40个非正式目‌。

2003年发布APG II系统‌，优化分类单元，将科级分类设为可合并的弹性方式，并保留部分未定地位类群‌。

2009年发布APG III系统‌，新增14个目，合并44个科，将未定地位科从39科缩减至10科，并明确核心类群（如真双子叶植物分支）‌。

APG IV系统‌是2016年发布的最新版本，包含64目、416科，进一步整合分子与形态数据，成为国际学术界广泛接受的分类框架‌。

APG IV系统的分类层级与原则‌

无等级演化支‌：APG IV系统将被子植物视为无等级的演化支，便于与其他高等级分类系统对接‌。

单系原则‌：所有分类群均为单系，避免并系或多系问题。例如，传统大戟科被拆分为7个科，仅保留狭义大戟科‌。

超目与目‌：被子植物分支下设超目，再分目、科。APG IV系统共设64目，科数增至416科‌。

APG IV分类系统中核心类群划分‌：

基底旁系群‌：如无油樟目、睡莲目等‌。

核心类群‌：包括木兰类、单子叶植物、真双子叶植物。真双子叶植物进一步分为蔷薇分支与菊分支‌。

APG IV分类系统与传统分类的差异‌：①分子证据优先‌，APG系统依赖DNA序列而非形态特征，导致部分传统分类被调整。例如，朴树属从榆科移至大麻科‌。②科属合并‌：为减少分类碎片化，APG III合并了44个科，如八角茴香科并入木兰科‌。

以下是APG IV分类系统的六十四个目及科数：

被子植物基部群：无油樟目（1科）、睡莲目（3科）、木兰藤目（3科）。

木兰类：白樟目（2科）、胡椒目（3科）、木兰目（6科）、樟目（7科）。

独立支系：金粟兰目（1科，金粟兰科）。

单子叶植物分枝：菖蒲目（菖蒲科）、泽泻目（14科）、无叶莲目（无叶莲科）、薯蓣目（3科）、露兜树目（5科）、百合目（10科）、天门冬目（14科）。

单子叶植物分支之鸭跖草类：棕榈目（2科）、鸭跖草目（5科）、姜目（8科）、禾本目（14科）。

真双子叶植物的可能姊妹群：金鱼藻目（金鱼藻科）。

真双子叶植物基部群：毛茛目（7科）、山龙眼目（4科）、昆栏树目（昆栏树科）。

核心真双子叶植物基部群：大叶草目（2科）、五桠果目（五桠果科）。

超蔷薇类基部群：虎耳草目（15科）。

蔷薇类：葡萄目（葡萄科）。

蔷薇之豆类基部群：蒺藜目（2科）。

蔷薇类之豆类之固氮分支：豆目（4科）、蔷薇目（9科）、壳斗目（7科）、葫芦目（8科）。

蔷薇类之COM分支：卫矛目（2科）、酢浆草目（7科）、金虎尾目（36科）。

蔷薇类之锦葵类：牻牛儿苗目（2科），桃金娘目（9科）、缨子木目（7科）、苦榄木目（苦榄木科）、腺椒树目（4科）、无患子目（9科）、锦葵目（10科）、十字花目（17科）。

超菊类基部群：红珊藤目（2科）、檀香目（7科）、石竹目（38科）。

菊类：山茱萸目（7科）、杜鹃花目（22科）。

菊类之唇形类：茶茱萸目（2科）、水螅花目（水螅花科）、丝缨花目（2科）、龙胆目（5科）、紫草目（紫草科）、黄漆姑目（黄漆姑科）、茄目（5科）、唇形目（24科）。

菊类之桔梗类：冬青目（5科）、菊目（11科）、绒球花目（2科）、盔被花目（盔被花科）、川续断目（2科）、伞形目（7科）。

APG IV系统因科目数量适宜（64目、416科），被推荐为学术研究和教学的基础工具‌。其框架也影响了其他植物类群的分类，如蕨类植物的PPG I系统和裸子植物的克里斯滕许斯系统‌。

参考阅读：植物的克朗奎斯特分类法