1952年下半年,教育部在全国进行了大规模的高等学校院系调整工作。这次调整涉及100多所高校,主要是把一些大的大学分解成为一些小的学校。北方交通大学建制撤消,唐山工学院改为唐山铁道学院,清华大学土木系助教2名和学生6 名,哈尔滨铁道学院土木系及重庆大学铁道工程组学生调入该校,而该院各系调往其他学校及人才损失情况(这里注明院士的,均为之后当选)简介如下:
1)建筑系调15教师(教授6名,副教授4名,讲师3名和助教2名)和全部学生先到北京铁道管理学院,然后调至天津大学:调出的教师及学生有徐中教授、刘福泰教授、沈玉麟教授、卢绳教授及彭一刚院士、周祖奭教授等。
2)冶金系连同所有师资学生,设备,图书等,主要调整到新组建的北京钢铁学院(今北京科技大学):调出的教师及学生有徐祖耀院士、吴自良院士、王钧豪教授、王绍瀛教授、张万奇教授、章守华教授、林宗彩教授、朱觉教授、马如璋教授、王润教授、葛昌纯院士等及物理系赵松鹤教授。
3)采矿系除地质组外全部调往中国矿业学院(今中国矿业大学):调出的教师及学生有何杰院士、张熙年教授、陈清如院士、江山寿教授、张荣曾教授、汪泰葵教授、王祖讷教授等。
4)采矿系地质组调整到北京地质学院(今中国地质大学):调出的教师有王鸿桢院士、袁见齐院士。
5)土木系水利组调整到清华大学:调出的师生中有著名科学家黄万里教授以及王三一院士。
6)化学工程系除保留应用化学组外,其余14名教师(教授和副教授各4名,讲师1名,助教5名)和54名学生调整至天津大学:包括余国琮院士。
7)材料工程系调入北京铁道学院:严东生院士由于唐院材料系撤销而去了中科院上海冶金陶瓷研究所。
8)电机系电讯组调整到原哈尔滨铁道学院然后又调至北京铁道学院。
经过以上调整,唐院共调出教师72名(其中教授22人,副教授11人,讲师4人,助教35人),其中不乏著名学者。另外,本院中外文图书、刊物调往天津大学691册,调往中国矿业学院1777册,调往北京地质学院292册,调往哈尔滨铁道学院81册。
50年代初,该校在北京潭拓寺建立了唐山铁道学院北京分校,后成为铁道部党校。
我校一直受开滦煤矿底下采掘的影响,遂在甘肃兰州选址谋迁。1958年初建成了部分校舍,成为唐山铁道学院兰州分校。后来为了在华北地区保存一所名牌高校,国务院决定该校不迁兰州。为了适应党中央开发建设大西北对铁路运输专门人才的需求,我校报请国务院批准,把兰州分校改为兰州铁道学院。随后,该校的铁道建筑、桥梁与隧道工程内燃机车、铁道车辆、铁建系给排水专业、电气运输系以及北京铁道学院的运输系(一部分)成建制地连同师资,学生,实验设备及图书资料搬迁至兰州。
1964年,为支援大三线建设,国务院决定:唐山铁道学院内迁至四川省峨眉县。1971年底,学校正式迁到峨眉,改名为西南交通大学。
1989年学校校部正式搬迁至成都,从而形成了成都、峨眉两个校区。
2000年2月12日,西南交通大学由铁道部正式划归教育部。
2004年,西南交通大学在成都郫县犀浦镇建成新校区——西南交通大学犀浦校区,“一校两地三校区”的格局正式形成。