| 共 15 篇文章 |
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阅746 转0 评0 公众公开 20-01-30 13:54 |
RNA甲基化修饰（1）——m6A概念 | 重磅前沿。对于大热的m6A，截至2017年，全球的科学家已经鉴定了参与m6A的许多酶，包括去甲基化酶、甲基化酶和甲基化识别酶等。从图3左中我们可以看到，当从DNA→RNA过程中，腺苷酸在甲基化酶METTL3、METTL14和WTAP等作用下在第六位N发生了甲基化修饰。今天的RNA甲基化小课堂就讲到这里了，下一期我们会讲一讲... 阅449 转0 评0 公众公开 20-01-30 13:29 |
RNA甲基化修饰（2）——如何检测m6A | 重磅前沿。7. 接下来我们会对mRNA上具体区域内甲基化程度进行高级分析，从图3中我们可以发现，在mRNA的5’起始位置，以及3’终止密码子区域存在高甲基化现象。备注3：这个步骤是整个实验的难点所在，抗体免疫磁珠去抓取带有m6A的mRNA片段也是有一定效率和比例的，如果操作稍有不慎或者一些细节性的东西没... 阅442 转2 评0 公众公开 20-01-30 13:17 |
在哺乳动物中，N6-甲基腺嘌呤由甲基转移酶复合物（包括METTL3，METTL14，WTAP，KIAA1429，RBM15等）引入，由去甲基酶（FTO，ALKBH5）去除，并由N6-甲基腺嘌呤结合蛋白识别并发挥功能。在该研究中，通过序列比对，研究者发现了拟南芥中N6-甲基腺嘌呤修饰潜在的去甲基酶，并着重研究了ALKBH10B的去甲基功能及其在拟南芥生命活动中的调控作用。这... 阅1 转自二十一划... 公众公开 20-01-30 11:43 |
RNA甲基化修饰类型很多，目前最热门的有三种，分别是：m6A RNA甲基化﹑m5C RNA甲基化﹑m1A RNA甲基化。最近发表在Molecular Cell（IF：14.714）上的一篇关于m1A RNA甲基化的文章介绍到这是一类新型RNA修饰，它普遍存在于非编码RNA和mRNA中。如图 3 所示，第一步先对 mRNA 进行片段化，接下来使用带有 m6A 抗体的免疫磁珠 对发生 m6A 甲基化的 m... 阅1 转自风雨都停了 公众公开 20-01-30 11:18 |
RNA甲基化分子机制。SCARLET则是通过结合位点特异性的RNA酶H、放射标记和TLC（薄层层析）的方法，对RNA甲基化修饰进行检测，该方法是从单基因通量下检测RNA的甲基化修饰。推荐也是今年发表在cancer cell上的文章，研究者发现m6A去甲基化酶ALKBH5通过影响FOXM1的功能，在恶性胶质瘤中扮演癌基因的角色，并创造性的将近年来火热的长非编码RNA纳入... 阅1 转自微笑如酒 公众公开 19-12-22 22:30 |
TCGA中GBM的RNA-seq和甲基化数据整合分析实践。1、查找数据：下载TCGA中GBM的RNA-seq和甲基化数据。首先进入TCGA下载数据GBM的RNA-seq和甲基化数据，从下表可见GBM共有172套RNA-seq数据以及437套DNA甲基化数据，由于TCGA提供Infinium HumanMethylation27 BeadChip和Infinium HumanMethylation450 BeadChip两种芯片平台的数据，为了避免后续不同... 阅1 转自石头6feix... 公众公开 19-12-22 22:10 |
RNA甲基化修饰（m6A）研究技术及方案设计。meRIP-seq高通量测序技术的出现，能够高效精确检测全转录组不同的RNA 甲基化，是成功发现RNA 甲基化机理及功能的关键技术。MeRIP-seq 技术将甲基化DNA 免疫共沉淀(methylated DNA immunoprecipitation， MeDIP) 技术、RNA 结合蛋白免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation，RIP)技术和RNA 测序(RNA sequen... 阅1 转自心随所愿zh 公众公开 19-12-22 22:07 |
OsFIP和OsMTA2是水稻m6A甲基转移酶的两个亚基作者将水稻蛋白序列与拟南芥以及哺乳动物中m6A甲基化转移酶进行blast比对，有五个候选蛋白分别是OsMTA2 (LOC_Os02g45110)、OsFIP (LOC_Os06g27970)、OsMTA1 (LOC_Os01g16180)、OsMTA3 (LOC_Os03g05420)以及 OsMTA4 (LOC_Os10g31030)。OsFIP和OsMTA2突变体表型分析揭示OsFIP在孢子形成中的作用作者对... 阅1 转自生物_医药... 公众公开 19-12-21 20:47 |
最硬核的RNA甲基化修饰（m6A）位点预测网站——WHISTLE.1974年，m6A第一次在poly-A RNA中检测到，在过去的五十年间，已经证明了m6A的生物学意义，包括mRNA翻译的调节，热休克反应，DNA损伤反应，RNA-蛋白质相互作用和RNA稳定性调节等。那么，本期给大家介绍一个最硬核的RNA甲基化修饰（m6A）位点预测网站——WHISTLE。2. 通过整合基因表达谱... 阅1 转自生物_医药... 公众公开 19-12-21 20:32 |
