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| 共 138 篇文章 |
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如果大家还记得上一篇文章中的内容，目前在人类中发现的miRNA超过2000个，从理论上而言，miRNAs 总共可以抑制超过20万个mRNA，由于miRNA的下游靶基因在一定程度上具有重叠，因此目前的理论认为：超过60%的人类蛋白编码基因的3’UTR都含有miRNA结合位点。首先，含有miRNA序列的基因通过RNA聚合酶II（Pol II）进行转录，形成带有5'''... 阅1 转自医学院的... 公众公开 23-09-27 10:24 |
【科研热点】肿瘤中的miRNA（一）这些成熟的miRNAs 又分别属于4个不同的miRNA家族：miR-17家族（miR-17 和 miR-20），miR-18，miR-19家族（miR-19a 和miR-19b）及miR-92（见下图）。在非编码的转录本中，有大约40%的基因内miRNA（intragenic miRNAs）位于类内含子区域，有大约10%位于类外显子区域（注3）。在编码序列中，大多数miRNA位于内含子... 阅1 转自医学院的... 公众公开 23-09-27 10:16 |
【原创】寻找基因的CDS, 5''UTR,3''UTR及Promoter区等。由上图可知，5''''''''UTR 和3''''''''UTR虽然是基因上不被翻译的区域，但他们本身属于Exon,因此找出他们的序列很简单。看到Homosapiens low density lipoprotein receptor (LDLR), transcript va... 阅1 转自邱阳洋 公众公开 23-06-19 13:25 |
2. host gene-miRNA不同于mRNA的intronic-miRNA,一些miRNA直接由lncRNA的外显子或者内含子生成，这类lncRNA在命名时，直接命名为对应miRNA的HG（host gene），如MIR155HG（MIR155 host gene，Gene ID: 114614）、MIR17HG（miR-17-92a-1 cluster host gene，Gene ID: 407975），这类在数据库已经鉴定出lncRNA为miRNA宿主基因的，表明miRNA产生来... 阅664 转1 评0 公众公开 23-05-11 17:31 |
阅549 转0 评0 公众公开 23-04-07 12:39 |
表观转录组学。RNA甲基化转移酶，由多种蛋白亚基构成的复合物，识别靶标RNA，使其发生m6A修饰，已经明确的亚基包括METTL3， METTL14， WTAP等。目前, m6A-seq仍然是最常见的研究m6A修饰的技术，分析内容包括数据质控，比对基因组，peak calling, peak基因注释，差异peak分析，motif预测等等，大部分分析内容和chip_seq, atac_seq是重叠的，只不... 阅1 转0 评0 公众公开 23-04-07 12:36 |
（2）探针设计：须注意 1）防止探针封闭成环，2）防止错位配对，3）排除目标序列以外结合位点的，4）防止产生空间位阻，5）适当考虑AT/GC比例，6）一般EMSA探针只有几十碱基对。用放射性P32代替P31的最大的好处是探针标记只增加了1个电子（图1），对探针的化学结构与结合能力的影响可忽略不计，EMSA结果最恒定。我们比较放射性与非放射性EMSA时... 阅201 转0 评0 公众公开 23-03-31 15:45 |
2022年6月1日，南京医科大学第一附属医院胰腺中心的蒋奎荣主任医师和涂敏主治医师共同通讯在Molecular Cancer发表文章CircSTX6 promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression by sponging miR-449b-5p and interacting with CUL2，研究发现circSTX6通过circSTX6/miR-449b-5p轴和circSTX6/CUL2/HIF1A信号通路调节MYH9的表达，从而促进... 阅51 转0 评0 公众公开 23-03-24 13:57 |
miRNA的一般研究策略。要对miRNA进行研究，首先需要采用生物信息学的方法预测miRNA的靶基因位点，即被miRNA基因沉默的作用部位。（1）生物素化的miRNA pull-down（biotinylated miRNA pull-down）。通过生物素标记的合成miRNA转染细胞，孵育后裂解细胞，用链霉亲和素包被磁珠吸附筛选miRNA及其作用的mRNA。通过人工合成miRNA模拟物（miRNA mimi... 阅9 转0 评0 公众公开 23-03-24 13:47 |
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