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[组学时尚汇2]Webinar的魔力。最新课程有Multiple Biofluid and Tissue Types, From Sample Preparation to Analysis Strategies for Metabolomics,Quality Assurance and Quality Control in Metabolomics, Metabolomics Data Processing and Data Analysis,Introduction to Metabolomics for the Environmental Scientist,Introduction t...
[组学基础1]代谢组学原来是三兄弟啊。。。代谢组学其实是三兄弟。当今时代,组学概念层出不穷,从开始的基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学,到现代细分出来的暴露组学、食品组学、中药组学等。代谢组学是2000年代末兴起的一门学科,其主要有三个学科交叉组学,包括化学、生物信息学和生物学。代谢组学三兄弟1.所谓生物学,就是得到显著...
一张图了解代谢组学。
靶标代谢流分析&非靶标代谢流分析靶标代谢流分析。非靶标代谢流可以研究代谢流量随时间的动态变化规律,不限于特定的代谢通路,对流经代谢途径的代谢流量组进行定量分析,能够很好的解释代谢物在生物途径中何如变化,将代谢组学的研究提升到更高的水平和层次。本研究运用同位素标记技术,提出了一种新的非靶标同位素代谢分析方法(非靶标代...
代谢数据库之KEGG你所不知道的那些秘籍。来公司做代谢组学检测分析的小伙伴通常会收到差异代谢物代谢通路注释及富集分析结果,如下图代谢通路富集分析气泡图所示,如果想搞清楚某一个代谢通路的具体信息,如Tryptophan metabolism时,我们该怎么做呢?数据库配备了超过20个物种的通路,其中七种物种的通路多达100多条,人类通路集包含了800多个...
NIST数据库通常被认为是一个EI-MS数据库,但是在最新版的NIST数据库中也包含了234284张小分子化合物的ESI MS/MS质谱图,这些小分子包括代谢物的化学标准品、脂质以及生物活性肽等。因此,一些研究小组使用NIST数据库格式建立了一些小分子的数据库(https://chemdata.nist.gov/dokuwiki/doku.php?id=chemdata:start),与NIST数据库不同的是,这...
代谢组学活性筛选(metabolomics activity screen, MAS)用于发现调节表...代谢组学活性筛选(MAS)将代谢组学的数据与代谢通路以及系统生物学信息(包括蛋白组和转录组等)进行整合,筛选出一系列可以用于测试影响表型功能的小分子代谢物。但是使用代谢组学的方法来表征代谢异常的代谢物正在受到越来越多的关注,因为该方法可以广泛地对小分子...
脂质离子对的建立包含了已知脂质分子和扩展脂质分子的母离子和子离子信息,该离子列表将用于下一步的MRM分析。构建脂质分子离子对数据库:基于检测到的和预测的脂质分子的信息来构建离子对数据库,对于每一类脂质分子,使用其强度最高的母离子及其特征的子离子来构建离子对列表。重复三次进样,作者选择至少在三次进样中检测到两次的离子,以及...
如何将数据集导入MetaboAnalyst在线分析软件。MetaboAnalyst是一款操作简单且功能强大的代谢组学数据分析软件,可以进行常规的统计分析,以及代谢通路分析等。在进行统计分析时,第一步就是要将数据集导入分析软件中,虽然有示例数据可以供用户参考如何整理自己的数据集,但是在导入的过程中还是会遇到一些问题。这里根据自己使用经验,介绍以...
适用性较广的一个数据预处理软件,它可以处理市面上几乎所有常用高分辨质谱仪产生的数据,包括沃特世,安捷伦,热电等等,其中与沃特世仪器得到的原始数据兼容性最好,无需经过数据转换和加载插件。一款免费使用的网络软件,功能强大,可以进行数据预处理和数据统计分析。该软件需要使用者自己准备符合要求的数据集,不能对仪器产生的原始数据...
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