| 共 56 篇文章 |
|
接下来对EBV基因进行筛选，从原始的88个基因中，将在超过5个样本中原始计数（raw count）为0的基因去除，剩下19个基因，这就获得了EBV相关的特征分子标志。部分EBV基因在EBV(+)样本中的表达。单因素相关分析就是要从19个EBV基因、91个人类胃癌相关的hub基因、27个基因模块和29个通路中再进一步获取相关性最高的组合，采用配对的Pearson相关性检... 阅18 转0 评0 公众公开 19-03-28 18:39 |
细胞蛋白质标记的基本原理：蛋白质的合成依赖于转运tRNA合成酶，不同的氨基酸有特定的转运tRNA合成酶。外源补充非经典的氨基酸后，待细胞利用非经典氨基酸合成新蛋白后，通过“点击化学”（Click Chemistry）的方法将含有非经典的氨基酸的蛋白质进行标记，可以分离纯化新合成的蛋白质。可以利用Cre-loxp系统，利用细胞特异的启动子驱动突变的转... 阅68 转0 评0 公众公开 19-03-28 18:36 |
新手上路，一文秒懂Blast结果图（附序列比对网址）其中，序列比对无疑是评估序列相似性的最简单方法。老实说，Blast的界面非常友好，点击相应模块后，大家只需在序列框中丢上自己的靶序列，勾选好物种基因组，点击搜索即可！如此，就可对Blast结果做到了如指掌，然而有些急性子的科研者却对Blast的运行速度有些瞧不上眼，因而又挖掘出了序列比... 阅33 转0 评0 公众公开 19-03-28 18:32 |
该篇文章介绍到登革病毒（DENV）蛋白和 GRP78蛋白在细胞内的相互作用已有报道，而 GRP78作为Hsp70的一种，和Hsp90同属于热休克蛋白家族的伴侣蛋白，因而有必要了解一下Hsp90与DENV蛋白的相互作用。所以文章中通过这个经典的实验得到Hsp90和DENV E、NS2B、NS3、NS4B、NS5在细胞内都有相互作用，但是Hsp90和DENV capsid protein的相互作用却没有... 阅32 转1 评0 公众公开 19-03-28 18:18 |
傻瓜式图文教程：Genecards基因信息检索与分析、基因结构图绘制......要研究基因功能，首当其冲的就是要全方位了解基因信息，如基因与表型间的联系、基因互作蛋白分子、信号通路、临床意义等。而Genecards数据库作为检索人类基因信息的最优解，整合了众多文献信息，覆盖了多个数据库对于基因的分析数据，囊括了基因相关的任何信息，着实是打开... 阅33 转0 评0 公众公开 19-03-28 18:17 |
城乡恶性肿瘤发病水平逐渐接近，但恶性肿瘤负担差异仍然较为明显，表现在城市恶性肿瘤发病率高于农村，而农村恶性肿瘤死亡率高于城市。从年龄分布看，恶性肿瘤的发病率和死亡率均会随年龄的增加而上升。过去的10余年里，恶性肿瘤生存率呈现逐渐上升趋势，目前我国恶性肿瘤的5年相对生存率约为40.5％，与10年前相比，我国恶性肿瘤生存率总体提高... 阅20 转0 评0 公众公开 19-03-28 18:09 |
求第二列数值的平均值，awk ''''''''{x+=$2}END{print x/NR}'''''''' file.txt#可以用来求基因长度平均值基本的sed命令。提取file.txt中 Chr1 中1MB和2MB的片段之间的行信息，假设第一列是Chr信息，第三列是位置信息：cat file.txt | awk '''''''... 阅1 转自微笑如酒 公众公开 19-03-28 17:35 |
该篇文章介绍到登革病毒（DENV）蛋白和 GRP78蛋白在细胞内的相互作用已有报道，而 GRP78作为Hsp70的一种，和Hsp90同属于热休克蛋白家族的伴侣蛋白，因而有必要了解一下Hsp90与DENV蛋白的相互作用。所以文章中通过这个经典的实验得到Hsp90和DENV E、NS2B、NS3、NS4B、NS5在细胞内都有相互作用，但是Hsp90和DENV capsid protein的相互作用却没有... 阅1 转自微笑如酒 公众公开 19-03-28 17:29 |
对全基因组关联分析（GWAS）的一些个人理解。GWAS分析是个系统工程，中间会涉及群体结构分析、连锁不平衡分析、关联分析等等。因为材料都是取自自然群体，群体间个体间的差异往往还来自其他因素，包括群体结构（例如，南方和北方人的差异）和局部的亲缘关系（例如，群体中一小撮人是来自同一个家庭）。例如，图3II群体内局部存在亲缘关系、图3I... 阅1 转自微笑如酒 公众公开 19-03-28 17:24 |
基因芯片小知识（二）另外一个选择基因的方法是Bo和Jonassen所开发的贪婪配对法方法（Greedy-pair Method）首先根据训练集算出所有基因的单个t值，并进行排序，然后找出当前首位基因gi的配对基因gj，配对标准是：两个基因在对角线判别轴上进行投影时，两组分类的质心距离最大。SVM RFE算法则会去除线性组合中权重绝对值较低的基因，并在剩余基... 阅1 转自微笑如酒 公众公开 18-03-28 16:58 |
