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即将所有的Contig长度相加,获得一个Contig总长度,然后将所有的Contigs按照从长到短进行排序,将Contig按照这个顺序依次相加,当相加的长度达到Contig为总长度的一半时,最后一个加上的Contig长度即为ContigN50。这个概念注意与测序的覆盖度区分,是指测序获得的序列占整个基因组的比例,也可理解为对目的基因组的覆盖程度,比如一个基因组有... 阅2481 转20 评0 公众公开 18-12-11 11:11 |
全基因组测序指南(二)基因组测序相关的论坛。基因组注释。SNP calling, genotype calling, and sample allele frequency estimation from New-Generation Sequencing data.l 网络基因组注释平台Web Apollo (http://genomearchitect.org/)l 基因组在线数据库 (http://genomesonline.org/cgi-bin/GOLD/index.cgi)l 植物基因组大小查询: http://... 阅437 转11 评0 公众公开 18-12-11 11:11 |