关于差异性位点与重要农艺性状的关系(南北学院1)刘瑞响 原创 刘瑞响 南北学苑 2023-05-08 07:08 发表于海南各位老师大家好，
今天5月8日，由知类通达小组刘瑞响值日。同组还有潘海龙、王和明、宋炜、唐海涛、贺伟、杨铭波、陈玉魁、刘小源、张正英、时羽、李继竹、
李文举。今天跟大家交流的题目是“关于差异性位点与重要农艺性状的关系”，不当之处敬请批评指正。《国家级玉米品种审定标准（2021年修
订）》的“1.5真实性和差异性（SSR分子标记检测）”中关于差异性进行了如下规定“申请审定品种应当与已知品种DNA指纹检测差异位点
个数≥4个；申请审定品种与已知品种DNA指纹检测差异位点数=3个的，需进行田间小区种植鉴定证明有重要农艺性状差异”。那么，差异位点
数小于2个的申请审定品种与已知品种就一定没有农艺性状的差异了吗？答案当然是否定的。一方面是因为SSR40标准是基于扩增片段大小分型
，对虽然扩增片段大小没有差异但其内部序列存在SNP无法区分；另一个重要的原因就是SSR40有的位点区域本身就与重要农艺性状存在显著
关联。基于公开发表的数据，对SSR40位点与重要农艺性状之间的关系进行分析。结果发现（如图所示），14个位点与性状存在显著相关，占
总位点数的35%，其中6个位点与多个性状存在显著相关。PM10位点与轴粗、轴重、穗粗和叶宽4个性状存在相关，解释的轴粗和穗粗的表型
变异分别为3.06%和3.97%；PM18与吐丝期、散粉期和粒深3个性状存在相关，解释的粒深的表型变异2.82%；PM26与轴重、
穗行数和吐丝期3个性状存在相关；PM38与穗位高、吐丝期和散粉期3个性状存在相关；PM09与轴重和叶长2个性状存在相关，解释的表型
变异分别为2.78%和1.44%；PM23与穗位高和穗长2个性状存在相关。其他8个位点只检测到与一个性状关联，其中PM40位点与穗
位高存在显著相关，并且其解释的表型变异为8.63%。这与早期SSR标记开发是基于EST序列进行开发有关。图片?如果申请审定品种与已
知品种存在差异的位点是与农艺性状存在显著关联的位点，那么单个位点的差异就有可能出现农艺性状间的显著差异，尤其解释的表型变异比较大的
位点。比如PM40位点，如果申请审定品种与某个已知品种在PM40位点上存在差异，那么这个申请审定品种就有很大概率在穗位高上与已知品
种存在显著差异。所以，在出现申请审定品种差异位点不达标时，需要进一步明确存在差异的位点具体是哪些位点，可能在哪些性状上存在差异，重
点关注和鉴定这些性状，积极申请田间鉴定挽救自己多年的育种心血。阅读 476 |
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