共 4 篇文章 |
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2.593分的SCI文章,教你们把miRNA、靶基因以及临床表型串联起来,就用这个电视机……这个数据库是结合到TCGA上的,所以会显示出这个miRNA在肿瘤中的表达数据:在这个基础上,对miRNA的靶基因进行分析:点击对比,就能查询这个miRNA靶基因在不同表达水平下的临床表现情况:当然,你会发现,我选的靶基因表达模式是和miRNA相反的。 阅91 转2 评0 公众公开 21-01-14 09:20 |
收藏 | 10大生存分析网页版工具。一款TCGA数据库的可视化在线网站,TCGA中包含的癌种GEPIA几乎都有,可分析mRNA、lncRNA、miRNA的数据,覆盖面广,大大方便了我们对TCGA数据库的挖掘。UALCAN数据库的生存分析也是基于TCGA数据库,数据包括mRNA和部分lncRNA.Kaplan Meier plotter 集合了GEO, EGA,TCGA数据库的生存数据,可分析乳腺癌、肺癌、... 阅13086 转169 评0 公众公开 19-09-11 17:34 |
生信学习革命| 火山图绘制工具。首先,我们要注意两个重要概念,FDR:在差异表达分析过程中,采用统计学方法对原有假设检验得到的显著性p值(p-value)进行校正,并最终采用校正后的p值,即FDR(False Discovery Rate),是表示FC是否有统计学差异的变量。所以就出现了火山图(Volcano Plot),它可以直观地展现所有基因的FDR与Fold Change之间... 阅25 转1 评0 公众公开 17-10-08 11:53 |