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| 共 16 篇文章 |
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生信漫谈02-3.用GEPIA筛选生存差异的基因。Oncomine数据可以自主下载再处理，而GEPIA只能分析数据，无法下载TCGA和GTEx的原始数据；GEPIA已经从初级版升级到GEPIA2.0，再到GEPIA2021。GEPIA数据库的主要功能单基因分析，差异分析，与肿瘤分期的相关性，生存分析和相似基因。选GEPIA2入口， 进入：在“输入基因名称”字段中输入基因符号或基因 I... 阅33 转0 评0 公众公开 24-01-12 12:33 |
介绍一个能查到菌种菌落形态和镜检照片的网站。通过点击more information可以进入看到更多的信息，包括常规的分类信息、分子信息和保藏信息等等，这些信息在其他的网站上也能找到，对于经常接触微生物的我们最有用的就是菌落和镜检信息。点开菌落信息后可以看到该菌落在血平板上的形态，以及普通显微镜下镜检的结果，能帮我们在分菌过程中判定... 阅36 转0 评0 公众公开 24-01-09 12:46 |
NAR｜深圳国家基因库/华大生命科学研究院发表空间转录组学数据共享、分析和可视化综合数据库STOmicsDB.STOmicsDB包含四个模块：资源中心模块、数据提交模块、自定义数据库模块、数据集分析与可视化模块（图1）。研究团队开发了一个空间转录组数据归档系统作为空间转录组学数据的集中存储库，允许研究人员以结构化的方式提交其研究数据和相关元... 阅23 转0 评0 公众公开 23-12-18 21:06 |
NAR｜中山大学杨建华/屈良鹄团队发表RMBase v3.0平台：解码RNA修饰图谱、机制和功能。2020年表观遗传学研究的是RNA在转录后发生的化学修饰，目前已经鉴定出了170多种RNA化学修饰，这些修饰在RNA的加工、转运、翻译和降解中具有多种调节作用。RNA修饰蛋白在肿瘤中的表达谱和突变图谱的探索RNA修饰蛋白（RMP）包括催化（Writer）、去除（Eraser）... 阅13 转0 评0 公众公开 23-12-14 20:03 |
通过人工整理超过100000篇已发表论文，4124 个条目，包括细胞标记信息、组织类型、细胞类型、肿瘤信息和来源，收集了158个人体组织、亚组织中467个细胞类型的13,605个细胞标记物和81个小鼠组织、亚组织中389个细胞类型的9,148个细胞标记物，并存放在CellMarker中。哺乳动物的着床前发育是一个复杂的过程，包括从1细胞到2细胞、2细胞到4细胞、4... 阅2032 转18 评0 公众公开 23-07-20 22:01 |
在“搜索药物”字段中，用户可以通过在DRESIS的整个文本组件中搜索药物名称，疾病名称，分子名称，耐药机制名称等来查找药物条目。“肝癌”的搜索结果显示疾病ID，疾病名称，疾病ICD，疾病类别，疾病特异性机制，代表性疾病反应药物，代表性疾病反应分子和外部按钮的信息。“PTEN”的搜索结果显示分子ID，分子名称，基因名称，基因ID，分子类型... 阅40 转0 评0 公众公开 23-07-14 08:04 |
MetaboAnalyst currently supports metabolic pathway analysis (integrating pathway enrichment analysis and pathway topology analysis) and visualization for 26 model organisms, including Human, Mouse, Rat, Cow, Chicken, Zebrafish, Arabidopsis thaliana, Rice, Drosophila, Plasmodium species, Budding yeast, E.coli., etc., w... 阅157 转0 评0 公众公开 23-05-13 10:40 |
TCGA(The Cancer Genome Atla) 网址：（https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/tcga）TCGA是由National Cancer Institute ( NCI, 美国国家癌症研究所) 和 National Human Genome Research Institute (NHGRI, 国家人类基因组研究所) 合作建立的癌症研究项目，对 20,000 多种原发性癌症进行了分子表征，并与33种癌症类型的正常... 阅2023 转11 评0 公众公开 23-05-10 17:43 |
实验结果1.949 个癌细胞系蛋白质组为了构建泛癌蛋白质组图谱，我们对来自28个组织和40多种不同遗传学和组织学类型的949个人类癌细胞系的蛋白质组进行了量化分析（图1A）用DIA-MS可设置高通量且拥有最短仪器停机时间的流程，我们通过六次重复使用DIA-MS 此流程获取每个细胞系的蛋白质组。为了研究蛋白质网络，我们在蛋白质网络背景下对药物-蛋白... 阅136 转2 评0 公众公开 22-08-25 17:31 |
研究可变剪切，浙大版数据库才是真专业，你那顶多叫瞎折腾！做科研的如何研究可变剪切呢？今天小鹿先给大家介绍个数据库，帮助大家去筛选、挖掘可变剪切，过阵子小鹿再给大家介绍一篇研究范文供大家参考学习。这个数据库是来自浙江大学医学院出品的TSVdb，主要用来分析TCGA中的可变剪切。然后就会跳出以下界面，这部分选择从不同角度进行定量，... 阅5 转0 评0 公众公开 21-01-15 14:06 |
