先说一下剧情梗概：20世纪末，拥有AI（人工智能）的机器和人类展开了一场大战，最后人类以失败告终，期间人类把天空弄得黑暗一片，处处闪电，因此也使机器无法利用太阳能作为能源，所以机器只好利用人类的生物能作为他们维持正常运作的能量。机器把人类像种庄稼一样培养在某个基地，当人类发育到一定阶段时，再把人类运载到提供机器能量的基地，但是为了蒙蔽人类的意识，机器用器件控制了人类的大脑和神经中枢，使人类产生幻觉，让人类感觉好像自己还生活在只有人类本身的正常世界中。而模拟、控制人类世界的系统就叫Matrix（即影片片名）。但是被Matrix控制的某些人类总会感觉某些地方不对劲，所以有些人觉醒了，从Matrix中回到真实世界中，他们不断去唤醒更多感觉异样的人类，而后就组建了人类基地——Zion（锡安），而同时这些人中会有一个是The One（救世主），具有超凡的能力，准备带领人类赢得战争的胜利，打败机器。可是这些都只是Matrix本身安排好的，最终救世主只能回到Source（代码源）去升级Matrix，而在Zion的人类会被机器乌贼消灭。而后救世主在Matrix中选取23人（16女7男）去重建Zion，自己就命丧黄泉。整个人类斗争的过程其实就是Matrix自我升级的过程，如此这样循环反复了五次，直到第六次，由于Oracle（先知）和Neo（尼奥）的共同努力，打破了循环，人类最终和机器和解，迎来了暂时的和平。
思想
人类有别于其他动物的最根本在于他们有思想，思想能使人类有创造力，有灵性，有自主性。影片中那些拥有了AI的机器是否也可以说他们有思想而把他们归类为类似人类的一个种群呢，把他们叫做机器人？倘若这个被承认，那么我们又有什么理由不允许机器人在这个世界上存在呢，或者说这个地球的主宰一定是人类吗？那么由此引发的法律、道德、观念的革新是巨大而且深刻的。但回过头来说如何判定一件事物有思想，据说大量的信息在一个网络中传递交流也可以有他自己的思想出现，那么如何定义思想？
Matrix
<> Matrix翻译过来是矩阵或者母体，众所周知矩阵是线性代数中一个最基本的概念，它也是数学理念中的一个基本概念，这也很好地解释了代码制造世界的数学逻辑基础。而Matrix本身也是有实体的，人类的身体被放在一个盛满营养液的器皿中，身上插满了各种插头以接受电脑系统的感官刺激信号，因此Matrix也好像母体养育着人类。
存在Matrix中的人类所感知的世界是虚拟的，不真实的，它是由Matrix控制的。由此影片抛出了一个哲学中最最基本的概念：存在或虚妄，也就是说我们眼前所看到，听到，闻到，嗅到的东西它是否真的存在，还只是我们脑中一个虚妄的影射。当我们政治哲学书上还在拼命地辩解是物质决定意识，而不是意识决定物质时，我想他们忽略了这个讨论的基础，即物质是否真的存在？早在N年前的笛卡尔先生就假设过，可能有一个骗术高超的骗子魔鬼以连续不断的幻景在把不真实的事物呈现给我们的感官。无论这个假设听起来有多么的荒谬，但是你也无法否认它确实有可能。这里顺便推荐本书，罗素写的那本著名的《哲学问题》，这本书的好处在于字少而且易懂，不学哲学的我们也可以把它当作常识来了解，书中对存在的问题作了更深一步的讨论，这里不赘述。
但有些人会反思：存在Matrix中的人类所认知的世界和存在于Zion真实世界中人类所认知的世界都是由人类本身的大脑所产生的影射，只不过信息来源不同，这样又如何把Matrix中的世界认为是虚妄不真实的呢？还有一种反驳：就算物质真的不存在或者和我们所感知的不一样，但是科学可以利用人类感知的世界来创造出物理规律和知识体系，反过来这些东西仍旧能适用于所谓的真正真实的世界。这种观点可以这样解释：真实存在的物质世界是一种体系，而我们所感知的世界又是一个另外的体系，但是科学做了一个很好的翻译工作，它使我们从感知世界中得出的结论仍旧适用真实世界中。我用信号的调制与解调这么比喻：真实的世界就好像原信号，而我们感知的世界就好像被调制后的信号，而科学的作用在于解调，可能科学越发达信号的失真度越小吧。所以科学不管真实的世界是怎么样的，它只管它所得出的结论是否适用，对眼前这见事物究竟是否存在这些个貌似傻逼的问题不感兴趣。而哲学不同，它要刨根问底，对一切可以怀疑的东西产生怀疑，它只提出问题，讨论问题，而不解决问题，这也是它和科学的区别，这也是哲学的魅力所在，即思辩之美。
在Matrix创建的过程中，它也经历了很多坎坷。第一代的Matrix设计的非常完美，天衣无缝，毫无瑕疵，人类都生活在美好的世界中，可是这样的设计没过多久就使系统崩溃。后来Architect(设计师）找到了原因：是人类本身的不完美性决定了这样的Matrix系统不能成功。这里影片又提出了导演关于人类社会制度的思考：法律体系的设立应该从人类的性善论出发还是从性恶论出发。从第一代Matrix系统的毁灭我们也可以肯定由于人性的不完美导致了共产主义的无法实现。设计师吸取教训，第二代的Matrix充分考虑了人类的历史，也充分体现了人性的丑陋面，但是同样的是失败了。第三代的Matrix……（见设计师和先知部分）
