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比对数据库中已知结构的序列是预测未知序列三级结构的主要方法。如果发现超过100个碱基长度且有远高于40%序列相同率的匹配序列，则未知序列蛋白与该匹配序列蛋白将有非常相似的结构。这样做的一条最方便捷径是用Blast或FASTA法搜索蛋白质序列库(如SWISS-PROT、TREMBL或PIR)，然后利用诸如SRS等工具去检索任何超过25%序列相同率的匹配序列，如果... 阅1423 转17 评0 公众公开 15-10-23 18:10 |
把未知核酸序列作为查询序列，在数据库里搜索与之相似的已有序列是序列分析预测的有效手段，在上一节中已经专门介绍了序列比对和搜索的原理和技术。研究发现，序列差异较大的蛋白质序列也可能折叠成类似的三维构象，自然界里的蛋白质结构骨架的多样性远少于蛋白质序列的多样性。后者将序列“穿”入已知的各种蛋白质的折叠子骨架内，计算出未知... 阅1203 转23 评0 公众公开 15-10-23 18:08 |
