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上传蛋白质组学数据到proteomexchange
2020-05-10 | 阅:  转:  |  分享 
  
上传蛋白质组学数据到proteomexchange登录网址http://proteomecentral.proteomexchange.or
g用邮箱注册自己的账户。下载上传软件:px-submission-tool.zip。本文主要介绍的是PRoteomicsIDEn
tifications(PRIDE)数据库。PRIDE是ProteomeXchange(PX)旗下的一个数据库,是全世界最大的
蛋白质组学数据库。安装。双击px-submission-tool-2.4.15.jar文件,完成安装。登录。用PX网站注册的用户名
和密码登录。注意,初始密码会发送到注册邮箱,查收邮件。按照步骤的要求填写、上传原始文件即可。上传完成后,大概需要一周时间审核,才能
给一个accessionnumber.需要保障网速,我第一次上传最后一步失败了,可能是晚上用网人多,第二天早上再上传就成功了。
需要引用开发者的文献:2016年开发,2019年更新升级了一次。ThePRIDEdatabaseandrelatedto
olsandresourcesin2019:improvingsupportforquantificationd
ata,NucleicAcidsRes,2019,PerezRiverol,Y.Csordas,A.Bai,
J.Bernal-Llinares,M.上传数据逐年剧增截至2018年底,人和小鼠的数据较多,其次是拟南芥
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(本文系木华先生原创)