上传蛋白质组学数据到proteomexchange登录网址http://proteomecentral.proteomexchange.or g用邮箱注册自己的账户。下载上传软件:px-submission-tool.zip。本文主要介绍的是PRoteomicsIDEn tifications(PRIDE)数据库。PRIDE是ProteomeXchange(PX)旗下的一个数据库,是全世界最大的 蛋白质组学数据库。安装。双击px-submission-tool-2.4.15.jar文件,完成安装。登录。用PX网站注册的用户名 和密码登录。注意,初始密码会发送到注册邮箱,查收邮件。按照步骤的要求填写、上传原始文件即可。上传完成后,大概需要一周时间审核,才能 给一个accessionnumber.需要保障网速,我第一次上传最后一步失败了,可能是晚上用网人多,第二天早上再上传就成功了。 需要引用开发者的文献:2016年开发,2019年更新升级了一次。ThePRIDEdatabaseandrelatedto olsandresourcesin2019:improvingsupportforquantificationd ata,NucleicAcidsRes,2019,PerezRiverol,Y.Csordas,A.Bai, J.Bernal-Llinares,M.上传数据逐年剧增截至2018年底,人和小鼠的数据较多,其次是拟南芥 |
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