| 共 207 篇文章 |
|
RNA-seq中GO、KEGG结果图如何解读。本期咱们看看RNA-seq如何利用GO和KEGG数据库！KEGG Orthology（KO）是KEGG直系同源数据库，将各个KEGG注释系统联系在一起，将分子网络和基因组信息联系起来，根据直系同源关系，实现跨物种的基因组或转录组的功能注释。对于有参考基因组的物种，转录组测序获得的差异基因构建KEGG通路图时可以选择物种特异性... 阅1 转自ypgao 公众公开 19-09-04 12:02 |
本文将绘制静态与交互式热图，需要使用到以下R包和函数：heatmap():用于绘制简单热图的函数heatmap.2():绘制增强热图的函数d3heatmap:用于绘制交互式热图的R包ComplexHeatmap:用于绘制、注释和排列复杂热图的R&bioconductor包（非常适用于基因组数据分析）Heatmap(df, name = ''''''''mtcars''... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 19-09-03 14:11 |
一个碉堡的GEO和RNA-seq数据在线分析神器，生信so easy.看了这个界面，咱大概能猜测一下具备哪些功能，分析基因表达数据，Raw RNA-seq数据，多个基因表达数据的Meta分析，那些让不少小伙伴们为难的事，似乎它都能做到。那些年折磨白介素2同学的火山图（可根据自己喜好随意定制，已经很美了），当然啦也是可以直接下载的，反正小编同学已经够喜... 阅1 转自terminato... 公众公开 19-08-13 20:19 |
猫大客串：EMSA、ChIP和CRISPR的原理、流程及常见问题。该系统由CRISPR序列元件与Cas基因家族组成，一般Cas蛋白在识别外源DNA的原间隔序列临近基序（PAM：三碱基NGG，N为任意碱基）后，可将该序列剪切并插入到CRISPR序列前导区的下游。而范例文献中所进行CRISPR实验则是针对靶基因的上、下游分别设计了gRNA1和gRNA2，并将这两个gRNA与Cas9过表... 阅1 转自Jennymgoz... 公众公开 19-08-13 19:33 |
不懂英语，难道用气功来分析LncRNA结合蛋白么？再给你们举个例子哈，比如我要分析一下LncRNA结合的蛋白哈。主要功能就是看看有没有什么LncRNA能结合上什么蛋白，比如输入一个简单的HOTAIR：然后会告诉你大概能和什么蛋白形成结合，大概形成什么样的Network：当然反过头来也能看蛋白可以结合什么LncRNA：对于各种RNA结合蛋白，会有他们在不同数... 阅1 转自微笑如酒 公众公开 19-08-07 23:11 |
is.na(dat$OS_STATUS),]dat$OS_STATUS=as.character(dat$OS_STATUS)detach(dat)某基因突变与否也可以用来分组library(survival)length(intersect(rownames(choose_clinicaldata),rownames(mut_df)))## [1] 979dat=cbind(choose_clinicaldata[rownames(mut_df),c(''''''''OS_STATUS'''''&#... 阅1 转自Jennymgoz... 公众公开 19-08-07 22:59 |
想成为PubMed高手必会的9个技巧。举个栗子，打开Pubmed网页之后，在检索框中，输入Inflammatory bowel disease TNF后，点击“Search”或按Enter键，结果如下图所示。又或者，在Pubmed的主页面中，点击Pubmed Tools中的Single Citation Matcher，进入以下界面，输入特定的杂志、日期、作者名字（第一作者或通讯作者）即可靶向某篇特定的文章。但... 阅1 转自医学院的... 公众公开 19-08-07 22:51 |
文章用图的修改和排版（1）第三个视频是剪切蒙版的使用和针对其它不同类型图的特殊操作。2. 剪切蒙版：如果想剪切掉图中的某一部分，可以绘制一个矩形、圆形或任意不规则形状覆盖住需要保留的部分，然后同时选中这两个元素（绘制的形状框在被剪切的图之上），按右键，选择剪切蒙版，就可以完成剪切操作。而在修改图时，也可以不断的释放剪切蒙... 阅1 转自医学院的... 公众公开 19-08-07 22:49 |
【免费福利】20款科研神兵器All in one合辑（加攻略）Windows / Mac.7、Oligo：强大的引物设计先锋。Oligo是目前最好、最专业的引物设计软件，功能很强，主要功能包括普通引物对的搜索、测序引物的设计、杂交探针的设计以及评估引物对质量等。Vector NTI Advance是目前整合度最高的多功能序列分析软件包，包含了一整套数据分析和管理的工具，可... 阅1 转自微笑如酒 公众公开 19-08-07 22:43 |
科研作图从零基础到精通。零基础科研论文作图（一）基础知识，干货！零基础怎么画。科研作图专栏。本板块目前已有三位主编执掌，他们各有神技，各成一派，让人惊喜不断：首先是我们数据处理和科研作图的大神浩然童鞋，还有今年刚刚入学的精通插画的kathy小师妹，然后是PPT大神张老湿：张老湿是湖南某所神秘高校的青椒，但和浙大有莫大的渊源，... 阅1 转自石头6feix... 公众公开 19-08-07 22:41 |
