他的首页
他的馆藏
他的动态
馆友反馈
关于他
| 共 59 篇文章 |
|
7、A competing endogenous RNA network identifies novel mRNA, miRNA and lncRNA markers for the prognosis of diabetic pancreatic cancer.16、Genome-Wide Analysis of Prognostic lncRNAs, miRNAs, and mRNAs Forming a Competing Endogenous RNA Network in Hepatocellular Carcinoma.17、Identification of key pathways and hub genes... 阅1161 转4 评0 公众公开 19-05-08 10:42 |
科研小白专属作图神器，不会 R 语言也能做出高大上科研图。每当看见别人文章中高端大气上档次的 PPI 图、热图、富集图、韦恩图、和弦图、火山图和主成分分析图，作为不会 R 语言的科研小白，你是否也和我一样对这种提升文章质量的 Figure 望洋兴叹！除此之外，该网站还能在线做火山图和主成分分析图，回到网站首页，选择 Gene expression table... 阅519 转14 评0 公众公开 19-04-24 19:58 |
[爆炸好用神器04]-不会R语言的前提下，一网打尽芯片，测序数据分析！下面 step by step ，首先来到网页版神器的界面：K-means聚类。高颜值火山图免费领，这样的图白介素同学自己用 R做都不一定有它好看，once again，可下载高质量矢量图!WGCNA数据挖掘，说到这个白介素同学表示后悔了，昨天也提供一个在线的完成 WGCNA的网页神器（网页版超好用... 阅293 转14 评0 公众公开 19-03-15 16:54 |
#''''''''Illumina Human Methylation 450'''''''',''''''''Illumina Human Methylation 27''''''''query<- GDCquery(project = ''''''''TCGA-GBM''''... 阅1876 转39 评0 公众公开 19-02-02 18:53 |
## biomart version# 1 ENSEMBL_MART_ENSEMBL Ensembl Genes 94# 2 ENSEMBL_MART_MOUSE Mouse strains 94# 3 ENSEMBL_MART_SNP Ensembl Variation 94# 4 ENSEMBL_MART_FUNCGEN Ensembl Regulation 94.##data_2_value<- data_2$ensembl_id attr1<- c(''''''''e... 阅1698 转17 评0 公众公开 19-02-02 17:39 |
输入数据格式根据绘图需要支持两种格式，Wide format和Long format。输入数据后，必须填入的参数为X-轴类型，X-轴信息所在列名字，Y-轴信息所在列名字，点的颜色变量和大小变量，具体见下图标识 (黄色字体为对应参数，绿色为参数设置的值)或按网页提示填写即可，直接点击Plot就可以出图了。如果数据有亚组，则需同时指定横轴变量 (X-axis varia... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 19-01-20 13:35 |
计算160种免疫特征间的相关系数，聚类分析，得到5个核心模块免疫表达特征（巨噬细胞 , 免疫浸润淋巴细胞, TGF-β response , IFN-γ response, wound healing ) → 据此将TCGA中的非血液肿瘤聚成6种免疫亚型(C1-C6) → 6种免疫亚型中这5种免疫特征的分布情况。免疫应答由肿瘤细胞、免疫细胞、基质细胞中的细胞内分子网络状态和细胞外通讯网络（... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 19-01-20 13:17 |
除了单核苷酸多态、Biospecmen，其他各个类型的数据下载下来都是类似的 一个样本一个文件的样子，所以此时我们就需要将这些样本合并成矩阵，故点击“合并文件”按钮，弹出文件选择框，选择我们下载好的文件的文件夹，里面包含了一个.log结尾的文件，我们选择该log文件即可将这些样本进行合并，该log文件记录了本次下载中所有的样本的下载信息，... 阅1055 转5 评0 公众公开 19-01-14 18:04 |
国外的Excel插件-XL Toolbox，具有图表导出的功能，可以设置图表导出参数包括：“文件类型File type”、“分辨率Resolution”、“色彩空间Color space”、“透明度Transparency”（由上到下）等，尤其分辨率可以设定成96-1200DPI，还可以导出EMF格式的矢量图。(a) 如果期刊要求tiff等位图格式，单个pdf文件可以通过Adobe Illustrator、 Photosh... 阅266 转2 评0 公众公开 19-01-13 20:28 |
TCGA数据库生存分析的网页工具哪家强。xena=read.table(''''''''TCGA-LIHC.survival.tsv.gz'''''''', header = T,sep = ''''''''\t'''''''',fill = T)xena=xena[grepl(''''... 阅24 转0 评0 公众公开 19-01-13 00:01 |
