· 294 · 中 华 神 经 医 学 杂 志2022 年3 月 第21 卷 第3 期 ChinJNeuromed,March2022,Vol.21,No.3
· 综 述 ·
DNA 甲 基 化 在 中 枢 神 经 系 统 肿 瘤 分 型 及
诊 断 中 的 应 用 进 展
葛 荣 陈 金 平 刘 创 峰
宁 波 市 临 床 病 理 诊 断 中 心 组 织 病 理 科 ， 宁 波 315021
通 信 作 者 ： 葛 荣 ，Email ：gerong123@sina.com
【 摘 要 】 DNA 甲 基 化 是 目 前 研 究 最 为 广 泛 和 深 入 的 表 观 遗 传 学 修 饰 形 式 。 在 中 枢 神 经 系 统
(CNS) 中 ，DNA 甲 基 化 是 肿 瘤 分 型 的 有 力 辅 助 工 具 ， 已 用 于 室 管 膜 瘤 、 脑 膜 瘤 等 多 种 肿 瘤 的 分 子 分
型 ， 从 而 更 准 确 地 预 测 了 肿 瘤 生 物 学 行 为 及 生 存 预 后 ， 为 患 者 个 体 化 治 疗 方 案 的 制 定 提 供 了 重 要
依 据 。 另 外 ，DNA 甲 基 化 也 已 成 为 重 要 的 辅 助 诊 断 依 据 ， 用 于CNS 中 不 同 类 型 肿 瘤 的 鉴 别 ， 从 而
提 高 了 病 理 诊 断 的 准 确 性 ， 甚 至 帮 助 发 现 了 新 的 肿 瘤 实 体 。 本 文 现 围 绕DNA 甲 基 化 在CNS 肿 瘤
分 子 分 型 及 病 理 诊 断 中 的 应 用 进 展 进 行 综 述 ， 以 期 为 临 床 上CNS 肿 瘤 的 精 准 诊 疗 提 供 更 多 启 示 。
【 关 键 词 】 DNA 甲 基 化 ； 中 枢 神 经 系 统 ； 肿 瘤 ； 分 子 分 型 ； 病 理 诊 断
基 金 项 目 ： 浙 江 省 宁 波 市 公 益 技 术 应 用 研 究 项 目(2019C50042)
DOI:10.3760/cma.j.cn115354-20210414-00244
Recent advance in role of DNA methylation in classification and diagnosis of central nervous
systemtumors
GeRong,ChenJinping,LiuChuangfeng
DepartmentofTissuePathology,NingboClinicopathologicalDiagnosisCenter,Ningbo315021,China
Correspondingauthor:GeRong,Email:gerong123@sina.com
【Abstract 】 DNAmethylation is an epigenetic modification form with the most extensive and in-
depth studying. DNA methylation is a powerful tool for tumor classification in the central nervous
system (CNS), which is used in the molecular classification of various tumors, such as ependyma and
meningioma, to accurately predict tumor biological behavior and survival prognosis, and to provide
important information for individualized treatment. DNA methylation will also become an important
auxiliary diagnostic method for the identification of different types of CNS tumors, improve the
accuracy of pathological diagnosis, and even help to find new tumor entities. In the current review, we
focus on the role of DNAmethylation in the molecular classification and pathological diagnosis of CNS
tumors,inordertoprovidemoreenlightenmentforaccuratediagnosesandtreatmentsoftumors.
【Key words 】 DNAmethylation; Central nervous system; Tumor; Molecular classification;
Pathologicaldiagnosis
Fundprogram:PublicWelfareTechnologyApplicationResearchProjectofNingbo(2019C50042)
DOI:10.3760/cma.j.cn115354-20210414-00244
人 类 肿 瘤 细 胞 存 在 多 种 基 因 改 变 ， 同 时 也 存 在 着 表 观 遗 织 形 态 学 难 以 进 行 准 确 分 型 和 预 后 评 估 。 目 前 多 项 研 究 证
传 学 的 异 常 。 表 观 遗 传 学 是 指 在 初 级DNA 序 列 不 发 生 改 变 实DNA 甲 基 化 芯 片 技 术 可 用 于CNS 肿 瘤 的 分 子 分 型 及 病
[4-6]
的 情 况 下 ， 基 因 表 达 却 发 生 了 改 变 ， 再 通 过 细 胞 周 期 性 分 裂 ， 理 诊 断 ， 并 能 更 准 确 地 提 示 肿 瘤 生 物 学 行 为 和 临 床 预 后 。
[1]
使 细 胞 含 有 相 同 的 遗 传 信 息 。DNA 甲 基 化 是 目 前 研 究 最 本 文 现 围 绕DNA 甲 基 化 在CNS 肿 瘤 分 子 分 型 及 病 理 诊 断
[2]
为 广 泛 和 深 入 的 表 观 遗 传 学 修 饰 形 式 。DNA 甲 基 化 是 活 中 的 应 用 进 展 进 行 综 述 ， 以 期 为 临 床 上CNS 肿 瘤 的 精 准 诊
性 甲 基 在 甲 基 化 转 移 酶 的 帮 助 下 转 移 至DNA 链 中 特 定 碱 基 疗 提 供 更 多 启 示 。
上 的 化 学 修 饰 过 程 ， 进 而 调 控 着 基 因 表 达 、 染 色 质 结 构 维 持
及 胚 胎 发 育 等 生 物 学 过 程 。DNA 甲 基 化 异 常 与 肿 瘤 的 发 生 一 、DNA 甲 基 化 检 测 方 法
[3]
发 展 及 细 胞 癌 变 密 切 相 关 。 全 基 因 组DNA 甲 基 化 分 析 更 随 着DNA 甲 基 化 研 究 的 不 断 深 入 ， 多 种DNA 甲 基 化 检
是 能 够 精 确 地 识 别 肿 瘤 实 体 ， 被 称 为 癌 症 的 “ 通 用 指 纹 ” 。 测 方 法 应 运 而 生 。 对 于 特 定DNA 片 段 的 甲 基 化 检 测 方 法 包
中 枢 神 经 系 统(CNS) 肿 瘤 种 类 繁 多 且 异 质 性 高 ， 应 用 组 括 甲 基 化 特 异 性PCR 、 亚 硫 酸 氢 盐 处 理 后 测 序 法 、 联 合 亚 硫
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酸 纳 的 限 制 性 内 切 酶 法 、 焦 磷 酸 测 序 和 荧 光 定 量 法 等 。 另 以 及 应 用 免 疫 组 化 染 色 检 测C11orf95 和L1CAM 蛋 白 ， 有 助
[15]
外 ， 随 着 高 通 量 测 序 技 术 的 发 展 ， 使 我 们 也 能 够 从 全 基 因 组 于 该 类 型 室 管 膜 瘤 的 诊 断 。 后 颅 窝EPN-A 型 和EPN-B 型
水 平 分 析5- 甲 基 胞 嘧 啶 及 组 蛋 白 修 饰 等 事 件 ， 这 就 是 所 谓 的 室 管 膜 瘤 分 别 表 现 为CpG 岛 的 高 甲 基 化 和 低 甲 基 化 。 后 颅
[7]
DNA 甲 基 化 测 序 。 窝EPN-A 型 室 管 膜 瘤 比EPN-B 型 更 常 见 ， 常 发 生 于 低 龄 患
DNA 甲 基 化 芯 片 技 术 的 原 理 是 探 测 亚 硫 酸 盐 处 理 后 的 儿 ， 并 且 ， 由 于 该 类 型 室 管 膜 瘤 的CpG 岛 高 甲 基 化 转 录 沉 默
DNA 序 列 杂 交 信 号 ， 亚 硫 酸 盐 处 理 的 目 的 是 将 非 甲 基 化 的 了 多 种 基 因 ， 极 易 导 致 预 后 不 良 ， 其 复 发 率 和 转 移 率 明 显 高
[16]
胞 嘧 啶 变 成 尿 嘧 啶 ， 再 将 尿 嘧 啶 转 化 为 胸 腺 嘧 啶 ， 而 甲 基 化 于EPN-B 型 。 通 过 免 疫 组 化 染 色 可 以 发 现H3K27me3 在
[8]
的 胞 嘧 啶 保 持 不 变 ， 最 后 进 行 芯 片 杂 交 。 目 前 最 新 的DNA 后 颅 窝EPN-A 型 室 管 膜 瘤 中 表 达 缺 失 ， 可 用 于 鉴 别 该 两 种
[17]
甲 基 化 芯 片 是Illumina Infinium Methylation EPIC BeadChip 亚 型 。 此 外 ， 另 有 研 究 发 现 脊 髓 黏 液 乳 头 型 室 管 膜 瘤 的 甲
芯 片( 即850K 芯 片) ， 其 是 由 美 国Illumina 公 司 在 原450K 芯 基 化 谱 与 组 织 形 态 学 关 系 不 明 确 ， 其 临 床 预 后 类 似 于 经 典 型
[5 ，11]
片 的 基 础 上 推 出 的 一 个 更 可 靠 、 更 经 济 高 效 的DNA 甲 基 化 室 管 膜 瘤 ， 建 议 定 义 为WHO 2 级 。 基 于DNA 甲 基 化 的
分 析 平 台 。850K 芯 片 可 检 测 人 全 基 因 组 约853 307 个 胞 嘧 室 管 膜 瘤 的 分 子 分 型 情 况 及 其 对 应 的WHO 分 级 、 预 后 情 况
啶 - 磷 酸 - 鸟 嘌 呤(CpG) 位 点 的 甲 基 化 状 态 ， 全 面 覆 盖 基 因 区 见 表1 。
域 和CpG 岛 ， 并 增 加 了 人 类 干 细 胞 中 的 非CpG 甲 基 化 位 点 、
表1 室 管 膜 瘤 的 分 子 分 型 及 其 对 应 的WHO 分 级 、 预 后
增 强 子 区 以 及 肿 瘤 组 织 与 正 常 组 织 间 差 异 表 达 的 甲 基 化 位
Tab. 1 Molecular typing of ependymoma and its
点 等 。DNA 甲 基 化 芯 片 技 术 目 前 广 泛 应 用 于 肿 瘤 和 一 些 复
correspondingWHOgradingandprognoses
杂 疾 病 的 研 究 。 并 且 ， 随 着 分 类 器 和 生 物 信 息 学 通 路 等 分 析
方 法 不 断 被 开 发 ， 庞 大 的DNA 甲 基 化 数 据 已 经 能 转 化 为 生
部 位 分 子 分 型 WHO 分 级 预 后
[9]
物 学 及 临 床 上 可 用 的 信 息 。 例 如 ， 基 于 肿 瘤DNA 甲 基 化 数
室 管 膜 下 瘤 1 级 良
据 ， 由 分 类 器 开 发 出 的 机 器 学 习 程 序 可 用 于 进 一 步 优 化 肿 瘤
幕 上 ZFTA(C11orf95-RELA) 融 合 阳 性 2/3 级 差
分 型 、 预 测 患 者 的 临 床 特 征 及 治 疗 反 应 等 。
YAP1 融 合 阳 性 2/3 级 良
室 管 膜 下 瘤 1 级 良
二 、DNA 甲 基 化 在CNS 肿 瘤 分 子 分 型 中 的 应 用
后 颅 窝 A 型( 无H3K27me3) 2/3 级 差
( 一) 室 管 膜 瘤
B 型( 保 留H3K27me3) 2/3 级 良
2016 年WHO CNS 肿 瘤 分 类 主 要 依 据 组 织 学 形 态 将 室
室 管 膜 下 瘤 1 级 良
管 膜 瘤 分 为3 级 ： 室 管 膜 下 瘤 和 黏 液 乳 头 型 室 管 膜 瘤 为
脊 髓 黏 液 乳 头 型 2 级 良
WHO 1 级 ， 经 典 型 、 伸 长 型 、 乳 头 型 和 透 明 细 胞 型 室 管 膜 瘤
MYCN 突 变 型 2/3 级 差
[10]
为WHO 2 级 ， 间 变 性 室 管 膜 瘤 为WHO 3 级 。 临 床 实 践 却
发 现 ， 组 织 病 理 学2 级 和3 级 的 评 价 一 致 性 较 差 ， 该 分 级 与 临
( 二) 胶 质 瘤
床 预 后 之 间 缺 乏 关 联 。 因 此 ，2021 年WHOCNS 肿 瘤 分 类 仅 2016 年WHO CNS 肿 瘤 分 类 首 次 引 入 异 柠 檬 酸 脱 氢 酶
明 确 了 室 管 膜 下 瘤(WHO 1 级) 和 黏 液 乳 头 型 室 管 膜 瘤 (IDH) 、 组 蛋 白H3 等 分 子 标 志 物 对 胶 质 瘤 进 行 分 子 分 型 ， 并
(WHO2 级) 的 级 别 ， 其 他 类 型 室 管 膜 瘤 没 有 明 确 的 组 织 学 级 提 出 了 整 合 诊 断 的 概 念 。 最 近 几 年 的 临 床 实 践 证 明 ， 这 些 分
[11]
别 ， 只 定 义 为WHO2 级 或3 级 。
子 标 志 物 能 够 反 映 一 些 胶 质 瘤 的 生 物 学 特 征 ， 并 能 提 示 患 者
目 前 ， 关 于 室 管 膜 瘤 的DNA 甲 基 化 研 究 取 得 了 较 大 进
的 预 后 ， 例 如 以 前 的 弥 漫 型 脑 干 胶 质 瘤 患 者 若 存 在H3K27M
[12] [10]
展 。Archer 和Pomeroy 结 合 解 剖 部 位 和 肿 瘤DNA 甲 基 化 突 变 ， 则 预 后 极 差 ， 被 定 义 为 弥 漫 性 中 线 胶 质 瘤 。 然 而 ， 胶
[18]
谱 系 特 征 ， 将 室 管 膜 瘤 划 分 为3 个 大 组 ， 细 分 为9 种 亚 型 。 质 瘤 间 异 质 性 较 大 ， 例 如Chen 等 利 用DNA 甲 基 化 芯 片 将
2021 年WHO CNS 肿 瘤 分 类 中 室 管 膜 瘤 采 用 了DNA 甲 基 化 脑 干 胶 质 瘤 分 为H3- 桥 脑 型 、H3- 延 髓 型 、IDH 型 和 毛 细 胞 性
分 型 ， 其 中 ， 幕 上 室 管 膜 瘤 的3 个 亚 型 分 别 为 室 管 膜 下 瘤 、
星 形 细 胞 瘤 样 型4 种 甲 基 化 亚 型 ， 每 一 种 都 有 独 特 的 基 因 组
ZFTA(C11orf95-RELA) 融 合 阳 性 及YAP1 融 合 阳 性 ； 后 颅 窝 室 和 临 床 特 征 ， 譬 如H3- 桥 脑 型 和H3- 延 髓 型 都 伴 有H3K27M
管 膜 瘤 的3 个 亚 型 分 别 为 室 管 膜 下 瘤 、 后 颅 窝 室 管 膜 瘤A 型 突 变 ， 均 属 于 弥 漫 性 中 线 胶 质 瘤 ， 但 两 者 的 发 病 机 制 不 相 同 ，
(EPN-A 型 ， 无H3K27me3) 及 后 颅 窝 室 管 膜 瘤B 型(EPN-B H3- 桥 脑 型 存 在 细 胞 周 期 信 号 通 路 异 常 ，H3- 延 髓 型 多 为 免
型 ， 保 留H3K27me3) ； 脊 髓 室 管 膜 瘤 的3 个 亚 型 分 别 为 室 管
疫 相 关 信 号 通 路 异 常 ， 故 两 者 预 后 存 在 显 著 差 异 。
[11]
膜 下 瘤 、 黏 液 乳 头 型 及MYCN 突 变 型 。 胶 质 瘤 异 质 性 还 表 现 为 有 些IDH 突 变 型 胶 质 瘤 患 者 预
室 管 膜 瘤 的DNA 甲 基 化 分 型 能 更 准 确 及 全 面 地 反 映 患 后 不 良 ， 而 有 些IDH 野 生 型 胶 质 瘤 患 者 预 后 却 不 错 ， 有 研 究
[19]
者 预 后 ， 例 如 幕 上ZFTA(C11orf95-RELA) 融 合 阳 性 和 后 颅 窝 证 实 这 与 全 基 因 组 甲 基 化 水 平 相 关 。IDH 突 变 型 胶 质 瘤
[13]
EPN-A 型 室 管 膜 瘤 的 预 后 较 差 。 目 前 临 床 上 以 幕 上 室 管
中 如 果DNA 甲 基 化 水 平 较 低 ， 肿 瘤 则 更 易 进 展 ， 预 后 与IDH
膜 瘤 最 为 常 见 ， 其 中72% 的 存 在ZFTA(C11orf95-RELA) 基 因 野 生 型 胶 质 瘤 类 似 。 然 而 ， 也 有 一 组IDH 野 生 型 弥 漫 性 胶 质
融 合 ， 导 致 核 因 子- κB(NF- κB) 途 径 异 常 激 活 。 该 类 型 室 管 膜 瘤 的 分 子 特 征 类 似 于 毛 细 胞 性 星 形 细 胞 瘤 ， 生 存 率 相 对 较
[14]
[20]
瘤 多 集 中 发 生 于 儿 童 患 者 ， 预 后 相 对 较 差 。 应 用 荧 光 原 位 好 。 同 样 的 ， 最 近 也 有 研 究 发 现IDH 1R132H 突 变 胶 质 瘤
杂 交 技 术(FISH) 检 测ZFTA(C11orf95) 与RELA 基 因 的 重 排 ，
患 者 的DNA 甲 基 化 水 平 较 低 ， 使 相 关 的 基 因 表 达 增 加 ， 其 预
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[21]
后 差 于 伴 有IDH 其 他 位 点 突 变 的 胶 质 瘤 。 int-B ， 也 分 布 在 甲 基 化 良 性 型A 组MC ben-1 ； 甚 至 ， 横 纹 肌
DNA 甲 基 化 芯 片 及 其 聚 类 分 析 技 术 目 前 已 经 广 泛 应 用 样 型 脑 膜 瘤(WHO3 级) 归 于 甲 基 化 中 间 型A 组MCint-A 中 。
于 高 异 质 性 胶 质 瘤 的 进 一 步 细 化 分 型 。 例 如Korshunov 具 体 内 容 见 表2 。
[22]
等 通 过 分 析DNA 甲 基 化 表 型 和 基 因 组 ， 将H3-/IDH 野 生 2 项 生 存 分 析 发 现 ， 脑 膜 瘤 的 不 同 甲 基 化 亚 型 与 患 者 预
型 儿 童 胶 质 母 细 胞 瘤(GBM) 分 为3 个 亚 型 ：MYCN 扩 增 型 、 后 密 切 相 关 ， 并 且 在 原 发 性 和 继 发 性 脑 膜 瘤 中 均 有 很 好 的 稳
[26-27]
RTK Ⅰ 型 和RTK Ⅱ 型 ， 发 现 其 预 后 均 不 同 于 成 人GBM ， 定 性 。 此 外 ， 对WHO 分 类 与 甲 基 化 分 型 不 相 符 的 病 例
MYCN 扩 增 型 患 者 的 预 后 最 差( 中 位 生 存 期14 个 月) ， 表 现 为 进 行 生 存 分 析 ， 发 现 甲 基 化 分 型 的 生 存 期 预 测 情 况 与 患 者 的
[24]
血 小 板 源 性 生 长 因 子 受 体 α(PDGFRA) 基 因 扩 增 的RTK Ⅰ 型 实 际 生 存 期 比 较 一 致 。 因 此 ， 脑 膜 瘤 的 甲 基 化 分 型 优 于
患 者 的 预 后 次 之( 中 位 生 存 期21 个 月) ， 表 现 为 表 皮 生 长 因 子 WHO 组 织 学 分 类 ， 其 能 更 准 确 地 预 判 脑 膜 瘤 的 进 展 ， 预 测 患
受 体(EGFR) 基 因 扩 增 的RTK Ⅱ 型 患 者 的 预 后 最 好( 中 位 生 者 的 生 存 情 况 。
存 期44 个 月) 。 ( 四) 髓 母 细 胞 瘤
上 皮 样 胶 质 母 细 胞 瘤(eGBM) 是 一 种 具 有 特 殊 组 织 形 态 髓 母 细 胞 瘤 是 儿 童 中 最 常 见 的CNS 恶 性 肿 瘤 ， 根 据 基
的GBM 亚 型 ， 并 非 新 的 诊 断 实 体 。 目 前 ，DNA 甲 基 化 及 其 因 表 达 谱 的 不 同 ， 被 分 为4 种 不 同 的 分 子 亚 型 ：Wnt 型 、SHH
[10]
聚 类 分 析 证 实eGBM 至 少 包 括3 种 分 子 和 生 物 学 上 的 不 同 型 、Group 3 型 和 Group 4 型 。 其 中 ，Wnt 型 预 后 最 好 ，
类 别 ：(1) 多 形 性 黄 色 星 形 细 胞 瘤(PXA) 样 肿 瘤 ， 以 儿 童 和 年 Group 3 型 预 后 最 差 ，SHH 型 与Group 4 型 预 后 类 似 。 不 同
轻 人 多 见 ，BRAF V600E 突 变 频 率 较 高 ， 预 后 良 好 ；(2)IDH 野 分 子 亚 型 所 需 的 治 疗 方 案 和 目 的 均 不 同 ， 在 有 效 治 疗 基 础
生 型GBM 样 肿 瘤 ， 多 见 于 老 年 人 ， 尽 管 常 常 也 伴 有BRAF 上 ，Wnt 型 以 减 少 治 疗 后 遗 症 为 目 的 ，Group 3 型 则 应 加 强 放
[28]
V600E 突 变 ， 但 预 后 较 差 ；(3) 小 儿RTK Ⅰ GBM 样 肿 瘤 ， 常 发 化 疗 以 延 长 患 者 的 生 存 期 。
[23]
生 于 儿 童 ， 常 有PDGFRA 扩 增 或 染 色 体 碎 裂 ， 预 后 中 等 。 既 往NanoString 检 测 技 术 被 认 为 是 髓 母 细 胞 瘤 分 子 分
因 此 ， 有 必 要 对 这 些 少 见 的 胶 质 瘤 行 全 基 因 组 甲 基 化 谱 系 分 型 检 测 的 金 标 准 ， 该 方 法 是 通 过 检 测 石 蜡 包 埋 标 本 中 特 定
[29]
析 ， 以 进 一 步 细 化 它 们 的 分 型 。 RNA 的 丰 富 程 度 来 对 样 本 进 行 分 子 分 型 。 但 近 年 来 研 究
( 三) 脑 膜 瘤 发 现 ， 髓 母 细 胞 瘤 的DNA 甲 基 化 亚 型 与 基 因 转 录 亚 型 有 着
脑 膜 瘤 按 照 组 织 学 分 型 分 为15 种 亚 型 ， 其 中 包 括9 种 高 度 的 相 关 性 ，DNA 甲 基 化 能 用 于 髓 母 细 胞 瘤 的 分 子 分 型 ，
WHO 1 级 、3 种WHO 2 级 和3 种WHO 3 级 脑 膜 瘤 。 由 于 该 并 且 由 于DNA 的 稳 定 性 高 于RNA 及 对 标 本 数 量 要 求 较 低 ，
[30]
分 型 仅 基 于 组 织 学 形 态 ， 缺 乏 特 异 性 分 子 标 志 物 ， 同 时 由 于 其 准 确 性 和 可 靠 性 甚 至 优 于NanoString 检 测 技 术 。
病 理 医 师 的 主 观 性 ， 使 得 该 分 型 和 分 级 标 准 有 时 存 在 较 大 差
[24]
异 ， 从 而 难 以 预 测 患 者 预 后 。Sahm 等 应 用450K 甲 基 化 芯 三 、DNA 甲 基 化 在 肿 瘤 病 理 诊 断 中 的 应 用
片 检 测 并 分 析 了497 例 脑 膜 瘤 和309 例 类 似 脑 膜 瘤 形 态 的 其 DNA 甲 基 化 除 了 用 于 肿 瘤 分 型 ， 还 可 以 追 踪 肿 瘤 细 胞
[31]
他 颅 外 肿 瘤 的DNA 甲 基 化 ， 将 脑 膜 瘤 分 为A 组(4 个 亚 组) 和 来 源 ， 揭 示 肿 瘤 的 组 织 来 源 信 息 ， 对 样 本 做 出 准 确 诊 断 。
B 组(2 个 亚 组)2 个 主 要 的 表 观 遗 传 学 组 别 ， 并 进 一 步 细 化 分 例 如 ， 在 一 项 包 括 全 球 多 个 中 心 共 同 应 用DNA 甲 基 化 芯 片
为 甲 基 化 良 性 型( 包 括A 组MC ben-1 、MC ben-2 和MC ben- 检 测2801 例CNS 肿 瘤 的 研 究 中( 其 几 乎 涵 盖 了 各 年 龄 阶 段
3) 、 甲 基 化 中 间 型( 包 括A 组MC int-A 和B 组MC int-B) 以 及 患 者 和 全 部 类 型 的CNS 肿 瘤) ， 通 过 机 器 学 习 程 序 获 得 的 分
[25]
甲 基 化 恶 性 型(B 组MC mal) 共6 种 甲 基 化 分 型 。Shen 等 类 器 可 以 对DNA 甲 基 化 数 据 进 行 分 型 ， 发 现 经 过 训 练 后 的
总 结 发 现 ：WHO 分 类 和 甲 基 化 分 型 部 分 匹 配 ，WHO 1 级 脑 AI 系 统 可 以 使 用DNA 甲 基 化 数 据 鉴 定 出82 种CNS 肿 瘤 和
膜 瘤 富 集 在 甲 基 化 良 性 型A 组MC ben-1~3 ，WHO 3 级 脑 膜 9 种 对 照 组 织 ； 研 究 者 们 再 用1104 例 新 样 本 验 证 了AI 系 统
瘤 富 集 在 甲 基 化 恶 性 型B 组MC mal ， 例 如 甲 基 化 良 性 型A 的 准 确 性 ， 发 现76% 的 样 本 的DNA 甲 基 化 分 型 与 其 病 理 学
组MC ben-1 以 纤 维 型 脑 膜 瘤 为 主 ， 甲 基 化 恶 性 型B 组MC 结 果 一 致 ，12% 的 样 本 结 果 不 一 致 ， 但 经 过 基 因 测 序 等 分 析
[6]
mal 主 要 为 间 变 型 脑 膜 瘤 。 然 而 ，WHO 2 级 脑 膜 瘤 却 在 所 有 后 证 实AI 系 统 诊 断 正 确 。 因 此 ，DNA 甲 基 化 结 合AI 系 统
的 甲 基 化 分 型 中 富 集 ， 使 得2 种 分 型 结 果 不 一 致 ， 例 如 非 典 分 析 可 以 提 高CNS 肿 瘤 的 诊 断 准 确 率 。
型 脑 膜 瘤 既 分 布 在 甲 基 化 中 间 型A 组MC int-A 和B 组MC DNA 甲 基 化 分 型 还 可 以 鉴 定 出 新 型 罕 见 肿 瘤 。 例 如 ，
[25]
表2 基 于DNA 甲 基 化 的 脑 膜 瘤 分 子 分 型
Tab.2 DNAmethylationbasedclassificationformeningioma(References[25])
表 观 遗 传 学 组 别 亚 型 甲 基 化 分 型 WHO 亚 型
MCben-1 良 性 型 纤 维 型 、 过 渡 型 、 砂 粒 体 型 、 非 典 型
MCben-2 良 性 型 脑 膜 上 皮 型 、 过 渡 型 、 分 泌 型
A 组
MCben-3 良 性 型 过 渡 型 、 血 管 瘤 型 、 非 典 型
MCint-A 中 间 型 纤 维 型 、 过 渡 型 、 非 典 型
MCint-B 中 间 型 非 典 型 、 间 变 型
B 组
MCmal 恶 性 型 间 变 型
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[32]
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分 子 分 型 ， 更 准 确 地 预 测 肿 瘤 生 物 学 行 为 和 生 存 预 后 ， 为 患
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者 个 体 化 治 疗 方 案 的 制 定 提 供 重 要 依 据 ； 也 能 用 于CNS 中
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不 同 类 型 肿 瘤 的 鉴 别 ， 提 高 病 理 诊 断 的 准 确 性 。 因 此 ， 当 组
prognostic factor in childhood intracranial ependymoma: a
织 形 态 学 诊 断 有 困 难 时 ， 应 考 虑 将DNA 甲 基 化 检 测 作 为 辅
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将 来 ，DNA 甲 基 化 可 能 会 成 为 一 个 有 着 统 一 标 准 的 、 全 方 位
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· 298 · 中 华 神 经 医 学 杂 志2022 年3 月 第21 卷 第3 期 ChinJNeuromed,March2022,Vol.21,No.3
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noz061.
( 本 文 编 辑 ： 刘 凯)
[28] Northcott PA, Buchhalter I, Morrissy AS, et al. The whole-
· 读 者 · 作 者 · 编 者 ·
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