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西医强调还原论思想，采用微观分析方法，将人分为器官、组织、细胞、分子等，医疗针对性很强，重视局部病靶，用对抗疗法祛除病邪，但忽视人文精神。
中医重视整体论、天人合一思想，采用发掘和调节自身祛病能力，注重机体的反应状态，贯彻人文精神，达到扶正祛邪目的。不足的是，有些理论和方法处于模糊状态。
“中医药本身就是特色和优势，如辨证论治、综合疗法等。”这些原创思维和独特疗法，至今仍造福中华大众。“中医药能治好很多病，一定是有内在的科学道理的。”他始终认为，人们现在解释不了它，但不能说它不科学。西医近年强调的系统生物学、整合医学等，都没有超过老祖宗的整体观、阴阳五行、个性化治疗的范畴。
科学技术发展到现在这种水平，我们对中医药的很多作用还不能完全阐释清楚，何况前人？但是无论如何，没有西医药，中华民族几千年来繁衍得很好。“即使现在西医药占据了社会主体地位，中医药仍然有着不可替代的作用和地位。”
随着科技发展，中西医学也都从对方汲取精华来弥补自己的不足。西医重证据，如今也讲究整体观；中医重经验，现在也讲究科学数据。他强调，“离开中医药理论的指导，都不能说是现代化研究。”中医现代化不是所谓“旧理论”和“新技术”的叠加，而是在中医药理论指导下，坚持原创思维，利用现代生命科学知识与技术来协同、融合、上升，以我为主，为我所用。
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