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$ fastqc -q -t 4 -o ./fastqc_result/ .fastq.gz &-t:调用核心数目-q:安静运行,运行过程中不会生成报告,在结束时将报告生成一个文件-o ../path/to/file :文件输出位置. fq.gz:输入文件,当前目录下所有名字中有“ .fq.gz ”的文件查看QC结果。do hisat2 -p 4 -x chrX_data/indexes/chrX_tran -1 chrX_data/samples/ERR${i}_chrX_1.f... 阅1772 转6 评0 公众公开 20-01-05 08:25 |
干货整理 | 转录组测序和分析,你需要知道的转录组测序及分析技术可以解决新基因的深度发掘、低丰度转录本的发现、转录图谱绘制、可变剪接的调控、代谢途径确定、基因家族鉴定及进化分析等各方面的问题;(1)lncRNA筛选与鉴定(2)cis作用靶基因预测:lncRNA的功能与其坐标临近的编码蛋白基因相关,于是将lncRNA基因临近的(上下游10k/100k)... 阅1 转自迷途的飞翔 公众公开 20-01-04 20:14 |