问：甲某为乙公司的法人代表，2007年11月22日，甲乙双方签订租赁合同，约定：1、甲将市区1万平方米的土地（土地用途：工业；房地产产权为甲某私有。）及地上厂房出租给乙使用；2、租赁时间：2008年1月1日――2011年12月31日；3、租金：35万元/年，付款方式：年付。4、租赁期间的土地使用税和水、电费均由乙方交纳。
2008年，乙公司向甲某支付了租金35万元，向地税局申报土地使用税50000元并在管理费用中列支，检查人员发现后调增了乙公司2008年度的应纳税所得额50000元，并进行了相应的处罚。
在处理过程中，存在以下争论：
1、没有文件明确个人出租土地要缴纳土地使用税，甲某出租土地给乙公司是否要缴纳土地使用税？
2、甲某认为乙公司也是自己的，交了本不需交的税，还要在所得税上补税罚款，真冤？他的认识对吗？
答：根据《国家税务局关于检发的通知》国税地字[1988]第015号文件的规定：
第四条 关于纳税人的确定。土地使用税由拥有土地使用权的单位或个人缴纳，拥有土地使用权的纳税人不在土地所在地的，由代管人或实际使用人纳税；土地使用权未确定或权属纠纷未解决的，由实际使用人纳税；土地使用权共有的，由共有各方分别纳税。
甲某出租土地应按规定由其缴纳土地使用税。乙企业代甲某缴纳的土地使用税，土地使用税属于与生产经营或者说与取得收入的支出，那么按照《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例的规定，是不能在税前扣除。
