| 共 21 篇文章 |
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欢迎咨询小云，专业的云生信团队为您提供优质评估，关注云生信，科研不迷路先上点纯干货总结1. GO：关注功能基因集，基因集数量多，更新速度中等2. KEGG:关注功能基因集，基因集数量多，更新速度中等3. GSEA/ MSigDB:关注功能基因集，基因集数量多，更新速度快4. GeneCards：关注功能基因集，操作最简单，批量化操作弱5. DisGeNET：关注疾病相... 阅1054 转5 评0 公众公开 23-11-06 18:33 |
进入仙桃学术工具(https://www.xiantao.love/)，左侧导航栏中选择预后分析中风险因子图→上传Figure 3中Cox回归分析保存的Riskscore文件。进入仙桃学术工具(https://www.xiantao.love/)，左侧导航栏中选择预后分析中[云]预后列线图→选择胰腺癌数据集，输入临床变量以及预后焦亡基因，预测年限调整为1年、3年、5年，默认其它参，点击确认，即可... 阅120 转0 评0 公众公开 23-04-27 22:39 |
新热点：组蛋白乙酰化相关lncRNA构建肿瘤风险模型。图102构建风险评分模型。图303风险评分模型的预后能力使用单变量和多变量Cox回归分析评估独立预后模型的预后能力。本研究基于与预后相关的组蛋白乙酰化lncRNA构建了风险评分模型，采用ROC曲线、单因素分析和多因素分析验证了模型的准确性。因此，基于七种预后lncRNA的风险评分模型可以正确估... 阅59 转1 评0 公众公开 23-04-21 11:59 |
铁死亡相关lncRNAs标志物预测乳腺癌预后和免疫微环境。乳腺癌是全球女性死亡的主要原因，作为一种异质性癌症，具有相同TNM分期和免疫组化亚型的乳腺癌可能具有完全不同的预后，因此，有必要寻找乳腺癌新的预后因素和治疗靶点，以指导临床实践。结果一：训练队列和验证队列中铁死亡相关 lncRNA的预后分析（A）训练队列中风险评分的分布。ROC 曲... 阅50 转1 评0 公众公开 23-04-16 17:37 |
具体来说，推定的免疫细胞浸润的分析表明，记忆B细胞、CD8 T细胞、静止记忆CD4 T细胞、调节性T细胞（Treg）、静止（NK）细胞、M0巨噬细胞、M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、活化骨髓树突细胞（mDCs）、活化肥大细胞和中性粒细胞在高CD101组显著富集（图8D）。使用HPA数据库的基于单细胞转录组的分析显示巨噬细胞、枯否细胞、支持细胞、单核细胞、T 细... 阅628 转1 评0 公众公开 22-03-30 22:43 |
6分 细胞焦亡思路来袭！Figure 304胃癌中两种细胞焦亡调控模式的基因标签为了更好地将这些亚型应用于胃癌的临床治疗并确定每位患者的评分，作者探索了两种细胞焦亡调控模式之间的差异并确定了特定的基因特征。作者将细胞焦亡模型与其他几种预后模型比较，发现细胞焦亡模型预测 胃癌患者预后优于其他模型（图4H）。免疫激活相关细胞，如激活的T... 阅55 转3 评0 公众公开 22-03-05 16:35 |
首先，作者在mUC cohort和TCGA-BLCA cohort两个队列中分别做了DDR通路的ssGSEA分析，并根据通路的ES中位值将患者分为DSSH组（DDR通路激活水平高组）和DSSL组（DDR通路激活水平低组），在这两组中，比较临床特征、TMB、NAL以及DDR通路相关基因的突变率，结果如下：首先做了mUC队列和TCGA-BLCA队列DSSH组和DSSL组的差异表达分析，DDR相关通路、TG... 阅336 转2 评0 公众公开 22-01-08 09:06 |
细胞死亡领域缺失的一块拼图：PANoptosis细胞凋亡、铁死亡、细胞焦亡、坏死性凋亡等概念相信大家都耳熟能详，各个死亡方式的研究热度也只增不减。HighlightsIFNs与NEIs联合诱导ZBP1介导的炎症细胞死亡，PANoptosisADAR1负向调控ZBP1介导的PANoptosis阻断ADAR1活性可释放ZBP1介导的PANoptosis抑制肿瘤发生在小鼠模型中，IFN-γ KPT-330以ZBP1依... 阅3351 转26 评0 公众公开 21-12-21 13:07 |
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【0代码文章复现】乳腺癌免疫细胞浸润模式下的免疫微环境景观今天复现的是一篇来自2021.4月Front Immunol上的 7分 的文章，思路比较容易理解，流程清晰。根据ICI相关特征基因开发的基于ICI评分的单个肿瘤内的ICI模式的识别有助于解剖生物过程、临床结果、免疫细胞渗透、免疫治疗效果和遗传变异。在低ICI评分患者中发现了丰富的有效免疫细胞，这... 阅447 转6 评0 公众公开 21-11-18 19:10 |
