企业办公自动化系统(企业OA)与ERP、SCM、CRM等系统都是企业应用软件系统的重要组成部分，都为提升企业信息化水平、增强企业竞争力起着重要作用。但它们之间也存在着显著的差异。
最基本的，就是它们功能不同。企业办公自动化系统(企业OA)着眼于协同工作、公文处理、文档管理、行政办公等。ERP着眼于企业的销售、采购、生产、库存、财务等过程及资源控制与计划，SCM着眼于与上下游的衔接，CRM着眼于客户关系的管理，等等。
更主要的，是它们的目标不同。可以说，ERP、SCM、CRM等系统更着重于企业的具体业务过程运作，而企业办公自动化系统(企业OA)更着重于企业的管理过程。前者是通过优化业务过程的效率来提高生产效率、提高资金使用效率、加强对财、物的管理等等，后者则是通过优化管理过程来提高企业的日常办公与决策效率、提高企业反应速度、决策能力、加强管理过程的规范性。
