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高通量技术在sumo化修饰蛋白组学研究中的应用与突破。高通量技术的发展为SUMO化修饰蛋白组学研究提供了强大的工具，本文将重点介绍高通量技术在SUMO化修饰蛋白组学研究中的应用与突破。通过质谱技术可以鉴定SUMO化修饰蛋白及其修饰位点，进而推断SUMO化修饰对蛋白功能的调控。（2）蛋白质芯片技术：蛋白质芯片技术能够高通量地筛选和鉴定SUMO化... 阅1 转0 评0 公众公开 24-02-29 01:42 |
为了验证MORC2是否在这两个位点被SUMO化，作者分别将K767和K827突变为不可SUMO化的残基精氨酸(R)，然后将野生型(WT)、K767R或K827R突变体Flag-MORC2与GFP-SUMO1、GFP-SUMO2或GFP-SUMO3瞬时转染到HEK293T细胞中。TRIM28作为SUMO E3连接酶参与MORC2 SUMO修饰。虽然在HEK293T细胞中Flag-MORC2与内源性CBX4相关，但Flag-CBX4的异位表达并未显著影响... 阅20 转1 评0 公众公开 24-02-29 01:41 |
【分享篇】用体外手段分析蛋白SUMO化修饰位点。哺乳动物细胞中比较常见的三种SUMO化修饰类型：SUMO1、SUMO2和SUMO3，其中SUMO2和SUMO3有96%的同源性，而SUMO1和其他两种修饰只有45%的序列同源性。此体外SUMO化检测手段可应用于任何标记蛋白和任何SUMO1，SUMO2或者SUMO3的突变体蛋白，无论它们是单独使用还是一起使用，都可以确定所给的待检产物... 阅20 转0 评0 公众公开 24-02-29 01:40 |
为确定预测的A蛋白的SUMO化位点是否为其修饰位点，分别构建Flag-A蛋白 Kaa1R、Flag-A蛋白 Kaa2R、Flag-A蛋白 2K/2R质粒（将2个赖氨酸位点单独或同时突变为精氨酸位点），在cell-2细胞中分别转染了 Flag-A蛋白或其突变体，以及Myc-SUMO-1。首先,我们利用Flag-A蛋白及3个SUMO化位点突变体的质粒,将GAL4-DBD片段插入到上述载体中,构建了 GAL4-DBD-... 阅2 转0 评0 公众公开 24-02-29 01:40 |
在哺乳动物细胞中，SUMO蛋白家族由SUMO1-4 4个成员组成，SUMO2与SUMO3具有95％的同源性，但它们与SUMO1大约只有45%的同源性。SUMO化修饰过程由4个连续的酶促反应组成[1]：SENP酶促使SUMO成熟化、E1酶激活SUMO、活化的SUMO与E2酶结合、E3酶促进SUMO与底物的结合(图1)。目前已知有6种SENPs，包括SENP1/2/3/5/6/7，SENP1/2主要解离SUMO1-3，SENP3/... 阅61 转0 评0 公众公开 24-02-29 01:29 |
Molecular Cell | 程金科组发现激活Sirt3和调控线粒体代谢的关键信号通路。Sirt3是线粒体中的一个重要的去乙酰化修饰酶，能够调控线粒体中许多代谢酶的活性，进而调控细胞线粒体的代谢。2019年7月10日，上海交通大学医学院程金科实验室在Molecular Cell杂志上发表了题为SENP1-Sirt3 Signaling Controls Mitochondrial Protein Acetylation and ... 阅1 转自生物_医药... 公众公开 24-02-10 18:16 |
作者调查了33个SUMO修饰调控基因在肺腺癌中的作用，即SUMO异构体（SUMO1，SUMO2，SUMO3，SUMO4），SUMO活化酶（SAE1，UBA2），SUMO结合酶（UBE2I），SUMO E3连接酶（BCL11A，CAPN3，CBX4，HDAC4，HDAC7，MUL1，NSMCE2，PIAS1，PIAS2，PIAS3，PIAS4，RANBP2，RANGAP1，RNF212，RWDD3，TOPORS，TRIM27，TRIM28，ZMIZ1），SUMO蛋白酶（HINT1，SENP... 阅1 转自智汇基因 公众公开 24-02-10 13:52 |
SUMO （small ubiquitin-like modifier）标签蛋白是一种小分子泛素样修饰蛋白，研究发现SUMO可以作为重组蛋白表达的融合标签和分子伴侣，不但可以进一步提高融合蛋白的表达量，且具有抗蛋白酶水解以及促进靶蛋白正确折叠，提高重组蛋白可溶性等功能。目前研究发现真核细胞中有多种SUMO蛋白， SUMO化主要修饰蛋白质的赖氨酸残基，SUMO化修饰是一... 阅1 转自friendbio 公众公开 24-02-10 13:51 |
在这29个基因中，通过使用发现的TCGA队列进行单变量Cox回归分析，发现有七个基因（AURKB、BIRC5、CDCA8、CDH1、NR1H3、PPARA和TOP2A）与肾癌的预后相关。这些发现在其他四个队列（验证TCGA队列、总TCGA队列、CPTAC队列和E-MTAB-1980队列）中得到了验证（图1B-E；在作者的研究中，作者检查了肾癌组织中SUMOylation基因的RNA表达状态，并利用三个... 阅1 转自智汇基因 公众公开 24-02-10 13:48 |
作者使用上述公式计算了TCGA队列中每个患者的风险评分。作者注意到，随着风险评分的增加，BCR患者的比例也增加（图2E），高风险组的BCR无进展生存率比低风险组在整个TCGA训练队列（图2F）、TCGA测试队列（图2G）和整个TCGA-PRAD队列（图2H）中都要差。尽管在GSE46602队列中缺乏统计学意义，但作者注意到高风险组的患者无论是在GSE70770队列（图... 阅1 转自智汇基因 公众公开 24-02-10 13:47 |
