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进一步从细胞水平验证MALAT1通过DBC1-SIRT1-P53促进细胞增殖的功能。接下来就是验证MALAT1与DBC1结合，DBC1与SIRT1结合，SIRT1调控P53，以及MALAT1-DBC1-SIRT1-P53这条信号轴了。从明星分子lncRNA MALAT1出发，首先通过RNA pulldown和定量蛋白组学SILAC方法找到差异的127个差异蛋白，接下来根据文献报道挑选明星分子DBC1，接下来验证MALAT1通过... 阅223 转7 评0 公众公开 17-10-09 09:36 |
大家一起来学习RNA逆转录的技巧。前面我们介绍了细胞RNA的提取方法，在提取RNA之后，需要在逆转录酶的作用下将RNA逆转录生成cDNA,进而验证基因的转录水平高低。1首先将模板RNA在冰上解冻，斡旋振荡混匀，瞬时离心后，选用nanodrop进行RNA浓度测定。一般来说230nm代表有机物水平(碳水化合物)，260nm代表RNA 水平，280nm代表蛋白水平，260/230 表... 阅1496 转2 评1 公众公开 17-09-29 11:13 |
来聊一聊那些五花八门的生信数据库。从1994年开始，NAR每年都要出版分子生物学数据库特辑（database issue），收录新增的数据库、盘点旧数据库的更新状况、移除失效链接等，做个总结。比如想找个特定的疾病，就点开Human Genes and Diseases，下边还有4个子分类，其中癌症基因数据库是单独一个子类（Cancer gene databases），其他的疾病可以点... 阅36 转0 评0 公众公开 17-09-28 22:02 |
不做肿瘤研究，数据挖掘怎么发文章？文章思路：GEO中基因表达芯片数据组（GSE20680,87个CAD样本和52个正常样)(GSE20681 ,99 CAD样本和99正常样本）→CAD差异基因1208条→miR2Disease和miRTarBase预测CAD相关miRNA 5条→lncRNA Disease database预测了和CAD有关的lncRNA→预测CDKN2B-AS可能以ceRNA机制靶向GATA2, MAP1B和ARG1基因的表达→样本验... 阅196 转9 评0 公众公开 17-09-27 14:39 |
细胞转染的方法主要包括：电穿孔法、磷酸钙沉淀法、脂质体转染法、病毒介导的转染等，理想的细胞转染方法是具有高转染效率、对细胞的毒性作用小等，本文主要介绍细胞转染常用的方法-脂质体转染的原理和操作步骤等。带正电的阳离子脂质体，DNA并没有预先包埋在脂质体中，而是带负电的DNA自动结合到带正电的脂质体上，形成DNA-阳离子脂质体复合物... 阅666 转15 评0 公众公开 17-09-27 11:40 |
Single gradient，从A颜色到B颜色，一般为从最小值到最大值。3、选中三色刻度后，设置最小值、中间值、最大值的类型和颜色。另外，建议将类型都改为“数字”，好处是可以自定义最小值、中间值、最大值的数值大小。例如此处数据范围84-116，故可设置最小值为80，最大值120，中间值可设为两者的中位数100。若觉得色条长度过长，可以在选中色条进... 阅52 转0 评0 公众公开 17-09-26 20:20 |
一大波2017版NCCN全面来袭！我们“肿瘤指南者”后台专业博士团队在紧急翻译、解析新版更新内容的同时，在程序后台更改必要的逻辑流程，让使用者在指尖滑动中，已经达到与新版NCCN同步的境界！为了方便英语水平好，对NCCN有充分兴趣花力气研读的使用者，我们提供了新版NCCN的下载地址： 阅47 转0 评0 公众公开 17-09-26 11:38 |
为了研究敲减LINC00968是否能够影响非小细胞肺癌肿瘤发展进程，作者向A549、H1299细胞中转染敲减质粒LV-shLINC00968以及对照质粒LV-NC进行有效的敲减LINC00968的表达。作者向A549、H1299细胞中转染过表达质粒LV-LINC00968以及对照质粒LV-NC进行有效的提高LINC00968的表达。为了验证LINC00968是否参与调控肿瘤细胞的调亡，作者通过流式细胞术验... 阅175 转10 评0 公众公开 17-09-26 11:36 |
热点一：circRNA.CircRNA是共价封闭环的新型RNA分子，大家都知道，属于非编码RNA（详细介绍《几篇综述带你迅速入门环状RNA研究》）。长链非编码RNA（Long non-coding RNA，LncRNA）是长度大于 200个核苷酸的非编码 RNA。敲除都是很基础的用法了，如果想提升文章的深度和逼格，可以尝试一下基因敲入（Knockin），基因干扰（CRISPR/i）、基因激活... 阅22 转0 评0 公众公开 17-09-24 22:48 |
接下来点击最上面的Enzymes Noncutters，会显示所有不会切割基因编码序列的酶，这些酶都是我们可以用的，选酶的标准：要选择不能切割目的基因序列并且质粒上含有的酶，还有就是最好是实验室有的酶。确定了可以用的酶后，接下来需要确定设计引物时用的这两种酶，确定方法：这两种酶最好不要邻近，最好使用双酶切有共同buffer的酶,两个酶切位点最... 阅73 转1 评0 公众公开 17-09-21 22:32 |
