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在自然群落中,噬菌体进化受到细菌种群密度和多样性以及竞争相同宿主资源的其他噬菌体的影响。利用噬菌体疗法抵御病害以及通过噬菌体调节微生物群落,需要在包含生物和非生物复杂性的相关模型中研究噬菌体与细菌的相互作用,这会影响噬菌体治疗和共进化的结果。因此,研究噬菌体-细菌相互作用的概念以及噬菌体和细菌在复杂群落和自然环境中的进...
进化菌株拥有更高的适应性作者通过计算各个菌株的竞争指数对比了25个进化菌株与原始菌株在番茄植株茎内的适应性(图1)结果发现,除了c3菌株,其余进化后的菌株相比原始菌株在番茄植株茎内均具有更好的适应性,其中种群A和B中各个进化后的菌株相比其他种群中的菌株拥有相对更高的竞争指数,这可能是由于这两个种群中的菌株可以更快的积累适应性...
【LorMe周刊】关键类群:微生物群落结构和功能的驱动因素。实验证据:人类微生物组的研究提供了大量关于关键微生物类群的证据,将关键微生物类群与一系列过程联系起来,包括炎症、结肠癌、胃癌、淀粉降解和人类相关微生物类群的稳定。最近的一项研究发现,在微生物组中高度连接的低丰度关键微生物类群比所有类群的总和更能解释微生物组的组成更...
【LorMe周刊】根系分泌物中黄酮类化合物浓度的增加增强了丛枝菌根真菌与入侵植物之间的联系。根系分泌物在调节植物与AM真菌互作和形成土壤微生物群落方面起着至关重要的作用,添加根系分泌物可以显著刺激AM真菌孢子萌发和菌丝生长,根系分泌物中的次生化合物是可能显著影响AM真菌生长和定殖的关键成分。入侵植物种群根系分泌物中槲皮素含量高于...
进一步在拟南芥上分别接种单界或多界合成微生物群落,结果发现细菌群落对真菌和卵菌群落结构和多样性影响很大,且细菌群落对根源性丝状真核生物(真菌和卵菌)的防治以及植物生存十分关键。并且与MF植物相比,增加微生物群落(BFO)的复杂性可显著促进植物生长,这表明多界微生物群落有利于植物的生长(图3A)。这表明,在植物根系的多界微生物群落...
为了扩展宿主–噬菌体网络,作者在189,680个噬菌体和286,997个宿主之间进行了全基因组比对,并根据近乎精确的基因组匹配(片段长度≥1kb,同一性≥96%),产生了覆盖96%的宿主基因组和90%的噬菌体基因组的连接,大多数噬菌体与厚壁菌门和拟杆菌门有关(图1d)。DGR在有尾噬菌体目的某些科和溶原性噬菌体中非常常见,而它们在有尾噬菌体目的其他科、...
以往的几十年间,发酵主要以单菌为主导,而随着研究的深入人们发现,单菌发酵存在的功能性低、代谢负担大等弊端限制了产物的高效输出,因此利用合成菌群提高发酵效率或实现更为复杂的生物转化成为目前的研究热点之一。需要注意的是,微生物A利用底物产生的中间代谢产物能够被微生物B利用,同时微生物B无法以A的底物作为能源物质,以保证各微生...
为此,本文提出一种跨学科的研究策略来优化农业生态系统中的微生物群落功能,并通过信息学技术识别“核心微生物组”的成员和特征,利用核心微生物组成员调控动态变化的土著微生物群落,同时,结合多种跨学科方法也为提高农业生态系统的资源利用效率和植物抗逆性能力等提供了新的途径。“核心微生物组”是指可以完善植物个体水平和生态系统水平...
【LorMe周刊】菌根真菌的群落组成和生物量能否影响菌根的功能?图4 3周、6周和9周后菌根磷响应(MPR)对丛枝菌根真菌群落(FM+、CC+、AT+、GM+、RI+、MIX)的响应四、菌根生长响应与真菌群落参数的关系。同时对AM真菌群落组成和植物菌根反应进行详细的实时监测,得以深入了解植物对菌根形成的反应是如何通过真菌群落成员的特定特征来解释:它...
作者调查了自然界中常见的具有噬菌体抗性(R)和敏感性(S)细菌的群落中的噬菌体动态,并用枯草杆菌及其专性裂解噬菌体SPP1作为主要模型系统用以跟踪S和R细菌混合物中的噬菌体动力学,结果证明缺乏SPP1受体的R细胞在与S细胞共培养时被SPP1裂解,这种裂解是由附近感染细胞释放的噬菌体裂解酶触发的。正如预期的那样,噬菌体能有效地定位在S细胞表面...
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