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你的有些基因并非来自祖先

 师德量 2015-03-18

你的有些基因并非来自祖先

2015-03-18 07:45  来源: 蝌蚪五线谱

       这是一项最新发表的研究,它可能挑战了很多人关于进化和基因的既有观念。

       研究指出,很多动物——包括人类,都会从古代与他们共存的微生物身上获得一些“外来的”基因。这个结论挑战了认为动物的进化仅依靠祖先传承下来的基因的传统观点,并且指出,至少在某些地方,这种从外部获得基因的过程仍然在继续。

    围绕基因的争议由来已久

       这是一项最新发表的研究,它可能挑战了很多人关于进化和基因的既有观念。

       研究指出,很多动物——包括人类,都会从古代与他们共存的微生物身上获得一些“外来的”基因。这个结论挑战了认为动物的进化仅依靠祖先传承下来的基因的传统观点,并且指出,至少在某些地方,这种从外部获得基因的过程仍然在继续。

       首先我们先了解下这个过程是怎么发生的——

       人们把生活在同一个环境中的不同有机体之间的基因转移叫做基因的水平转移。这种水平转移在单细胞生物体中非常常见,被认为是一种重要的自然过程,它可以解释很多现象,例如为什么细菌很快就会对抗生素形成抗药性。人们还认为,基因的水平转移在某些动物的进化中具有重要作用,包括线虫,它们能够从周围的微生物和植物身上获得一些基因;还有某些甲虫,能够获得细菌的基因,从而产生用来消化咖啡果的酶。但是,关于基因水平转移是否也会发生在人类等更加复杂的动物身上,一直存在着广泛的争议。

    

    关于转基因作物可能发生的基因漂移也一直是各界争议的焦点

       我们再看看科学家到底做了哪些研究——

       这些研究者研究了12种果蝇、4种线虫和10种灵长类动物的基因,包括人类。他们计算了每种动物的基因与其他动物的类似基因的一致程度,从而估计这些基因是外来基因的可能性。通过与其他物种群的比较,他们还可以估计出这些基因可能是多久以前获得的。

       对于人类,他们确认有17种以前提到过的基因是通过基因的水平转移获得的,并在人类的基因中又发现了128种以前没有提到过的来自基因的水平转移的基因。有些基因,包括决定血型的ABO基因,都被确认是通过基因的水平转移从脊椎动物身上获得的。这些来自基因水平转移的基因,大多数都与新陈代谢中所涉及到的酶有关。

       有些来自基因的水平转移的人类基因与脂类的代谢有关,包括脂肪酸的分解和醣脂的转化。还有些基因涉及到免疫反应,包括炎症反应、免疫细胞信号和抗菌反应。如果再进一步对这些基因分类,则包括氨基酸代谢、蛋白质修饰和抗氧化活动。

       研究团队识别出了转移的基因可能来自哪些类型的有机体。最常见的来源是细菌和原生生物,以及其他微生物。他们还发现了来自于病毒的基因水平转移,有50多种灵长类的水平基因转移都来自于病毒。

       还有些基因来源于真菌。这解释了为什么以前有些只把细菌作为水平基因转移来源的研究不承认这些基因属于“外来”基因。  

       这些被你忽略的微生物可能已经影响到了你的基因

       研究人员发现,大多数灵长类动物的水平基因转移都是很古老的,发生在脊索动物的共同祖先与灵长类动物的共同祖先之间的某段时间。

       研究发现的结论也让研究者震惊——

       领导本次研究的剑桥大学化学工程与生物技术系的Alastair Crisp说,“这是第一个表明基因的水平转移会发生在多么广泛的动物——包括人类——身上的研究,它可能会涉及到几十个甚至几百个活性的‘外来’基因。令人惊讶的是,这种现象绝非罕见,很多动物,有可能是所有动物的进化过程中都会涉及到基因的水平转移,并且这个过程还在继续。我们可能需要重新思考进化的过程。”

       他们的分析甚至可能低估了动物发生基因的水平转移的真正程度,因为复杂的多分子生物之间也可能发生直接的基因转移,我们已经在某些寄生关系中发现了这样的转移。

       这项研究还可能影响更广泛的基因定序。以前的基因组计划经常假设细菌是一种污染,所以将它们从结果中排除。

       “当我们进行基因定序的时候,筛选出哪些是污染是非常重要的。但是我们的研究显示,我们不应该忽视,细菌的基因序列也可能通过基因的水平转移成为动物基因的一部分,”化学工程与生物技术系的Chiara Boschetti博士补充说。

    




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