swiss-model蛋白三维结构预测蛋白三维结构模型预测LHCGR基因NM_000233，c.547G>A，p.G183R蛋白质三维结构预
测方法概览比较建模法 比较建模又称同源建模，原理简单，是基于计划相关的序列具有相似的三维结构且进化过程中三维结构比序列保守的原理，
利用计划相关模板结构信息建模。 基本步骤：1)将目标序列作为查询序列，在已知蛋白结构数据中搜索，确定和识别出一个同源模板。2)将目
标序列和模板结构进行比对。3)以模板结构骨架为模型，建立目标蛋白质骨架模型。4)对模型结果进行评价，确定模板的实用性。查找蛋白序列
LHCGR基因，NM_000233;exon14；c.547G>A(p.G183R)；699aaNCBI数据库：https://w
ww.ncbi.nlm.nih.gov/查找蛋白序列LHCGR基因，NM_000233;exon14；c.547G>A(p.G18
3R)；699aaSWISS-MODEL同源建模法--swiss-model:目前应用最广泛的比较建模法蛋白结构预测工具https
://swissmodel.expasy.org查询到的氨基酸序列复制到输入框，开始建模输入蛋白全序列构建模型，共2个结果页面解读
：（1）首先看搜到的模板是否覆盖当前变异位点；（2）检查搜到的模板与输入序列一致度是否>30%（2）如果可用，再看swissmod
el评分高低情况。GMQE：可信度范围为0-1，值越大表明质量越好QMEAN4：区间-4-0，越接近0，评估待测蛋白与模板蛋白的匹
配度越好。模型下载下载后的蛋白结构预测模型可以用Swiss-pdbviewer查看ATCG用Swiss-pdbviewer打开pd
b模型文件，在controlpanel里去掉氨基酸骨架和side显示，添加ribn显示在controlpanel的colR里选择添
加ribbon（colR->ribbon）。Color栏下选择SecondaryStructureSuccession根据二级机构
进行着色进行着色。在controlpanel中显示关注的突变位点及其侧链、标注。用Display->RenderinSolid3D
使呈现3D效果。用MoveAll区域的按钮分别进行大小、位置、角度的调整如需关注氢键，用Tools->ComputeH-Bonds
工具显示氢键，查看关注位点氨基酸与附近氨基酸有无氢键构建突变型氨基酸：点击Mutant按钮，点击蛋白结构突变的位点，下拉菜单选择突
变的氨基酸，再次点击Mutant按钮，完成突变氨基酸展示。ctrl+e保存截图野生型：183G突变型：183R |
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