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2015年5月13日，来自华大基因、瑞典歌德堡大学、丹麦哥本哈根大学及其他机构的研究人员完成了婴儿从出生至一岁期间肠道菌群的基因组研究。这项研究为了解发育早期肠道菌群与人体的相互作用建立了基础。此外，研究人员还完成了参考基因集，并从样本群体中组装了4000多个微生物的基因组草图，这是婴儿肠道微生物研究的重要资源。 肠道菌群与人类健康的息息相关，但目前尚未有对发育早期的肠道微生物的量化和功能性研究。在本项研究中，研究人员采用宏基因组鸟枪测序技术对98个瑞典产妇的粪便及婴儿的粪便进行分析，其中十五例为剖腹产。他们分别采集了新生儿、4个月、12个月共三个时期的婴儿样本。 为了了解母亲肠道菌群对于婴儿肠道菌群的影响，研究人员比较了新生儿与其母亲的微生物种类。研究人员发现，顺产婴儿体内72%的早期微生物与母亲样本吻合，这些微生物的41%可在剖腹产婴儿中找到。结果表明，大多数新生儿肠道微生物可能来源于母亲。 研究人员还发现出生方式和喂养方式对婴儿早期肠道菌群向成人的菌群发展起着重要的作用。母乳喂养与奶粉喂养的婴儿肠道菌群存在差异。在婴儿发育过程中停止母乳喂养比引入固体食物对婴儿肠道菌群向成人的菌群发展具有更大的促进作用。满一岁仍进行母乳喂养的婴儿的“微生物年龄”比停止母乳喂养的婴儿要小。研究结果表明，母乳喂养对早期肠道微生物的群落形成有着长期的影响，对新陈代谢和免疫健康方面存在可能的影响。 此外，研究人员对婴儿出生一年间肠道菌群微生态的特征进行了分析，并确定了顺产婴儿及剖腹产婴儿不同年龄段的标志性微生物群落。而且顺产婴儿和剖腹产婴儿各个阶段的微生物群落不一样。 研究还发现，与顺产婴儿的肠道微生物相比，剖腹产婴儿微生物中的抗生素耐药基因含量更高。 华大基因CEO王俊表示，早期肠道菌群的研究成果让人兴奋。人类的肠道微生物就像一个魔术盒子，充满了惊喜。这项研究将鼓励华大基因继续努力了解人类自身，并获得更多的科学发现。
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