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一款开源交互式备忘工具，解决了你的命令行忘性烦恼！安装 navimacOS 和 Linux 用户都可以安装 navi，如果你原来就安装了 Homebrew 或者 Linuxbrew，执行如下命令就可以安装好 navi。# git clone --depth 1 http://github.com/denisidoro/navi /opt/navi# cd /opt/navi# sudo make install# install fzf: https://github.com/junegunn/fzfnavi ... 阅109 转0 评0 公众公开 20-01-25 19:11 |
分组箱形图 #预先设置好坐标轴标题、刻度标签、坐标轴线的之间的间隔；par(mgp=c(1.6,0.5,0),mar=c(4,4,1.5,1.5),xaxt=''''''''s'''''''',yaxt=''''''''s'''''''') axis(1,at=x, labels=xlab, cex.axis=0.7... 阅1522 转10 评0 公众公开 20-01-15 20:33 |
对比2015.11.1的TCGA数据，最新的TCGA数据，GOBO数据三种数据来源的CCR1，CCL23两种基因在乳腺癌病人中的生存分析。summary(BRCA.surv_rnaseq.cut)plot(BRCA.surv_rnaseq.cut, ''''''''CCL23'''''''', palette = ''''''''npg'''... 阅379 转0 评0 公众公开 19-12-26 14:56 |
学R语言的你不应该错过的一个网站。无论你是R语言初学者，还是渴望提高的进阶选手。这是一个托管利用bookdown写作的开源书籍的网站，目前已经有了18本书，涉及到R语言的方方面面。如果你只想快速的用R语言去绘制一些好看的图，那么你应该考虑下R Graphics Cookbook, 里面就是一系列的案例教学，散点图、小提琴图、箱线图，统统都有。 阅216 转4 评0 公众公开 19-12-12 12:51 |
ASCPsra: 让你的SRA下载飞起来。RR71663331.fastq.gz和SRR71663332.fastq.gz两个文件。SRA数据一键下载。从SRA下载数据，需要首先下载.sra格式的文件，然后再通过pfastq-dump(并行封装的fastq-dump)将.sra文件转换为fastq文件。产生SRR7166333.sra、SRR71663331.fastq.gz和SRR71663332.fastq.gz三个文件。针对SRA数据源，添加单端single end数... 阅1213 转8 评0 公众公开 19-12-11 10:49 |
CrIMMix R package--无监督聚类方法汇总无监督聚类方法多种多样，分析时不知从何入手？在噪声水平的影响：使用B1，B2，B3和B4基准来评估数据集噪声水平的影响，最一致的方法是SNF，MoCluster，intNMF PINSPLUS，ConsensusClustering，LRAcluster，RGCCA和mixKernel，四个基准的平均ARI均大于0.80；总之，在聚类方面，SNF、MoCluster、CIMLR、LR... 阅574 转3 评0 公众公开 19-12-07 08:54 |
ggimage开始画不会变形的图了！以前使用ggimage画图，图的长宽比不能太离谱，不然图会跟着变形。正如下面的例子：require(ggimage)imgurl <- ''''''''http://phylopic.org/assets/images/submissions/295cd9f7-eef2-441e-ba7e-40c772ca7611.256.png''''''''set.seed(123)d... 阅177 转0 评0 公众公开 19-11-28 13:22 |
加载工具包和示例数据，这里我们采用gapminder中的数据集，数据集gapminder如下，该数据集是一共6列数据：医学方已推出“实验室那些事儿”“SCI写作技巧”“文献精读与解析”“医学英语轻松学”“国自然基金申请”“临床数据挖掘”、“基因数据挖掘”、“R语言教程”、“医学统计学”、“微创动物实验培训”等多个专题课程，如需了解课程详细推... 阅178 转1 评0 公众公开 19-11-27 11:20 |
如何用ggalluvial绘制ceRNA网络图？p1<-ggplot(data = df,aes(axis1 = lncRNA,axis2 = miRNA,axis3 = mRNA, y = Freq))+ geom_alluvium(aes(fill = mRNA),width = 0.1, knot.pos = 0.1, reverse = F)p1.mytheme1<-theme_bw() + theme(panel.grid =element_blank()) + theme(panel.border = element_blank()) + theme(axis.line = element... 阅1675 转42 评0 公众公开 19-11-23 21:58 |
beanplot(height ~ voice.part, data = singer, ll = 0.04, ylim = ylim, col = c(''''''''#ffc236'''''''',''''''''#ffc236'''''''',''''''''#ffc236'... 阅1124 转6 评0 公众公开 19-11-09 22:31 |
