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MethBank是一个非常全面的甲基化数据库,集成了各种物种的共有参考甲基化组(CRM),全基因组单碱基分辨率甲基化组(SRM),DNA和RNA甲基化工具(MeTools)以及表观基因组范围关联研究(EWAS),并提供了甲基化数据可视化的交互式浏览器。Pubmeth是一个整理癌症相关甲基化数据库,收集和整理了文献中与癌症相关的甲基化数据,并进行了人工校对... 阅2020 转22 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |
SurvivalMeth:甲基化预后分析专用数据库。今天介绍一个特别的甲基化数据库:SurvivalMeth。此外,SurvivalMeth不仅整合了不同的组合,包括单个DMFE、多个DMFE、SEs和临床数据,对预上传数据进行生存分析,还允许上传来自各种疾病的DMFE的定制DNA甲基化图谱进行分析。SurvivalMeth为预后DMFEs提供了全面的资源和自动化分析,包括DMFE甲基化水平... 阅83 转0 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |
DiseaseMeth通过整合包括TCGA、IHEC等公共的疾病甲基化大数据,重新识别了疾病中的异常甲基化基因,并通过人工搜索了近些年文献报道的新异常甲基化基因,32701甲基化谱样本数,88种疾病,679602对甲基化相关的疾病基因关系。返回结果根据癌症类型、基因名字、疾病甲基化水平、正常甲基化水平、P值、甲基化类型表格展示,因此我们可以看到DEFB11... 阅332 转2 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |
MethSurv:TCGA甲基化分析工具。MethSurv是一个基于CpG甲基化模式进行生存分析的网络工具,有25种不同人类癌症的7358个甲基化数据,使用了Cox比例风险模型开发了用于生存分析的交互式网络工具。Top biomarkers模块提供所选癌症类型排名靠前的生存生物标志物(结合生存分析得到的HR值及显著性P值筛选出最优的一部分甲基化CpG位点),以便于同时... 阅657 转2 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |
MethBank是一个全面的甲基化数据库,它集成了各种物种的共有参考甲基化组(CRM),全基因组单碱基分辨率甲基化组(SRM),DNA和RNA甲基化工具(MeTools)以及表观基因组范围关联研究(EWAS),并提供了甲基化数据可视化的交互式浏览器。MethBank能够系统地鉴定与年龄密切相关的甲基化位点、在不同年龄段具有恒定甲基化水平的位点、差异甲基化启... 阅381 转0 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |
Pubmeth:癌症相关甲基化数据库。Pubmeth数据库创建于2007年4月,收集和整理了文献中与癌症相关的甲基化数据,并进行了人工校对和注释,提供了一个高质量的癌症相关的发生了甲基化基因的数据库。不同癌症相关文献甲基化数量分布。另外如果在使用过程中发现PubMeth中缺少数据or您是癌症中与甲基化相关的文章的作者,但没有在PubMeth中列出or进行... 阅45 转0 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |
MethyCancer:癌症相关甲基化基因数据库。ChroView包含染色体的轮廓,包括癌症基因,甲基化相关基因和甲基化数据的统计数据。点击涉及的基因CSASP4,可获得更多详细的基因描述信息,以及DNA甲基化和CGI的可视化,基因甲基癌变类型等基因甲基化信息,并且结果可以下载。MethyCancer Searc中的所有基因都分为三类,对它们与癌症之间关系的置信度... 阅78 转0 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |
iMETHYL:DNA甲基化、 SNP和RNA_seq的多组学联合数据库。CpG_CD4T_sd,CpG_Mono_sd,CpG_Neu_sd:每个CpG位点甲基化水平的SD(标准差)。CpG_CD4T_RI,CpG_Mono_RI,CpG_Neu_RI:每个CpG位点甲基化水平的RI(参考间隔)。我们可以从iMETHYL下载一些数据集:单核细胞、CD4T和中性粒细胞的DNA甲基化摘要数据、单核苷酸变异总结数据、基因表达摘要... 阅51 转0 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |
m6A-Atlas:m6A甲基化综合型数据库。今天所介绍的m6A-Atlas是一个全面高可信度数据库,专门用于解读m6A表观遗传组,m6A-Atlas具有可靠的m 6 A位点和定量表观转录组谱的高可信度集合。C--基因表达水平:m 6 A-Atlas还为用户提供了一个交互图,以显示m 6 A位点在各种条件下所处的差异表达基因水平。与现有的转录组数据库相比,m 6 A-Atlas具有可... 阅2050 转16 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |
EWAS Data Hub:DNA甲基化芯片数据库。在过去的十年中,由于许多EWAS项目的结果,已经积累了大量的表观遗传数据,尤其是来自DNA甲基化阵列的表观遗传数据。EWAS Data Hub.这个网站能够有效减弱或去除数据间的批次效应,并且能够帮助大家进行有效数据分析,EWAS Data Hub DNA甲基化分析只是国家基因组学数据中心提供的一个数据库,里面还有更多... 阅233 转2 评0 公众公开 21-02-18 16:48 |