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DataFrame(data=tpm, columns=sample_name, index=df[''''''''Gene''''''''])18 19 def read_counts2rpkm(df, sample_name):20 result = df21 sample_reads = result.loc[:, sample_name].copy()22 gene_len = result.loc[:, [''''''''Lengt... 阅1614 转6 评0 公众公开 22-05-12 15:48 |
Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的区别1. 为什么我们要进行Normalization.RPKM法能消除基因长度和测序量差异对计算基因表达的影响，计算得到的基因表达量可直接用于比较不同样品间的基因表达差异和不同基因间表达高低的比较。RPKM的诞生是针对早期的SE测序，FPKM则是在PE测序上对RPKM的校正。同RPKM一样，TPM对基因的长度进行了校正，计算比... 阅875 转6 评0 公众公开 22-05-12 15:19 |
