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单基因分析里最后一个能做的就是单基因的相关性分析了。多基因分析时和单基因分析的套路一样,基因表达水平的呈现,相关性分析和PCA主成分分析。一般基因2个或者3个主成分分析。针对癌症类型的研究和前面两块从基因出发,在特定的肿瘤中进行分析的思路不同,相反是从指定的某种肿瘤类型出发,找出最有意义的基因,可以是在肿瘤和正常之间存在表...
比对TCGA的癌种数据,进行分子亚型聚类分析、免疫相关的亚型分析以及泛癌研究。除了对TCGA多个肿瘤的表达、分期、预后、相关性的分析之外,此次更新还做了更多数据可视化的新尝试,进一步完善了TCGA数据的基因异构体信息、泛癌研究以及三维散点图,效果喜人。感谢以GEPIA为代表的众多生信分析平台,让处在科研金字塔底层的众多科研小白和年轻临...
A基因几乎只在乳腺表达,而且在乳腺癌中明显高表达B基因在全身广泛表达,但是表达风度不高,而在乳腺癌中表达显著提高好了页面往下拉就可以看到这个基因在多个癌症癌和癌旁的表达情况,我们可以看出他在乳腺癌中是高表达的但是在其他许多癌症中也明显差异表达,这张表不会让你漏掉其他癌症,如果恰巧实验室有人在做那个癌症,你就可以跟他合伙...
投稿心得&文献学堂目录(2018.06.19整理)文献怎么看,怎样提炼出文献的精髓思想?文献阅读好重要,可一看见文献就心慌慌?不怕不怕,都跟我们来一起读文献……发送沙龙到后台,参加每周六的线上沙龙,和赵老师、猴哥现场讨论读文献问题。文献导读。阅读入门、文献还原。genespring实操,非编码RNA,肿瘤基因组,细胞焦亡,芯片,非肿瘤方...
为了最熟悉的陌生人,整理一个使用介绍合辑目录。NCBI你真的熟悉吗?NCBI的使用介绍合辑。(GEO数据库介绍,文献分析还原具体流程,实验文章套路)
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投稿选刊心得&文献解读合辑目录(2018.03.13更新)文献导读。阅读入门、文献还原。sci-hub如果挂了,你还有神器下文献吗?(多版本Endnote软件和详细视频教程移步公众号菜单-福利活动-福利推荐领猴哥meta礼包;genespring实操,非编码RNA,肿瘤基因组,细胞焦亡,芯片,非肿瘤方向生信大数据的应用。聊聊非编码RNA在肿瘤中的经典研究思路。
miRNA数据库、预测工具、经典文献合辑。| 常用数据库汇总。预测lncRNA-miRNA结合数据库,不嫌多,不嫌多!预测miRNA靶基因互作的神器!
生物网络构建系列合辑(2018.04.15)Cytoscape, WGCNA, GWAS.生信大数据版主介绍:赵忻艺,将大数据应用于医学科研,主要包括临床医学数据的挖掘、收集、整理和利用(标准化和科学化的数据库),医学分子大数据的整理、利用及研究(基因、蛋白及代谢)。目前,已建立浙大大数据挖掘团队,旨在降低研究者学习大数据的门槛,推动大数据共享与研究...
你要的R语言处理GEO芯片数据的视频出炉啦!之前的视频假设大家有R语言基础,并不适合初学者。然后这里有一个网络视频教程,链接: 密码:ga9x 是数据分析与R语言视频教程+课件 请务必抽时间听完,一步步跟着操作学习,可以保证你R语言能入门。一般不建议初学者直接下载 史上最全R语言资料汇总链接:https://pan.baidu.com/s/1bptknXt 密码:7tmg 里...
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