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来源：生物谷原创 2022-11-30 10:33 在一项新的研究中，来自中国北京大学、浙江大学、复旦大学、温州医科大学和美国国家癌症研究所的研究人员在小鼠肠道中分离出了一种能够分解尼古丁的细菌。在这项新的研究中，这些作者发现某种细菌在小鼠肠道中分解尼古丁（由于被迫吸烟而摄入的），从而降低了患脂肪肝的可能性。他们发现，肠道经过消毒的小... 阅1 转自子孙满堂... 公众公开 23-11-15 11:51 |
生物信息分析：第一期 FASTQ! BAM! VCF! 傻傻分不清楚？BAM就是SAM的二进制文件。FASTQ记录的是原始序列和测序质量，BAM记录的是序列比对信息，下面介绍VCF，这是记录变异信息的文件格式。FASTQ记录原始序列和测序质量，BAM记录序列比对信息，VCF记录变异信息。4、SAM / BAM / CRAM - Mapped sequence data formats：https://gatkforums.broadi... 阅1 转自Biotechsu... 公众公开 23-03-04 17:31 |
基于这些序列，可以确定一些contig之间的顺序关系，这些先后顺序已知的contig就组成scaffold。然后将所有的contig按照长度从大到小的顺序排列，得到contig_1,contig_2,contig_3...contig_n,再将contig按照这个顺序依次相加，当相加的长度达到总长度的一半时，最后一个加上的contig的长度就是Contig N50。（理解：）如果contig1+contig2+contig3... 阅1 转自生物_医药... 公众公开 23-03-04 17:30 |
生物信息分析：从入门到精（fang）通（qi） 第0期 生信分析是个什么玩意儿？那你能跟我讲讲生信分析到底是个啥玩意儿吗？测序相当于将生命之“书”投进碎纸机，变成了一条条碎纸片段（序列打断），每个片段一般只有几百个字母。由于碎纸片段实在细碎繁多，可能遗漏某些重要片段，所以通常会把碎纸片复印（聚合酶链式反应，PCR）多份，再进行扫... 阅1 转自墨_h 公众公开 23-03-04 17:20 |
PF由许多因素引起，如肺损伤、吸烟、环境因素、药物等，这些因素导致肺泡上皮细胞的损伤，发生氧化应激、炎症反应、细胞凋亡等反应，这个阶段会释放大量的细胞因子和其他活性物质，刺激肌成纤维细胞的增殖和活化，促使肺成纤维细胞灶的形成及胶原沉积、ECM的大量合成，最终出现PF。在IPF患者肺中检测到FGF-2水平升高，在上皮细胞、内皮细胞和平... 阅1 转自Biotechsu... 公众公开 23-01-01 17:08 |
特发性肺纤维化（IPF）是一种病因不明的特别严重的肺纤维化，诊断后的平均生存期仅2.8年。成纤维细胞的增殖和激活：这些炎症细胞会产生各种细胞因子和趋化因子，这些因子会放大炎症反应并触发成纤维细胞增殖和募集。博来霉素应该是使用最多，最经典的模型药物了，它本身是一个化疗抗生素，但是在使用过程中，发现了约有10％的患者出现肺毒性，... 阅1 转自优宁维生物 公众公开 23-01-01 17:06 |
病例对照研究——请给出选择病例的标准，病例和对照的来源及确认病例和选择对照的方法，病例和对照选择原理横断面研究——给出选择标准，以及研究对象选择的来源和方法配对设计的队列研究——务必要说明暴露和非暴露组的配对标准。研究局限性的写作需要我们充分考虑潜在的偏倚或研究不准确的来源，既要讨论产生可能偏倚的方向，又要讨论可能偏... 阅1 转自阮朝阳的... 公众公开 22-11-29 13:46 |
针对这一挑战性的问题，田捷研究员团队和广东省人民医院放射科刘再毅教授、梁长虹教授团队合作，回顾分析了广东省人民医院2007-2011年间500余例进行结直肠癌手术的患者资料，利用新兴的影像组学方法，将影像特征、临床病理特征（血清标记物和临床指标）相结合，构建并验证了基于影像组学标签的结直肠癌淋巴结转移术前预测模型，用于对淋巴结转... 阅1 转自biotechsu... 公众公开 22-11-29 13:45 |
H1299细胞——研究CRISPR基因治疗癌症突变的理想工具。BCAR1基因敲除细胞系揭露BCAR1通过上调POLR2A促进肺腺癌的增殖和细胞生长。在这项研究中，研究人员探讨了BCAR1在肺腺癌增殖和细胞生长中的作用以及与BCAR1相互作用以触发肺癌细胞增殖的蛋白质网络。研究人员利用CRISPR/Cas9技术在肺腺癌细胞系（NCl-H1975和NCl-H1299）上构建BCAR1基因敲除... 阅1 转自科研小助手 公众公开 22-11-22 15:12 |
对于某些特定的亚细胞组份蛋白，例如细胞核蛋白、细胞浆蛋白、线粒体蛋白等，可以参考相关文献提取这些亚细胞组份蛋白，也可以使用试剂盒进行抽提，例如碧云天生产的细胞核蛋白与细胞浆蛋白抽提试剂盒。收集完蛋白样品后，为确保每个蛋白样品的上样量一致，需要测定每个蛋白样品的蛋白浓度。具体的转膜时间要根据目的蛋白的大小而定，目的蛋白... 阅1 转自yunshui_li 公众公开 22-11-21 13:23 |
