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bowtie和bowtie2使用条件区别及用法 一、转录组还是基因组？/sam/bowtie2/bowtie2 -p cpu -x lambda_virus -U /sam/bowtie2/example/reads/reads_1.fq -S eg1.sam2.2针对Paired-end reads的比对。（文件的格式通常为e.g. `-1 flyA_1.fq,flyB_1.fq`）/sam/bowtie2/bowtie2 -p cpu -x lambda_virus -1 /sam/bowtie2/example/reads/reads_1.fq -2 ... 阅851 转0 评0 公众公开 19-05-29 15:51 |
CIRI安装及使用说明。CIRI 根据circRNA 连接点处的reads来识别circRNA， 在连接点处的reads 其比对情况非常特殊；上面图中的几种模型只是帮助我们理解了exonic-circRNA的检测，其实对于non-exonic circRNA（包括intronic circRNA 和 intergenic circRNA)的检测，其原理是相似的，只是综合考虑了测序读长和连接点两段序列的长度，提出几种可能... 阅1285 转9 评0 公众公开 19-05-25 22:32 |
