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文章发现生酮饮食会加剧间歇性缺氧引起的认知行为障碍,并且该过程是由肠道菌群所介导。在生酮饮食和间歇性缺氧的双重条件下,Bilophila wadsworthia显著富集,并引起表达IFNg的Th1细胞数量增加,造成海马体功能损伤,最终引起认知行为障碍。
在微生物多样性分析的报告中主要包括五个部分:Alpha多样性分析、Beta多样性分析、物种组成分析、进化关系分析、差异分析,其中Alpha多样性分析是生态学中生物多样性的一个重要的组成部分,也是比较基础的一部分。Shannon-Wiener 曲线,是利用shannon指数来进行绘制的,反映样品中微生物多样性的指数,利用各样品的测序量在不同测序深度时的微...
——DNA 6mA甲基化修饰。看这个高大上的名字就知道这篇文章把矛头直指人类样本中6mA修饰,作者利用多种方法表征了人类基因组中6mA修饰,包括PacBio SMRT, 6mA-IP-seq, LC-MS/MS, 6mA-IP-qPCR等,可以说是第一篇paper系统地揭示了人类基因组中6mA修饰图谱。同时利用这项技术绘制了人类基因组6mA图谱,准确地重现了已知的6mA富集在活跃的逆转录转...
高血压与焦虑相互影响,如何治疗?但是有高血压但本人并不知晓的患者,抑郁障碍的发病率无明显增高,这表示高血压本身对焦虑抑郁可能并无特殊影响,影响患者情绪的原因可能只是:知道自己患有高血压以后而引起的各种负面心理反应。对单纯糖尿病患者和糖尿病合并高血压的患者进行的5年随访调查发现:糖尿病合并高血压患者的抑郁评分明显增高,提...
重要知识点!!微生物多样性分析详解。微生物多样性或者宏基因组分析中,往往有几个出现频率很高的词,比如 OTU,群落结构,alpha多样性, beta多样性。alpha多样性一般指生境内物种的多样性程度,即不侧重于比较,而只是评估生境内的多样性程度,而beta多样性侧重于对不同生境的多样性进行比较。alpha多样性有很多评估指数:observed species即...
A:差异基因富集分析(不需要表达值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有无差异,需要全部genes表达值)Mm.eg.db)#get the ENTREZID for the next analysissetwd("F:/rna_seq/data/matrix")sig.gene<-read.csv(file="DEG_treat_vs_control.csv")head(sig.gene)gene<-sig.gene[,1]head(gene)gen...
GEO芯片探针注释。页面下拉可见探针注释信息,如下:此种下载探针注释文件的好处在于,每套数据都会给定探针的注释信息,不用考虑从其他地方苦苦寻找,所以下载GEO数据的时候就可以顺便下载探针注释文件!如上就是比较常见的几款Affy芯片的探针注释包,对于后续用R进行统计分析的小伙伴来说,bioconductor中收集的各种探针注释包是个不错的选择...
ClinicalTrials.gov注册,了解一下?▌通常您所在的机构都会有自己的机构账号(有PRS账号的机构列表:https://clinicaltrials.gov/ct2/prs-orgs),那么直接联系机构管理员请求用户登录就可以啦!(点这里申请PRS管理员联系方式:https://clinicaltrials.gov/ct2/contact-org-admin)。登录以后,就会看到“快速启动导引” (Quick start guide...
美国临床试验数据库(ClinicalTrials)注册流程与填写要求临床试验注册制度,指在临床试验实施前就在公共数据库公开试验设计信息,并跟踪和报告试验结果。积极开展中医临床试验在ClinicalTrials.gov等临床试验注册机 构的规范注册,有利于中医临床试验的监督,有利于保证试验透明度,有利于提高试验结果的可信度,对于提高我国中医临床试验的整体水平...
共生的肠道微生物增加了REGIIIγ的表达,然而常规饲养的小鼠中HFD诱导的微生物群落降低了AMPs在回肠中的表达,包括REGIIIγ,这提示了区域肠道微生物对饮食调节功能的重要机制。与SIBO相关的时期创造了有利于微生物定殖的条件,这些微生物可能并不是该部位的土著(如结肠样),可能导致微生物因竞争营养而过度生长,进而干扰关键性的共生微生物...
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