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自成奔至紫荆关，遣降贼将唐通守之。通复降于清师。自成复至陕西，部署残兵，尚余五十万。而清师三千卒至。自成曰：“来何神也。”遂发兵围之。三日夜人马寂然。自成不敢击，欲伺其动静，方剿灭之。而清兵复至，三千骑从中奋起，金鼓齐鸣，左右冲突，内外夹攻。自成复大奔。追至黄州，自成单骑先奔，及通城九宫山，乡寨王氏兄弟击杀之。时自成余众尚三十万，锦代领之，与自成妻高氏、氏弟一功并左营郝永忠等渡洞庭，窜踞山寨。吉翔招之，不从。而督师何腾蛟与堵胤锡往抚，乃受封号。封锦为左军侯，挂龙虎将军印，赐名赤心；高一功右军侯，赐名必正。其他部将皆通侯，号忠贞营。并封高氏贞淑夫人。颁敕谕云：“朕念赤心昔日托身非所，乃今翻然悔悟，竭奉中兴。虽名臣必待真主，亦赖其有贤母而端慈训也。据督抚连章报其至诚归戴，已挂印封侯。俟朕驻跸武昌，然后面锡铁券，再允督抚之奏，钦旌母德之贞。尔以善教为慈，赤心以遵母为孝，慈孝既萃于尔门，忠义必恒于功业。特赐尔封，给与恩诏。仍著有司竖坊，敕文用淑赞中兴，朝廷风标万方，尔门芳留百世。皇后闻之，再三嘉叹，面请加恩。赐尔珠冠一顶，表里四疋。令闻远被，以显恩纶。尔高氏当时以大义训赤心，俾其一德明良于终始。全恢江省，立复金陵，一统功成，尔子拜爵于奉天殿，尔身奉恩于坤宁宫。史册昭然，岂不伟欤！尔母子其钦承朕命。”时楚督何腾蛟疏：“闻闯贼既灭，其党郝摇旗有指示之功。”故特赐郝名曰永忠。
时严州告急，三衢震惊，督辅黄鸣俊具疏入告。特敕行在兵部连发兵三千，应援衢州。
敕处州道臣董振秀以丽水、青田、缙云、宣平、景宁五县饷银给勋臣刘孔昭，以龙泉、遂昌、松阳、庆元、云和五县饷银给杨文骢。时二臣互有争执。复手谕之曰：“师饱在饷，师克在和。与其同饷而涉于争，不如分饷而归于和。今复两臣同心协复，勿再争竞。近闻年荒饷急，民困难支，仍将民粮分限催征，以息民力。两臣亦不许差人至县，辱官虐民。违者该管官具疏参奏。”
金衢道臣疏陈衢州士民惊窜，库藏空虚，藩宗乌合之兵盘踞于内，淳遂鸱张之寇蹂躏于外。如此艰危，速宜救援。乃敕都督同知施福提兵出关，以壮声势。
归化县复征十七年已免之粮，以备王师。诏禁止之。
谕兵部尚书郭必昌曰：“朕自登极以来，诸臣未有催发事件者，今始于卿见之。具见慎重关切，朕心嘉悦。每日文书甚多，俱经朕之手眼方行。此后卿部凡有要紧本章，即于封上搭一红签，上书六字曰‘要本乞速批行’，庶即先批发。以后卿切记着。”
兵部尚书朱大典拥重兵于金华，与方国安势不相下。帝敕其协心和气，共济时艰。至是赍和本至，乃加阁衔。大典疏辞，帝谕之曰：“卿忠勤干济，劳苦功高（校者案：《大纪》此下有“在辅臣振飞，固有同心”语）。朕衷实切眷倚，宜祗承明命，以慰朕远怀。”大典因疏荐使臣兵科给事刘中藻思苦虑深，学纯力定。帝召对，称旨。
松江捷书至。赐督臣荆本彻、镇臣黄斌卿、张名振各银二十四两、表里四端，以示激劝。余将帅各升级有差。
命户科给事李日炜督催汀、邵、惠、潮四府粮饷。其借助过者，准作三年预征。
帝欲不次用人。镇江诸生钱邦芑者，芝龙门下也，召对中旨，擢为监察御史。熊开元执不可。不听。已而邦芑论开元。开元辞去。
中旨以王期为总督，彭遇觊为佥都御史。路振飞、曾樱封还内降。帝曰：“方今多事，用人必欲循调，非休休之度。”振飞言：“遇凯新进士，降贼西南。乞怜马士英，巡抚浙江，搜括民财，至于激变。期升在太湖，奉剑州知州朱盛征，始称通城王，继称皇帝。卖官夺女，两山百姓不容。故尔逃来，非臣等之私隙也。”帝乃罢二人。
先是，建宁行在即巡方署，阁臣蒋所营也。以湫隘喧哗，屡形责让，乃于三月初一日移驻城外伽蓝。初六日，登舟。十一日，抵延平，以府署为行宫。
兵侍东阁陈洪谧在籍。遣内官邓金趣之，不至。
马金岭兵变。命路振飞至浦城告抚。
广东布政使汤来贺运粤饷十万，由海道至，擢兵部右侍郎，督师江右。御史艾南英言：“来贺奸忄佥小人。周钟自北逃回，来贺匿之扬署。其解饷之任，指挥僚佐所优为，岂曰能贤？遽膺显擢，何以示后？”不听。
敕黄斌卿曰：“卿孤军久处舟山，援饷不继，朕每以为念。今得张名振资助万金，克复苏、松可望。其大鸟镜、硝磺、枪刀、铅弹等项，一并给发。”
郑芝龙进浙江（校者案：《大纪》作“浙直”）水陆图。帝曰：“观斯图，备悉奇正之著。五路并出，与合太湖义兵为策应，使西兴将士为我出力，俱是全著急务。卿其速规进取，毋但仅托条陈。”
总兵胡来贡纵兵抄粮焚劫，特诏禁之。
敕朱成功招置郑彩逃兵，毋得令其惊扰地方百姓。
下游巡抚吴之屏疏陈时事孔亟，内防宜周。帝曰：“泉州新旧兵额一千一百余名，岁需饷银七千余两。除绅衿每田一顷助银一钱及典铺、车铺、湾（校者案：《大纪》“澳”）船、海船资助外，可足岁支之额。足见尔用心料理。务使兵民相安为要。”
谕唐、邓二王曰：“京中民情安堵，市肆不迁，朕心慰悦，亲征原以安民。闽都根本重地，王等还多方晓榆，禁戢逃兵。朕若早觐孝陵，自有蠲免恩诏。”
帝将取道于汀。饷部侍郎李长倩以汀属空虚，请留饷三万，以训练土著而备缓急。帝可其议。楚兵复霄粤饷，以前十万两不足用。李长倩以为言。帝云：“留饷已有前旨。该镇共事一方，著与通融接济。俟朕至军前，再行酌处，毋得纷争。”
谕大学士熊开元曰：“卿以聪敏执持，受知简用。朕昔不以人言而用，今岂以人言而舍？著调理安痊日，即来行在办事。马借人乘，尚为厚谊。岂君臣之际任重纶扉，何必缴进？著留为病愈入朝之用。”
敕浙东巡按御史郭贞一赈恤驿递曰：“祖制，地方设立驿递，原为上下通达道路，流贯血脉，事关非细。近日文武诸臣忠上之心既微，恤民之念更短，累我百姓，苦窜驿官。先帝屡下明禁，诸臣欺蔽相仍。今日残疆，驿骚尤甚，朕所痛恨。温、处、衢之免应副，已奉明旨。其金、严、绍、宁、台五府，所当一体恩恤。非是紧急军机，一切不许应副。如有抗旨害民，三尺俱在。该抚恪体，以苏吾民。”
马士英叩关来朝。先是，曹学以罪辅不可入关揭士英，故帝数其罪，不许，谕守关官兵毋纳士英。士英前后七疏，列件自理。帝命付史馆存案，以俟公论。
监国鲁王遣柯夏卿、曹惟才来聘。帝加夏卿兵部尚书，惟才光禄寺少卿。手敕谕监国曰：“朕无子。王为皇太侄。同心戮力，共拜孝陵。朕有天下，终致于王。取浙东所用职官，同列朝籍，不分彼此。”寻遣佥都御史陆清源解饷十万给东浙。清源散饷不平，兵哗而遁。或曰士英唆方国安斩之。
左都督杨鼎卿固却鲁藩令印，王手敕嘉之曰：“若鼎卿者，可谓忠荩能明大义矣。朕与鲁王，原无嫌疑，前付柯、曹二使臣启答王书，或未之见乎？”
谕左都御史熊开元曰：“宣德达情，全藉巡方御史。近来积弊因仍，贪者工攫取，傲者喜逢迎，以致民穷无告，盗贼繁兴。殊可痛恨。卿还严访详谕，务令激扬得法，吏畏民怀。有不称职的，即参来重处。”特设建言簿以壮敢言者之气。从开元请也。
广西抚按报一僧自称弘光，谓黄得功营所获者，非真也。帝召九卿科道议迎请。群臣曰：“即真弘光，甫经失国，有遵奉而无迎请。”抚按续报，有侍弘光者验之，果伪。下狱究之，妄人假托以惑众耳。即时处决。
十四日，清师下吉安，又下抚州。初，汀、韶间有大帽山，洞蛮强甚，屡征不伏。永宁王诱之出降，遂与清师屡战屡捷，因复抚州。清师围抚，郑彩屯广信，永宁请救。其监军给事中张家玉以三营往，抚围暂解。已而复合。彩遂弃广信入关。抚州复陷，永宁王死之。洞蛮亦散。帝削彩爵，戴罪立功。
楚督何腾蛟遣长沙知府周二南诱降李贼余众四十八部。二南中流矢死。贼帅欲得腾蛟亲至乃降，腾蛟即往，贼帅皆惊喜下拜，至军前听用。一时骤增兵马数万。帝喜，告太庙。封腾蛟为定兴侯兼东阁大学士，降帅皆授总兵。而长沙饷缺，降者稍稍解体，贼帅袁宗第及田、高诸部掠舟而去，独郝永忠、王进才留麾下。
有泉人蔡鼎者，多言，李密疏荐为前知。召至，以方外服见，封国师。然所言庸鄙，试以占策，亦无验。彩既败回，鼎请自试。一战而蹶，逃回。帝谓国家元气之削，由于靖难。命礼臣追复建文帝年号，忠臣方孝孺祠设姚广孝像，跪于阶下。
自吉安失守，督师万元吉、都宪陈赓、兵曹王其宦议列栅守张家渡。而溃兵势不可止。陈赓收散亡入赣，万元吉退守皂口，惟安远江起龙兵三百人。时苏观生以阁部督师于赣，同乡李陈玉、杨仁愿、丘埙、杨文荐、范六吉、周待诏、刘李矿皆请发师援皂口，观生发新威营二百人。元吉以监纪程亮督之，下守端津滩。楚帅曹志建以二千人至，一夕即噪而去。
四月初一日，关警频传，人心惑乱。敕唐、邓二王力行保甲法，以固根本地方。
太仆寺少卿凌超疏陈“急做实做，不出‘君谋臣断’四字”。帝称其要言不烦，下部议之。
兵部主事张俨上《定庙算而后动疏》，帝览之，叹曰：“此疏洞晰军国事机，朕三复之，不忍释手。行在该部，其力行之。”
滇抚吴兆元疏辞敕书印剑。帝谕其加意料理，曰：“卿久抚滇疆，弘宣猷绩。正资善后，毋贻朕南顾忧。扫除沐天波，业有成命。不准辞。务令南人不反，以成一统丰功。朕复另有酬叙。”
谕德兴王由兮（校者案：《大纪》作“枵”）曰：“江民苦兵，甘为夷用，情罪可原。赦过之条，已括于‘有发为义民、无发为难民’十字中。”
敕谕阁部诸臣曰：“国家虽当抢攘，乃文事武备，两难偏废。近据两广、云、贵俱已开科，岂福京八府劝进全节、守关措饷之人不在大比之例？江浙绅衿向风，尤不可不俯答其望（校者案：《大纪》此：下有“宜定五月内，阁中乡试，浙东附试另卷，以便各省同来会试”等语），行在礼科确议奏行。”
先是，靖庶颁伪诏至贵州，巡抚范矿固却之，且厉兵固圉。至是，矿进拱戴疏。帝以其忠义，加右都督。
黄斌卿久托舟山，未有寸功，虚糜廪饷，乃削伯爵。
鲁监国以公爵封芝龙兄弟，遣左军都督裘兆锦、行人林必达奉命而来。帝以其惑众欺侮，兼以芝龙兄弟愧愤不出，谕令囚之，以候常朝日面质。后兆锦以金赎刑，必达亦复原官。
谕辅臣黄景曰：“福京讹传惊避，溃兵窜逸，山寇乘机抄掠。兵单饷绌。根本之地，动摇如此，深为可忧。所议归并事权，以宪臣兼制二抚及兵道移驻福清等事，卿其确议力行之。”
答谕吏部主事郑赓唐曰：“朕独居不御酒肉，力行已久，岂为难事？若王言屡易，时势使然，朕岂得已哉？至求治过速，止为心切觐陵。尔言言药石，远识深心，朕心嘉悦。”
谓侍臣曰：“近日两京覆后，武臣冒滥骄贪已极。怯御夷而勇杀民，巧凌蹿而无法纪。何能破其积习？”
初五日，帝诞辰，诸臣先一日请贺。帝不受，曰：“朕奉大统，已近十月。孝陵不见，百姓不安。文因循于内，武扰害于外。中兴事业，茫无端绪。蔬菜自勉，岂可晏然自居以听群工庆祝耶？惟于行在所总用太牢一分，遥祭二祖列宗，唐国祖宗另设于旁。”
清师逼崇安。帝敕施福速统兵出关驱剿，命辅臣蒋德督之。福顾迁延，德复疏趣之。帝叹曰：“如此情景，与郑彩进关、张家玉守新城何异乎？”
工部尚书郑为国姓成功请发鸟铳，帝曰：“国姓图功，虽是急务，御营兵器关朕躬命身，鸟铳岂可全发？如此等事，该部以司空大臣全无执裁，惟请朕躬为推卸之地，郑何无骨力至此！姑且不究。”
郑芝龙疏陈闽省守关兵饷器械衣甲，共用银一百五十六万。帝谕之曰：“卿兄弟纯忠大节，拥戴朕躬。中兴大事，非卿谁托？据奏即竭三省之物力，亦不能不穷于接济。地方钱粮，只有此数。若不内外兼顾，剿守并行，大害大祸必然飙至，中兴事业必不忍言。从未有藩篱不顾（校者案：《大纪》作“固”）、止靠家门堵贼者。此理至明，不待再计也。前卿两次议奏用兵四万，犹恐用饷难继。今必先议守，后议兵，以三万守关口，一万守腹里。此数之外，再不可增。若持议不决，旷延时日，即朕自误高皇也。卿当遵依，以全守关之事。若复再有争执，再有推卸，是彼苍不欲中兴，朕亦只有避贤路而已。”（校者案：《大纪》此下尚有“分配兵饷，和盘打算”等十数语）。
是月六日，清师至皂口。新威营先溃，江兵次之。万元吉亦遂入赣。赣城民仓皇争窜，元吉欲杀其妾之出署者，人心乃定。十一日，杨文荐自任城守。命中书康范生乞师于南雄。旧赣督李永茂遣副将吴之蕃、游击张国祚率兵五千人至。十四日，清师临赣。苏观生率所部退守南康。滇粤诸军先后至南康者以数万计，皆惴惴莫敢下。二十九日，阁部杨廷麟自雩都力促新抚阎总及张安各营兵四万余至赣。江抚刘广胤自宁都召募二千人亦至。然皆未敢逆战。
帝命建祠祀江西死难曾亨应、黄端伯、萧汉、李大觉，名曰四忠。以曾筠、徐蜚英配享。时有王锡者，亦同死难。并敕礼部予谥以表之。
处州府贡生李瑞庚（校者案：《大纪》作“唐”）疏陈恢剿三策、治安五要。帝览其疏曰：“以捣淮为恢金陵、复江浙之神著，以出兵九江为破南昌、固岭南之急著，以奇兵袭江口、以偏师复徽为上下应援之紧著，三策俱说得是。治安五要，于养民、任贤、生财节用、奖廉惩贪诸务，深明洞晓，应是通才学古”（校者案：《大纪》作“学古通才”）。
敕谕杨文骢曰：“大明宝祚，启自太祖，两遭覆陷。凡为太祖亲孙，有能攘臂先立，则太祖神灵有依，大明国祚斯立。朕与鲁王，大义正在于先后，名分尤在于叔侄。鲁王先立，朕虽叔辈，断当北面鲁王，以存太祖。若复后立，是名为争。总一立也，先立以存太祖为孝，后立以坏祖宗为不孝。今朕先监国登极四十日，在万古自有至公，岂今日一二佞舌可以颠倒？杨文骢受知最早，杀苏寇以明大义，劝鲁藩而笃尊亲，本末甚明。人言虽如其面，朕心自有鉴裁。所进陈函辉启稿，不堪一笑，鬼蜮满纸，宜靖夷侯参奏以为食肉寝皮之可恨也。朕爱侄王，万不得已，业允勋镇所请，以明太祖大法。该督尚慎终如始，善保地方，善行宣抚。得觐孝陵，朕必不负元功”。
赠松江死难原任长乐令夏允彝右春坊右中允，给祭葬，谥文忠。
帝览户科给事黄周星疏，曰：“奏内三寒心处，真可寒心。盗贼公行，民生凋敝，兵将退缩，左藏罄悬，罪訾蜩沸，角户分门，全不以国恤为念者，大小文武诸臣之罪也。政教不行，威令不信，举措刑罚失中，廷议纷纭狡窃者，是则朕躬之过也。从今君务改弦，臣亦须猛省”。
敕谕御营内阁传示臣民曰：“臣民拥立朕躬，朕志誓救民雪祖。外（校者案：《大纪》作“逆”）寇虽狂，尚可暂守而养战锐。诸臣议论纷纭，殊为道旁筑舍。今征士蔡鼎回报关上情形甚确。国姓成功巡关回来，迎驾暂至邵武，相机出关。二十八日之行且止。总之，自古创业中兴，谁不危而后济？朕惟以宁进死不退生六字自誓，并以六字察验臣工。此后除战守驻跸一听条陈外，若有敢请驾回天兴并请退避广东者，诸臣必从重议罢，余必立斩以徇。朕心通于上帝，臣民仰体钦承。”
副都御史荆本彻疏请小踞（校者案：《大纪》作“船”）可资战胜。帝谕以闽中方用水师，览此奏诚为要著。下部议之。
闽县、侯官县耆老诣延津请驾回福京。帝感叹曰：“即位十有一月，无时不思靖祖救民。飞跸既久，岂得回銮？固知入虔岚险艰辛之状，但恨在闽不能安闽，闽民不负朕，朕负闽实多矣。”
建宁诸生请驾再临建水。帝曰：“朕进取之念，甚坚甚切，万无转跸之理。但谓农家力作，征役宜宽，朕亦耿耿于中。”
敕于华玉迎驾兵须严加约束，曰：“朕之焦劳日夜，誓救汤火之民。于华玉豪爽忠敏，才敌万夫，受朕深知重倚。必要严约兵将，令民间草木不惊，方为扈驾时雨之师。”
江抚刘广胤以行宫刻期告竣，疏请驾临。帝答之曰：“朕跸位（校者案：《大纪》作“驻跸”）虔南，收复江右，即移师入北，庙谟久定矣。只以闽省三关严商守御，乃尔耽延时日。太庙奉先，肃修备举，诸臣分任功次，俟到日议酬。”
礼部右侍郎曹学疏陈驾驻延津，所有关切四事：一浚延河堤防，一汰随征冗役，一通福京米船，一事例银两许以生铁准债。帝嘉纳之。
谕户部侍郎梁应奇曰：“览尔所陈祛衙蠹、清隐匿、革火耗、禁牌票、去飞诡、除陪税六事，皆去其害足以裕国者。着逐款力行，遍为严饬。有踵前弊者，监司守令府佐立行纠参，以副委任至意。”
上游巡抚吴闻礼纠内臣戴照贪婪蔑法。帝命辅臣黄鸣复先行提问后奏。
命兵部多给奖功释罪榜文，星驰军前宣布。
敕顺德知县蔡楠曰：“顺德系东粤巨邑，地方多故，亟当轸恤民隐，加意抚绥。况履残酷之后，倍宜施恩者乎？惠良兴治，以俟报绩。”
礼科给事龚善选进大势攸归疏，有曰：“楚留辰州，蜀留遵义，江留赣州、南安，浙留金华、温州。信天意之有归，人心之有待者乎？”帝然之。
嘉兴起义旧冢臣徐石麟殉难死，其子尔谷疏称先臣起义独先，殉难独苦。帝伤悼之，官尔谷为中书。敕再从厚加恤，与同难侯峒曾一体。
礼部主事吴峦（校者案：《大纪》作“吴钟峦”）请首克南昌，选锋锐进，最为上策。倘舍此他图，关门一有骚动，全闽震惊矣。往虔非时，且人力舟车俱有未便。帝然之。谕饷部侍郎李长倩曰：“大师飞挽方亟，中兴事业尤仗转输。该部一力担承，以副倚畀至意。”
江督万元吉、御史黄赓（校者案：《大纪》作“黄广”）疏请再召滇黔兵马，以图恢复。帝曰：“东南只此幅员，生民只此膏血。不难于调兵，难于措饷。虽土司官兵忠义勇敢，必先议饷银出于何处，然后召兵不难也。”
工部左侍郎葛寅亮疏言务去饰治繁文，必收近取实局。帝目为“老成格言，朕当书铭座右”。
敕督辅苏观生曰：“自卿行后，朕拟即幸虔州，以慰待。奈闽、浙士民恋恋难释，不得不少为迟留，安此赤子。迎驾各兵，卿暂令其并力齐心，克复湖东。清道之功，与扈跸等。至措饷艰难，卿所久知。切戒以兵无扰民，勇必堪战，勿致虚耗粮糗。湖西正在战守，著于梁应奇饷内发三万两接济。”
郑芝龙于泉州建寺，名曰报恩。帝赐名敕建报恩禅寺，僧官赡田，俱如议遴选置买，以永梵修。
江南布衣翟翠疏进直言。帝曰：“此疏于古今得失之局，亦有所窥。至规切朕躬处，言言药石，诚可嘉尚。准随便候对。”
谕兵部侍郎于华玉曰：“朕痛两京继覆（校者案：《大纪》此下有“全非夷寇之能”句），止因兵民扛恨，致危宗社。今日仅有弹丸，资此民生，以期恢复一统。若复伤民，即促国脉。卿宜仰体朕意，实令民安。新兵哗噪扰民，乃未经节制者，卿当亟振刷陋规，毋徒忧畏谗谤。”
谕户部曰：“纳贡事例，原非得已。大县量准四名，中县三名，小县二名，不得滥收，事平即止。”
时清师逼湖东，乱民逃窜。有致恨于政令不一者。帝敕揭重熙与辅臣傅冠同事，何三省与督臣汤来贺同事，诚恐权任太分，翻多掣肘，号令重出，莫知适从也。
衢、广警报狎至。御史郑耀星疏陈诸臣虚声多，实际少。帝深以为然，曰：“尔既知之，自当力挽之，毋仅托空谈可也。”
谕兵部尚书吕大器曰：“卿所言用人太滥，所用之人又转相援引，虐民丛盗。望治何由？所见甚是。朕自今当急省改。”
谕辅臣曰：“朕为天下臣（校者案：《大纪》作“生”）民之主，未能拯救苍生，心实恻（校者案：《大纪》作“歉”）然。况可令官兵肆虐，小民受害乎？闻沿途阎兵抢掠终日，所议招抚，是为何用？还着该督抚各官申严约束，毋得任其骄纵害民。”
御史朱盛浓疏请实行训练兵卒。帝曰：“兵宜练，必练心，练胆，练力，练气，练忠义，方成劲旅。不可徒放炮呐喊，如儿戏故态。着申饬行。”
太仆寺少卿凌超疏称急举、实做、密察三言及谨慎二字，与以浙人办浙事，用奇用正，时至机动等语。帝曰：“览尔疏，俱有成算于胸中。吾久不见凌生矣，着即召对。”
山西道御史林兰友疏陈仙城酿乱激变、贼党聚众焚劫事。帝曰：“仙邑壬午之寇，由邑令残酷，署官贪黩。岂惟仙邑，古今天下之乱，那一非守令不肖所致？据奏李芳馨之竖旗，群盗之响应，祸始于无良胥役，县官岂能无罪？除县官有无赃迹实际别议外，今当先拿猾胥，以服潢池之心；次部署官兵，以为戡剿之用。”
王谓首辅何吾驺曰：“文章之气，可销甲兵，多士奋庸，务收俊。朕念福京士子，亟宜宾醮，兹定期六月开科，锁闱三试。彻棘放榜，不许游移一日。监临照两京旧制，定用御史两员，提调则布政司，监试则按察司。一应科场事宜，即于五月杪报竣，不许苟简滋玩。分考官务用甲科。推知不足，即就甲科中行官礼聘。其江西、浙江、湖广及各省来试者，跋涉可念，着地方官给与文书路引，以御盘诘。现在流寓的，就赴福京督学考选。一应赴京恩岁贡，照旧例着礼部考选。”
时三衢告急。兵部司务徐心箴疏陈三可惜四可忧。帝目其切中时弊。
大学士曾樱荐同乡刘逵堪为御史。帝曰：“御史为朝廷法官，若不清勤激切，何以明目达聪？从来巡方积弊积玩，朕所亲见。这所举用刘逵，堪巡粤左，即着允行。”
五月一日，清师围广信。诸军先后溃散。江抚刘广胤退避雩都，援兵益不敢前，广信遂陷。
兵部主事徐州彦疏陈间关入蜀、宣布皇恩、目击情形等事，胪列督辅抚按在事诸臣王应熊、樊一蘅、李乾德、马象乾、米寿图、刘鳞长、王芝瑞、万年策、郑逢元、刘泌、范文光、牟道行、田华国、曾英、曹勋、莫宗文、杨展、贾登联、谭诣等戮力残疆，奉扬威命。帝曰：“川蜀频年苦寇，民不聊生。闻诸臣提挈赞襄，朕心甚喜。州彦克尽使职，着即前来复命。”
谕靖夷侯方国安曰：“卿威望绩劳为江上诸帅之冠，至矢心奉戴，忠诚无二，朕尤鉴孚。卿无可间之嫌，朕岂听谗之主？中外大小诸臣须同心一德，乃能办敌。切勿妄分彼此，使敌人（校者案：《大纪》作“丑夷”）闻之得计。卿其晓示将士，善体朕意。”（校者案：《大纪》此下尚有提及马、阮诸人数语）。
方国安奏富、德、源三县大捷，斩获甚众，由镇臣方元科竭力支撑，傅明德、田胜、涂有声协助。帝大悦。
初九日，廷试贡生。敕礼部各察正身年貌，严核混冒怀挟等弊，以作人文，上隆治典。
广西桂林等府州进贺监国登极表四十六道。王念其路远迟延，不罪。
黄斌卿疏陈：“古今多一精忠，中兴少一名相”。帝览奏曰：“辅臣道周精忠大节，就义从容，真足感动天人，争光日月。朕方恢中兴大业，而一代纯臣先殉国难。抚念今昔，倍为怆怀。翁龙楠现在何处？着该部再行察访，务得实信回奏，以凭从优恤录。其毛玄水四员，并与察恤。”
禁地方官官买。曰：“府州县之行户，实地方害民之恶政。官之稍有良心者，尚以官价买之，比市价十去五六；全无良心者，直票取如寄。胥吏缘之，奸孔百出。朕昔潜邸，久知此弊。宜行永革。”（校者案：此下《大纪》尚有数语。）
帝谓群臣曰：“辅臣道周，委身殉难，其子子中备述之，镇臣黄斌卿亦有此奏。读绝命诗有‘支天千古事、失语一朝人’之句，朕亦不觉泣数行下。恤典著于五日内察例具奏。其子子中年俱幼稚，更可怜悯。准给银二十两以助书资。”
赐吏科给事朱作楫旌廉天字银牌二面，曰：“作楫以羁旅之臣，直言受知。身处掖垣，能却暮金，真浊世之灵光也。”
帝曰：“天气炎蒸，轻犯岂宜淹禁（校者案：《大纪》此下尚有数语）？军徒以下，准俱保释，以迓天和。”
福京监察御史王孙蕃、韩元勋疏陈减篇恤士，推一时之恩。惟是二书三经，不若三书二经为合式。其题目仍照七篇俱出，二场亦然。庶镌之试录，传之天下后世，皆信为不刊之章程，兴朝之盛美也。帝准如议行。
监军兵部主事黄师正进督师史可法遗表。帝曰：“可法名重山河，光争日月。至今儿童走卒，咸知其名。方当击节（校者案：《大纪》作“楫”）渡江，速图恢复，乃为强镇力阻，奸党横行，竟赍志以殁也。惜哉！读遗表，令人愤恨。应得赠恤祭葬易名未尽事宜，行在该部即从（校者案：《大纪》作“行”）详议具奏闻。其母妻犹陷寇（校者据：《大纪》补“寇”字）穴，一子未知存亡。作何获寻，黄师正多方图之。”
时泸溪危急，揭重熙参督辅傅冠身任督师，日午未起，未尝至关上一步，人言啧啧。帝怒其有负委托，准以原衔归里。
帝谓诸辅臣曰：“临民之官，岂可以银而得？朕于闽、浙近地，凡有捐饷至二三千而求为知县者，朕断不允。盖为生民计，不可不周。况抚戢凋残，有所未便耶？”
复谕首辅何吾驺曰：“朕在延多日，漫云兼顾江、浙，终于江、浙何补？不如实实出关，拿定一件做去，尚为得力。且今地方止有闽、广、江、楚，四省咽喉，全在一虔，彼（校者案：《大纪》作“清”）所必争，我所必守。今不自出，负祖负民，朕之存亡，犹其小者。今还要催林咨兵并陈天榜兵到，决意初一日必行。”
赠诸生翟翰林院待诏。，江南人，雅以复仇雪耻自负。闻监国登极，匍匐入闽。建言谏诤，不遗余力。帝特官之，不受。至是病故。御史钱邦芑为陈其本末。帝怜其才，赠以是官，并赐银二十两为葬资。邦芑为缴还之。帝曰：“朕视忠臣，过于骨肉。一臣之亡，即少一助。翟赐金着与制一碑碣，不必缴进”。仍赐四语，俾勒于石，曰：“生既尽君臣之义，死亦凛夷夏（校者案：《大纪》作“华夷”）之防，名称大明正士，实关天地纲常。”钱邦芑等奉行。
礼部缴进贵州试录二十册。
初，有曲周县生员韩雄都者，与帝遇于淮扬，颇有献纳。继乃与路振飞等起义太湖，同副总兵王羽、参将王奋武、中书路泽溥、泽淳、举人杨廷枢等同仇敌忾，大挫敌锋。至是，雄都入闽。帝称为佳士，超拜兵部职方司主事。
帝闻江督万元吉死守赣州，特加枢衔；江抚刘广胤退避雩都，着革职听勘。
谕吏部验封司员外曹元芳曰：“东南为朕一人故，三遭寇虐。览奏如恫在躬。义师所在云集，乘其怨而激励之，因其势而利导之，真恢剿一大机。元芳为国仇家难惊心，慷慨请缨，具见忠孝。但勇往难，往而有济更难也。”
郑芝龙疏陈孤臣督辅黄道周矢志尽忠。帝特赠道周文明伯，谥忠烈，祭葬即照伯爵例行。妻封一品夫人，四子长为锦衣卫，世袭指挥；次为锦衣卫，世袭正千户；三子着任行在尚宝寺丞；四子任中书舍人。仍敕有司一立庙于本乡，名曰报忠，一立庙于福京，名曰悯忠，春秋致祭。并与立坊于家，篆额曰中兴荩辅。其遗诗即立碑于庙门。
特议加福京乡试解额三十名，以示龙兴首善、广开薪至意。
督辅杨廷麟疏陈虔事危在旦夕，援兵半已溃亡。帝曰：“吉州失守，督臣万元吉诸兵皆付一掷，抚臣刘广胤先出雩都，副总陈丹、张琮、李源氵符五月一日失机。成何法纪？此番功罪宜明，卿即详悉入奏。惟虚惟公，勿僭勿。见在收拾残败，亦即中兴根本。粤兵狼兵三万余人准卿召募，但作何招集，作何约束，必先议定。近日地方苦兵尤甚于贼，经过不慎，号令不严，驱虎进狼，绿林四起，岂必寇作戎首哉？包象乾、张家玉兵，卿还严谕，不得收聚凶徒，终成溃散。朕十日内一定亲跸汀州，面议方略。”（校者案：《大纪》此下尚有“誓在必行，决不失信”语）。
谕吏部尚书郭维经曰：“官员贤否，关民生之荣悴，切宗社之安危。若吏部有满堂清官，天下必少呻吟百姓。朕于此选，至虚至公，力拔其尤而后已焉。”
又谓兵部试司务蒋平阶曰：“览尔奏，多发人所未发。如一官五月而更易数人，一人数日而更三命，百里而督抚并设，巡方与中使并差，皆害政之大者。至谓疑人复留用，募兵不问饷，有听言之名而未收其用，去铺张而存实意，相天下机而务持重，皆切要语。朕所嘉尚焉。”
吏部尚书郭维经疏列三吴起义死难土绅。各赠官有差：葛麟赠兵部郎中，钱振先赠参政，顾赠兵部主事，王日如赠兵部员外，冯翥赠副使，钱圭赠参政，王有容赠佥事，麻三衡赠国子监学正，凌宏焕、张明光、谢球俱赠训导。
大田县贡士乐英进《册府元龟》一部。
琉球世子遣官航海入贺，并贡方物。
镇臣黄蜚一家殉难。予祭葬，并行原籍建坊旌表。
敕郑芝龙拨兵遣将守江山，壮衢声势，未可卸远调之担，自撤藩篱。时海师议久不成。朝廷兵饷尚缺。礼部侍郎曹学谓恢复之策，舟师直捣金陵，或可冀其万一。故罄竭家赀及盐本诸项，勉成一万以济之。
左都御史张肯堂疏荐崔芝善于用海，有船五十余号，有兵二千余名，乞释罪图功，置臣标下。帝曰：“前杨耿纠其募贼入港，因发兵捕剿。卿既信其无他，即准随卿前进。定限夏至前到，以便卿乘风吉行。崔芝俟再立功，即与挂印”。
翰林院检讨何九云进家藏书四百八十四种，计三千五百本，令弟九禄赍投。帝曰：“朕性喜图书，所进者缣缃殊富（校者案：《大纪》此下有“颇快案愿”语），着即收进。内有重的，仍发与九禄领回。九禄着任国子监学正，以示酬劳。”
四川参政刘鳞长疏称恢复重、夔二府三州二十三县，以川饷赡川兵，不敢虚糜破冒。帝嘉其不避艰危，尽抒方略，忠劳懋著。特升太仆寺少卿，俾其前来陛见供职。
时有讹言驾回天兴者，帝闻之怒，曰：“朕以进战自誓，岂有复回之理？谁为此言以惑乱耳目？即应立刻察明斩首，以警其余。”
行人司瞿昶疏陈楚、滇、蜀、黔事情。楚在一事权，专任使，预敕重臣以待南昌、荆、襄之复，即遣大将以镇之。蜀在结将士，收民心，用蜀人办蜀事。摇黄则剿抚并用，献贼则歼厥渠魁。滇、黔则在外援邻邦，内顾门户。但近日勋臣土司议论未定。其地近蜀之遵永、楚之接界，平溪、铜仁，俱宜防援。种种皆扼要实着。帝嘉纳之。
帝谓近臣曰：“信抚五易而得周损，今又说损不可用。才能试而后见。俟到任后不效，另议未晚。信乎！用人之难也。”
礼部拟会试，定用十月，移催各省各府。
有恩贡生陈元纶赴廷试，进所著《豳风保治全书》、《五经涉录》各一部。敕谕留览，以启所学。
六月，以杨鹗总督偏沅。何腾蛟因进敕印一齐交付疏。帝谕之曰：“卿宣劳江汉，功在社稷。复楚恢豫，长驱燕代，业以全担付卿。杨鹗之推升，因彼时未审舆图，偶为错举。岂有一柄两操之事？今中枢需人，业召鹗入佐矣。朕与卿分则君臣，谊同父子，何不因疑奏明，遂为是举？且将在外，君命有所不受。尚惟始终一心，力任危地，以必见孝陵、必葬威宗为任。朕与卿当共勉之。”后有两奉君命出江，百念回思顾楚之疏，中有“愿为愚，不愿为智，不敢弃，不忍弃，不能以两年死挣之城弃之他人之手”云云。帝始欣然曰：“阃外之事，悉以赖卿。惟有早开云台以待。”
帝命翰林院新选萃士万荆等十二名，随庶吉士后，入阁拜先师。复敕翰林院官时其教习，毋得作辍。其服色比庶常，而冠袍角带焉。后兵部主事万曰吉劾其非制，且有赝鼎见售之疏。帝曰：“拔士于贡中，作养人材，事关特典。名为萃士，原不同于庶吉士，毋得慷慨（校者案：《大纪》作“愤激”）不平，暗行诋诽。”
敕台臣艾南英将其生平著作刊刻成帙者进览。
时钱塘江上战功，惟方元科为能用命。封为定胡伯，并发手敕以示优异。帝曰：“天下之坏，不坏于寇而坏于兵，不坏于兵而坏于官，殊可痛念。浙中无所事事之官，逍遥于家，骚驿于途，渔猎细民的，通着抚按清察撤回，安辑地方。”
时清师数万逼楚疆。李赤心等怯不敢前。监军道章旷独逾岭督榆兵血战，斩获甚众。清师屡却。督部何腾蛟疏闻。特升旷都察院右佥都御史，提督军务，恢抚湖北地方。
巡关御史郑为虹叱责芝龙标下将官陈俊、邹太争舟，芝龙密诉于帝。帝曰：“干戈宁谧，全藉文武和衷。为虹叱责，亦是代卿约束。卿幸勿芥蒂，仍以王臣王事视为一体，等于虚（校者案：《大纪》作“同”）舟，尤所殷望。”
衢州知府伍经正不奉鲁藩，帝以其义凛一尊，秉节不二，再与实加一级示劝。
福京太仆寺卿甘惟荣上疏乞休。帝谓之曰：“同一去国，太平无事，人竞进而己独退，则为恬；国运多艰，人致身而己思去，则为避。此义诸臣所素知者。惟荣仍降一级，以警偷惰。”
命黄斌卿曰：“荆本彻虽非贼寇，乃尔骚扰地方，民恨实甚，杀了便罢。所招降将士，善为约束，勿令流毒，致重民怨。”
郑芝龙制油扇五千五百握有奇，分给闽中应试生儒，以为却暑。帝破例允行。
改十五日乡试首场，《四书》三篇，经二篇。十七日二场，策三道，判二条。从减篇节省之旨也。是时，吴炳从江右单骑入关，帝命为布政司，提调棘闱，而以编修刘以修为主试。以修字懋卿，号九一，阆中人，庚辰进士。先是，以修进《文昌化书》，帝曰：“《化书》劝人忠孝，朕甚嘉之。以修生长其乡，即与门人较定，更当广布成书，以襄上治。”
福京吏部司务王士和疏陈六事：文职广而脱卸者多，武弁盛而立功者少，升迁骤而责任益轻，议论烦而实用益寡，听纳博而精神愈纷（校者案：《大纪》作“棼”），移跸频而民生日苦。帝叹为苦口良药。随以士和为延平守。
是时，苏观生、陈赓多方鼓舞援军将士。吴之蕃、张国祚两营奋勇出战，与清师遇于李家山、九牛之间，数战皆捷。清师疑援兵至，撤围退屯水西。之蕃、国祚亦退守南康。时赣守已阅两月，奉诏劳苦，改名忠诚府。加杨文荐右都御史。二十四日，江起龙、赵印选、胡一清率师三千，南安同知刘清容引兵三百，苏观生部下遣师三千，粤帅余卒三千，杨廷麟收散亡数千，大司马郭维经、侍御姚奇胤召募滇闽兵八千，阁部丁魁楚部下遣师四千，先后皆至。营于城外，不下四万余人，皆欲一当敌。先时，中书袁从谔出募砂兵三千，铨曹龚蔡、兵曹黎遂球出募水师四千，留滞南安。万元吉以为必待水师之至，并力一战，安危在此一举。王其玄曰：“今水涸不能泛巨舟，且其帅罗明受故海盗也，桀骜不驯。龚、黎二公如慈母之奉骄子，岂能如约？”
是月朔，皇子琳原诞生。群臣表贺，有“日月为明，止戈为武”语。帝叹赏。大赦。覃恩。手诏封芝龙泉国公、鸿逵漳国公，寻改芝龙平国公、鸿逵定国公。郑氏厮养俱得三代诰。撰敕及织轴者，日不暇给。
阁部顾锡畴流寓温州。有镇将与督学相结，取事例银供饷。诸生鼓噪，镇将缚一二人杀之。锡畴欲疏劾，镇将乃乘夜缚锡畴投之于江。子蓥遁免。镇将者，贺君尧也。顾为佟邦年门生，邦年子为清朝嘉湖道。蓥在署中，适君尧以赂佟入官，蓥见之，以告。乃置之死。
时清师陷萧山，遂围诸暨及绍兴、严州。关门震动。
二十七日，发榜，取中叶瓒等一百七十五名，副榜六十五名。钱邦芑请一榜尽赐登科，以成旷典。而是科弊中甚多。榜内李枚文理大谬，编修周之夔、御史刘霖懋取布政司原卷不通处疏纠之。帝即命黜革，逮房考推官王三俊，追赃一万两以助水师饷。其余另旨。令南城御史方元令覆试。黜落四名。仍发续榜，俱准为举人。继而三俊之赃甫完而清师已至，幸免株连。
秋七月，都督陈谦奉鲁藩使，与行人林{次土}至关，超趄不进。芝龙以书招之，乃入陛见。启函，称皇叔父而不称陛下。帝大怒，下廷议禁狱。陈谦者，武进人。乙酉春，赍南都诏封芝龙为南安伯。比启读，券乃误书安南。谦谓芝龙曰：“安南则兼两广，南安仅一邑耳，请留券而易诏，更晋伯为侯。”芝龙大喜，厚赠而别。半道而南都失守。故芝龙素德谦，御史钱邦芑乃密启谦为鲁藩心腹，与郑深交，不急除，恐有内患。或以告芝龙。芝龙谓刑所必经其门，临期救之未晚。至夜半，内传片纸，别移谦斩之。芝龙闻，伏尸哭，极哀。以千金百布葬谦，为文祭之，有“我虽不杀伯仁，伯仁由我而死”之语。因疏“海寇狎至，今三关饷取之臣，臣取之海，无海则无家，非遄征不可，拜表即行”。中使手敕云：“先生稍迟，朕与先生同行。”及之河，则飞帆过延平矣。芝龙既去，守关将施福尽撤兵还安平，声言饷缺。盖微闻钱塘信也。
雷州守将杀清知府赵最、推官李宣国。高州府乡兵逐清所置官，复其城。
诏以皇子恩释佥都御史田辟于狱。辟，河南人，甲戌进士。南都时以户部榷税虔州。是年春，募兵入卫，改署都察院事。疏纠阁臣曾樱，语连中宫，帝含怒未发也。既而遣锦衣卫王之臣往阅其师，并发月饷。之臣迎合意旨，疏纠诡兵冒饷。遂下诏狱。然兵籍俱实，饷又未发，班行多申救者。帝怒不解。至是乃释。后辟崎岖楚、粤间，卒抗节而死。
督师黄鸣俊久驻衢州。八月，忽退入仙霞关。帝怒。适鸣俊子职方主事天复从驾，诏逮狱，而命建宁府羁鸣俊。鸣俊惧，请奋勇自效。寻统兵出关。
王子琳原薨，谥庄敬。
郑鸿逵驻关外，传言清师至，则徒跣疾行三日夜而抵浦城。询及后至者，则兵哗也。事闻，削其封爵。
帝因首辅何吾驺言，决意幸汀入粤。而芝龙力请旋跸福京，且云：“倾家相助，可四百万。关门固守，决难飞渡。”帝不听。芝龙归，又令继母赴行在，力向中宫言。又不听。时清师已辐凑关外，帝尚在延平，将幸赣州。特诏宣芝龙商留守事宜。芝龙不至。清内院洪承畴先绐芝龙，啖以闽粤王官爵。凡关隘水陆之兵，二月时俱早撤回。浙东既溃，清师从容入闽。而或由建，或由汀，或由福宁，俱走山谷间道出不意，不尽由仙霞也。
十七日，清师将至浦。百姓请出降，按臣郑为虹不可。再请行，又不可。及清师至，拥见贝勒。为虹不屈。贝勒嘉其节，不忍杀，且劝剃发。为虹曰：“负国不忠，辱先不孝，忠孝俱亏，我生何用？宁求速死，发不可断也。”明日复召见，责输饷。为虹曰：“清白吏何处得金？”百姓争欲代输，赎以不死。为虹以民穷财尽，持不可，喷血大骂，贝勒下令斩之。为虹字天玉，扬州人，癸未进士。年少美丰姿。初令浦城，洁己爱民。帝入关闻其廉，欲置之左右。浦民留之，有“十不可去浦”之疏。遂宠其任为巡关御史，亦以恤浦民也。关将不法，为虹绳之。有曲护关将者，反露章弹为虹市恩邀誉。帝知其忠，不问。复命巡按上游。关将颇为敛手。清师入关，为虹叹曰：“文武不睦，势不可为也。”竟不屈死。科臣黄大鹏同日殉难。为虹义仆陈龙，与标下中军游击原某、浦城千户张万明及子都司张翘鸾、都督洪祖烈从死。百姓为之祠焉。
清师破延平，帝出狩，犹载书十车以从。时随行者，止何吾驺、郭维经、朱继祚、黄鸣俊数人。已而何与郭亦遁去。辅臣路振飞追驾不及，缢于邵武山寺。礼部侍郎马思理、工部尚书郑俱扈驾，中途逃归。思理诈死，遁至海上，拥戴鲁藩。则争先屈首而已。
上游巡抚吴闻礼遁入山寺。人有劝之者曰：“岂有堂堂抚臣而怕死耶？”后率乡勇赴敌死。
延平府王士和矢志不移，曰：“吾受国厚恩，以守此土。不能持寸铁与斗，死有余愧，可与之俱生哉！”乃正衣冠经于堂皇。士和，临川人，富经术。崇祯朝领乡荐。初为吏部试司务。帝入关，疏陈六事，帝嘉其直，升知府事。清正不阿，延人德之，痛哭如丧所亲，鸠金敛焉。
永福降绅黄文焕男琪逐县令起兵，伐山开道至延平，朝清贝勒。
时有贡生齐巽、中书张份、医僧不空等，鸠众起兵。清师之遣挂示安民者，辄杀之。仓卒无饷，曹能始学俭助以千金，始克招募。黄琪密报贝勒王下福州，遂各逃散。
时讹传清师入闽，有“留发不留人，留棺不留屋”之语，省城巨室移棺郊外，城中如洗。
二十八日，帝抵汀州，清师踵至。建宁知府杨三瞿、延平道赵秉枢一路迎降。随征御史王国翰以警急闻，帝怒，欲杖之。扈从皆遁。次日有十余骑叩城，曰扈跸者，乃追骑也。遂执帝及曾后去。国翰及子都督同知凉武、礼侍曹学、通政使马思理俱缢死。后至九龙潭投水。帝崩于福京。或曰：“代死者为唐王聿钊，帝实未崩。”其从亡之臣，则戊辰进士赖垓、河南丙子解元熊纬也。后粤中建号，尊帝曰思文皇帝。
是月，罗明受率水师至赣。清师截之于江。明受遁走，弃巨舟八十余，兵士被获者数百。赣城内外列营丧气。清师于二十八日破广营，二十九日破滇营。自是，东南城外无一卒。
九月三日，清师围赣。城中留者，江起龙罢卒三千，汪国泰、金昌振四百余，徐日彩新招虔人二百余，郭维经部下三千余。城外惟水师后营黄志忠二千余而已。赣人登陴日久，勉强支持旦夕。
清师既下汀州，别遣李成栋、韩固山略定兴、泉、邵、漳等处。九月八日，入泉州。德化县令陈元青迎降。大学士蒋德绝粒死之。
十九日，清师至福州，从北门而入。城中百姓十留一二。父老仍鸠各铺羊酒郊迎。贝勒王驻札洪塘沙洲，出谕安民。禁兵士毋得入城肆掠。分职任官，悉如旧制。福州缙绅俱遁山谷，首至者某部尚书某一人而已，跪沙中竟日。贝勒不为礼，徐乃令去曰：“尔官在明朝若是大乎！兹不便用也，速去。”
时剃发令下。有闽县人赵卯，生三子矣。妻时已丧。卯乃多市鱼肉与父母畅饮，酒酣，请父母拜之。日暮，卯俟父母安寝，徘徊中庭，忾叹数四。呼其子曰：“尔读书笔砚可简出，吾有用。”随命三子先寝。乃濡浓墨大书于壁曰：“男子赵卯，不肯剃头死。”掷笔，缢于中堂，时年三十有六。
礼部尚书曹学，字能始，号雁峰，年十八举于乡，二十一成进士。宦辙所至，兴利除害。工古文词赋，富于著述。尤喜临池，入晋魏之室。熹宗朝以序何总制士晋所著书，谈及阉寺三案，削职追夺，几陷不测。归来闭户，著天下名胜志，选古今十二代诗，撰《五经说》。继乃旁通天文、禅悦、字说、语录、二十一史，皆有纂缉。威宗朝屡诏起之，不就。帝夙知其名，初入闽，即起为太常，寻进少宗伯。特设兰台令，修《威宗实录》。闻驾已离延津，即削发入山寺为僧。有不知时势者四人，思为恢复计，乃率里中无赖三十余人，直抵寺中而强之。学曰：“千金，予不惮倾囊以应。奈时势已至此何？”四人苦恳之，学恻然曰：“与其留为儿孙用，不如先为国家用。成败利钝，非予所知。诸君勉之。”翌日下山，予之如其数。四人者延学至帅府，时即九月十六日也。至十九日清师入城，学乃呼家人，告曰：“吾志已定，今日正吾尽节之日也。”遂沐浴正衣冠缢于中堂，年七十有三。语不及后事。后五日，始得入棺。次年二月十九日，移榇西郊二忠祠，葬祭成礼。
右卫指挥胡上琛，字逢圣，号席公，直隶人。伊祖以功授燕山卫，后升福州右卫，遂占籍焉。上琛幼孤，依母家田氏。少长，娴礼义文词。年十八，赴京袭祖职。折节读书，耽于赋咏。多蓄书画，有当意者，辄典衣购之。帝入闽，升锦衣卫，扈从延平。及帝出狩，上琛徒步归，闭户不出。清师将入城，上琛密令人入山觅毒草。其爱妾刘蕙闻而笑曰：“君岂以我妇人不知节义事而不与闻耶？吾有志久矣，特虑君志未决耳。”上琛喜动颜色，遂服冠裳，与妾拜天地祖宗，并坐中堂，饮药酒而卒。上琛时年三十有八，蕙年二十有一。子四人，先时嘱母氏抚养。
十月三日，赣城中有缒城而出者，清师获之以为乡导。夜泊小东门而上，乡勇犹巷战刃之。四日黎明，清师四集，遂破忠诚府。万元吉、杨廷麟投水死。郭维经入嵯峨寺焚死。兵科给事万发祥、守道彭期生、吏部主事龚、御史姚奇胤、兵部主事于斯昌、王其{宀弘}、黎遂球、柳昂霄、鲁嗣宗、钱谦亨、户部主事杜、中书舍人袁从谔、刘孟钓、刘应驷、赣州推官署府事吴国球、同知王明俊、临江推官胡缜、知县林逢吉、监纪通判郭登宁、乡官卢象观、举人刘曰、万与升、马芝、贡生杨述鸿、黄尚实、胡国伟、王明、管声元、戴绂、段之辉、朱长应、赖尚佐、刘期锡等数十人，不死于兵，即自尽投水耳。
十九日，清师入漳州。漳州道傅从龙、知府金丽泽以城降，皆仍旧职任事。不三日而乡民兵起，杀从龙、丽泽。
当清师之未入泉州也，郑芝豹先至，闭城索饷。诸绅不应者，即枭其首，缚亲家母于庭。抵暮，得数万。又具火手五百，将尽焚城中宫室。以饷未足，迟至明日。俄报清固山兵将至，乃奔安平。
芝龙保安平时，楼船尚五六百艘。军容ピ赫，战舰齐备，炮声不绝，震动天地。以前约南都洪内院信未通，故犹豫未敢迎师。又自念早撤关兵，清师得通行无所累，有大功。而两广素属部下，若招两广以自效，闽广总督可得，犹南面王也。清贝勒令泉绅与芝龙最厚者郭必昌招之。芝龙曰：“我非不忠于清，恐以立王为罪耳。”会固山兵逼安平，芝龙怒曰：“既招我，何相逼也？”贝勒闻，乃切责固山，令离安平三十里勿驻军。而遣内院二人持书至安平，其略曰：“吾所以重将军者，以将军能立唐藩也。人臣事主，苟有可为，必竭其力。力尽不胜天，则投明而事，乘时建不世之功，此豪杰事也。若将军不辅立，吾何用将军哉？且两粤未平，今铸闽粤总督印以相待。吾所以欲将军来见者，欲商地方人才故也。”芝龙得书，大喜，必欲降附。诸将多不从。其子成功痛哭而谏，劝之入海。而芝龙念田园遍闽、广，秉政以来，增置庄仓五百余所。驽马恋栈，遂进降表，单骑以五百人自随而降。成功母自缢死。
芝龙过泉州，大张播告，夸投诚之勋。犹持贝勒书招摇，得官者就议价。十一月十五日，至福州，朝见贝勒，握手甚欢，折箭为誓。遂命酒痛饮。饮三日，夜半，忽拔营起，挟之而北。从者五百人皆别营，不得见，惟狎客陈鼎随之。亦不许通家信。芝龙乃面作家书数封，皆嘱无忘清朝大恩语。而谓贝勒曰：“北上面君，乃芝龙本愿，但子弟多不肖，今拥兵海上，倘有不测，奈何？”贝勒曰：“此与尔无与，亦非吾所虑也。”
芝龙既行，郑彩、郑鸿逵、郑成功皆率所部入海，成功树旗曰“杀父报国”。张肯堂、沈犹龙等亦往舟山依鲁王。芝豹独奉母居安平。
芝龙至京，陛见，奉朝请。
十二月朔，成功会文武群臣于烈屿。设高皇帝神位，定盟恢复。仍改明年丁亥为隆武三年。移于南澳。勤王者远近至，军声颇振。
永历元年，即郑氏所奉之隆武三年（清顺治四年）丁亥，四月十八日，黔国城中人执阮韵嘉、袁士弘槛送楚雄，伏诛。二十四日，孙、李诸军入城，秋毫无犯。定洲据省凡五百五十日。
五月，李定国帅师向临安，庚申至壬戌拔之。改阿迷州曰开远，蒙自曰乐新。遣使至楚雄、永昌。杨畏知犹以流贼目之。
是月，郑成功于厦门中左所设演武场。
六月，四将军入迤西，杨畏知迎战，被执。四将军解其缚，坐之上座，以为同奖王室，非有他也。俾作书通意于天波。畏知曰：“果尔，当从我三事：一不用献伪号，二不杀百姓，三不掳妇女。”可望皆许之，即折箭对誓。迤西得免屠戮，畏知之力也。
七月，土司龙在田、许名臣降清。
郑成功合郑鸿逵军围泉州于桃花山，不克。
八月十八日，四将军兵入鹤庆，又分兵入丽江。土知府木懿迎降。天波得畏知书，犹不敢信，遣其子中显至营曰：“但得守永昌足矣，不敢复望故位”。刘文秀谓诸人曰：“沐世子来，犹国公也。请以国公之礼礼世子。”世子归，以二十骑送之，悉反所得沐氏世宝。天波大喜过望。二十骑中有两人历阶而上，中显视之愕然，谓其人曰：“此即抚南刘将军及王将军某也。”天波乃与两将军还成都。车裂余锡朋、徐中和等，以谢国人。
文秀随引兵讨佴革龙。佴革龙者，定洲之老巢也，有九山，最险。峒名溪乌，其外巢曰大庄，夷蛮黑老虎踞之。其战，口衔双刀，手舞大刀，所向无前。文秀围之久不下。定国益师往，诛黑老虎。
定国之攻临安也，定洲部目李阿楚拒战甚力。定国穴地道置炮，炮发而城陷。阿楚赴火死，兵犹巷战。定国怒，执城中绅衿兵民尽戮之。所杀七万八千余人，而阵亡与自焚自缢者不与焉。又屠晋宁及昆阳、呈贡、归化，又杀数十万人。迤东被戮之惨，几与蜀同。而迤西独免，宜楚雄人至今尸祝杨畏知不衰也。
十月四日，峒人多出降。破之，执万氏、定洲以归。沙乱由于万氏，滇人疑其如夏姬，及献俘，黑奇丑，莫不大笑。
是月，朱成功（即郑成功，用国姓也）从大学士曾樱议，颁明年闽中正朔，号戊子大统历，用文渊阁印印之。
永历二年（清顺治五年）戊子闰三月，成功攻同安、安溪，皆下，以吏部主事叶翼云署同安事。五月，围南安县七十日，不克而还。八月，清师破同安，叶翼云及镇将丘进、金裕皆死之。遣光禄寺卿陈士京入朝于肇庆。
永历三年（清顺治六年）己丑，士京还白肇庆。晋封成功为延平王。始奉粤中正朔（校者案：即永历，以前皆称隆武也）。六月，清漳浦守将归降于成功。
永历四年（清顺治七年）庚寅，成功率师南征。
永历五年（清顺治八年）辛卯二月，清守泉州镇将某侦厦门单薄，袭破之。曾樱自缢。诸绅咸避于浯屿。成功自南返泉州，攻者始退。十二月，成功攻漳浦，其令来降。
永历六年（清顺治九年）壬辰正月，清海澄守将赫文兴举城来降。成功围长泰县，清督帅陈锦来援，败之。二月，成功复克平和、诏安、南靖三县，进围漳州府。七月七日，陈锦为其内司李进忠等五人所刺，以其首来降。八月，刑部侍郎王灵石至自五指山，言思文在彼为僧。继而敕使至厦门。一时故臣皆不能决。九月，清金帅（校者案：即固山金励）援漳，郑师失利。
永历七年（清顺治十年）癸巳三月，五指山复遣使来存问诸臣。使言思文今离五指，驻平远县，将起兵。故臣乃具公疏，请敕验视。卒不可得。五月，金帅以万骑攻海澄，遇伏，大败。六月，郑师南下。会潮州守将郝尚文来降，以定海李孟署太守事。其属县潮阳、惠来相抗，成功赴剿。
永历八年（清顺治十一年）甲午四月，清廷议割漳、泉、惠、潮四郡地，令郑氏剃发，不受。清师复陷潮州。十一月，成功发水陆师，应西宁王李定国于粤东。十二月朔，成功克漳州。漳属十县，而降者九，独龙岩不下。十二日，泉州属七县，而降者六。
永历九年（清顺治十二年）乙未正月，郑师克仙游，攻凡半月。四月，郑师援粤之师失利，统军黄梧降级。五月，郑师祭旗，大演陆师，戈甲耀日。集缙绅观之。六月，郑师祭海，大演水师。九月，南克揭阳、澄海、普宁三县，命峻揭阳，毁澄、普。十一月，守舟山清将巴臣兴举城来降于郑师。发师已三月，阻风，至是始抵城下。十六日，清师再遣使议和。
永历十年（清顺治十三年）丙申正月十一日，始颁粤中正朔十年大统历，以前年有军事也。守台州将清马信弃其城降于舟山。二月，马信及冯用、张洪德俱抵厦门，谒成功。五月，粤师失和，归斩其将苏茂。闰五月，改厦门中左所为思明州。六月二十四日，黄梧以海澄降清，县令王元士从之。协将康雄不从，断其手，得坠城出。七月五日，以陈忠勇侯留守思明州，成功率师北伐。夺闽安镇，斩清将胡希孔，生擒百七十余人。二十三日，战于南台，夺桥。又明日，战于桥北，再胜。二十八日，战于教场，夺马二十五匹，擒延平援将张礼。八月四日，成功克连江。二十六日，清师陷舟山。总制陈雪之、英义伯阮进俱赴海死。
永历十一年（清顺治十四年）丁酉十二月，思明火药局火。
永历十二年（清顺治十五年）戊戌正月，粤中以玺书通问于思明。二月，徐孚远觐粤中行在，泛海取道安南入滇。成功会师浙海，以前少司马张煌言为监军，北上抵羊山。羊山故有龙祠，海舶过者致祭必以生羊，即放羊于山，久而孳息日繁，见人恬不畏避。军士竞执之。时天朗波平，怪风猝至。海舶自相枞击，义阳王溺焉。于是返旆。
永历十三年（清顺治十六年）己亥五月，郑师悉众北指。张煌言以所部亡命为前驱，入江，抵瓜州城下。明日，成功至，清师御之，满汉兵死者千余。郑师乘胜，遂克其城。成功南渡攻镇江。煌言溯长江，未至仪真五十里，吏民迎降。六月二十八日，煌言抵观音门。成功已克镇江，水师毕至。七月朔，哨卒七人略江浦，取之。五日，芜湖以降书至。成功谓煌言：“芜湖上游门户，倘留都不旦夕下，则江楚之援日至。控扼要害，非公不可。”七日，煌言至芜湖，传檄郡邑。江之南北相率来降，郡则太平、宁国、池州、徽州，县则当涂、芜湖、繁昌、宣城、宁国、南宁、南陵、太平、旌德、贵池、铜陵、东流、建德、青阳、石埭、泾县、巢县、含山、舒城、庐江、高淳、溧阳、建平，州则广德、无为、和，凡四府三州二十三县。而下流之常、镇属县亦皆待时为迎降计。时有清大帅单骑东奔，饭于村店。店惟一老妪。大帅皇遽问曰：“今待何如？”老妪不知其为大帅也，合掌向天而谢曰：“闻杀北人尽矣。”大帅不敢饭而去。金陵亦窃议迎降，未定而谍知郑师疏放，樵苏四出，营垒为空，士且释兵而嬉。用轻骑袭破其前屯。成功仓卒移帐。质明，军灶未就，清师罄城出战。郑师大败。成功遂乘流出海，并撤镇江之师。煌言趋铜陵，与楚师遇。兵溃，变姓名从建德、祁门山中出天台以入海。
成功之败而归也，以厦门单弱，方谋所向。中途遇红夷船。其通事乃南安人，谓成功曰：“公何不取台湾？台湾，公家之故土也，有台湾则不患无饷矣。”
台湾，海中荒岛也。崇祯间熊文灿抚闽，值大旱，民饥，上下无策。文灿向郑芝龙谋之，芝龙曰：“公第听某所为。”文灿曰：“诺。”乃招饥民数万人，人给银三两，三人给牛一头，用海舶载至台湾，令其茇舍开垦荒田为生。厥田惟上上，秋成所获，倍于中土。其人以衣食之余纳租郑民。后为红夷所夺，筑城数处：曰台湾，曰鸡笼，曰淡水。此外又有土城数十处。台湾之城，叠乱石高数丈，厚丈余。用火煅之，石化为灰，融结成块。其门户为澎湖。澎湖淡水，地势低下，海舶至此，须易船而入，故险而易守。
成功往攻台湾。至澎湖，适遇水涨，竟以海舶渡之，直抵城下。城中红夷不过千余人，余则皆郑氏所迁之民也。以大炮击城，坚不受炮。湾民导之曰：“城外高山有水，自上而下，绕于城濠，贯城而过。城中无泉井，所饮惟此水。若塞其源，三日而告困矣”。成功从之。红夷乞降。遂以大舶迁其家。
成功据其地数年，卒，子郑锦（案：即郑经）嗣。后至甲寅，耿精忠反于闽，郑氏人犹奉粤中正朔曰二十八年（校者案：台湾直至永历三十七年始降清，时已清康熙二十二年矣）。
三余氏曰：郑氏以盗贼之智，习海岛无君之俗。委身而托之，祭则寡人，亦云幸矣，藉之谋国，不已慎乎？黄道周辈号称心膂，在承平固曰能贤，毕竟迂远不达事变，其于弘济时艰全无影响。赣即后亡，而万则自用颇专，杨亦迟于见事，岂所称扶危定倾者耶？卒之君逃臣死，俱归孟浪。适以速郑氏之负箧担囊而趋已耳！可慨矣夫！
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