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| 共 6 篇文章 |
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【代谢组学】核磁共振和质谱的优缺点—针对代谢组学研究。尽管核磁共振波谱已被用于许多具有不同可检测核的多维实验，但一维质子核磁共振仍然是最有用的技术，特别是在代谢组学研究中。二维（2D）核磁共振波谱可以用来克服质子1D核磁共振波谱中重叠共振的问题，从而比1D方法能够检测和比对更多的代谢物。上图显示了二维COSY核磁共振谱，耦合质... 阅1346 转10 评0 公众公开 20-07-13 14:50 |
【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合。这里我们采用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析（GSEA）是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。使用GSEA或OR分析的途径分析也可以通过结合代谢组学和转录组学数据来进行，好处是从这两种数据类型中收集信息以确定代谢途径富集程度。5.结合来自转录组... 阅476 转8 评0 公众公开 20-06-15 15:31 |
【代谢组学】利用多元统计从代谢组数据中提取有意义的信息。①在PCA模型中，样本之间的关系被捕获在一组得分（score）向量中（每得分向量表示一个主成分），相应的特征信息（假定的代谢物）存储在一组载荷（loading）向量中。与PCA模型相似，PLS模型分别具有表示样本和特征信息的得分向量和载荷向量。使用得分向量将样本空间中的样本可视化为二... 阅887 转14 评0 公众公开 20-05-15 18:56 |
【代谢组学】代谢组学原始数据的预处理。为什么要做数据预处理：代谢组学研究使用各种分析平台（主流是GC/LC-MS或NMR）从生物样品中提取代谢物数据。什么是数据预处理：这些通过一系列步骤（如降噪、基线校正、归一化等）转换原始数据的计算过程统称为数据预处理。不包含任何代谢数据的光谱区域也被移除以减少数据点的数量。数据中心化（Center... 阅1145 转11 评0 公众公开 20-05-14 16:04 |
【代谢组学技术】应用于代谢组学中的技术及化学计量方法。目前没有一种分析工具具备上述所有特征，但目前应用最广泛的代谢组学方法：核磁共振波谱（NMR）和质谱（MS）与气相色谱（GC）、液相色谱、（LC）或毛细管电泳（CE）联用。核磁共振波谱（NMR）应用于代谢组学，采用的是非靶向的方法，关注的是整体全局的代谢情况。代谢物注释是确定代谢... 阅231 转6 评0 公众公开 20-05-13 15:22 |
