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pubmed中的文献查询利器 ─ MeSH 基本介绍

 医学英语BJ 2015-12-22
另一种限缩查另一种限缩查另一种限缩查

pubmed中的文献查询利器 ─ MeSH 基本介绍

台大图书馆2014-12-19浏览:3282次
全称:「Medical Subject Headings」,一套生物医学领域的主题词表,是一种索引典,每个主题词 (以下称 MeSH Term) 代表特定的主题范畴。使用者可透过 MeSH Terms 查询文献。

前面我们介绍过 PubMed 中的「自然语言查询方法」,接下来要介绍另外一种「以 MeSH 查询」的方式。平常我们在搜寻引擎中查询文献,想到什么就打什么,虽然简单方便,但难以避免以下问题:


用词不一致:同样指禽流感,有人使用「bird flu」,有人使用「avian flu」,需将相同概念的各式同义词、狭义词搜集完善,查找文献才不会遗漏。


需过滤不相关文献:我们输入的关键字可能命中文章某处,但完全非文章重点,需花大量时间过滤「出现这个字但实际上并不相关」的文章。


这些问题在「以 MeSH 查询」的方法中,应可获得一定程度的改善。


【关于 MeSH?】


全称:「Medical Subject Headings」,一套生物医学领域的主题词表,是一种索引典,每个主题词 (以下称 MeSH Term) 代表特定的主题范畴。


建置单位:美国国家医学图书馆(NLM)。


MeSH 用来作什么:从两种角度来说


组织文献:用于标示文献内容主题。专家阅读文献后,根据内容,标注适当的 MeSH Terms 。


查询文献:使用者可透过 MeSH Terms 查询文献。


【MeSH 的组成】


MeSH 包含了以下不同性质的词组 (terms) :


【Headings (主标目)】:又称「main headings」或「descriptors」。总计超过 26,000 个主题词标目,以树状结构(tree structure)呈现阶层组织。最上层分为16大类,各大类之下又再分为下层主题,可显示其类属关系。越上层的词汇意涵越广,越下层的词汇越专指,彼此互为广义词 (broad terms) 及狭义词 (narrow terms) 关系。以下图为例:



「Ovarian Cysts」(卵巢囊肿)这个词依序是隶属于「Diseases Category」(疾病)→「Neoplasms」(肿瘤)→「Cysts」(囊肿),其下还有「Polycystic ovary syndrome」(多囊卵巢综合征) 等更专指的词汇。


【Subheadings (副标目)】:又称「qualifiers」。「副标目」依附于「主标目」,用于描述文献中着重的面向或应用。例如,同样被标注「Lymphoma」(淋巴癌) 这个主标目的文献,有的着重于「therapy」(治疗),就会加上副标目「therapy」,标示为「Lymphoma / therapy」;有的着重「pathology」(病理),就会加上副标目「pathology」,标示为「Lymphoma / pathology」。


【Supplementary Concept Records (SCR)】 :主要为物质(药物)词表,也包含部分程序(protocols)与罕见疾病名称。有些新的物质尚未成为主标目,会列入「Supplementary Concept Records」作为补充词汇,用以补充 MeSH 词汇的完整性。


【Publication Characteristics】:描述文献类型。


【Check tags】:针对文中物种的特殊分类,例如:人类或其他物种、性别、年龄区间等。可供使用者于查询结果中针对特定的分类筛选。


【Pharmacological Action Terms】:自1996年起,PubMed 会在文章的 MeSH 栏位中标注「Pharmacological Action」,以呈现该物质于文章中的药理作用为何。


【 MeSH 的标注过程】


每篇新进到 PubMed 数据库的文献,经由领域专家详细阅读后,依据内容主题,选择适当的「MeSH Terms」予以标注。


有标注「*」号的「MeSH Terms」,为文中主要探讨的内容;未标注「*」表示为次要主题。



【如何用 MeSH 查询文献?】


使用 MeSH 查询文献,基本上我们可以透过以下步骤:


1、将您的查询需求化为具体的陈述句。

2、从这个陈述句中,抓出主要概念,作为查询关键字。

3、将这些关键字分别放到 MeSH Database 中,比对出最接近、适当的 MeSH Terms。

4、将所找到的 MeSH Terms ,依陈述句中的逻辑,以「AND」「OR」「NOT」组合成检索策略。

5、当检索策略完成,点选「Search PubMed」送入 PubMed 查询。


MeSH 有独立的查询入口,请先进入PubMed首页中的「MeSH Database」:



输入关键字,系统会自动比对出所有您可能想查询的相关 MeSH terms:



点选特定的 MeSH Term 后,会进入该 MeSH Term 的专页,请留意以下 5 项信息:



  1. Scope Note:说明这个 MeSH term 是什么意思、指涉的内容为何。

  2. Subheadings:即前段介绍的「副标目」,可针对需求勾选限缩。假设勾选了「Therapy」,就表示限缩在该主题在治疗方面的文献。若不了解某些副标目代表什么意思,可参考「副标目一览表」。若不勾选,就代表不以副标目限缩。

  3. 限缩查询:是另一种限缩查询,详细请参考「这篇文章」。

  4. See Also:其他相关 MeSH Terms ,可进一步点选参考是否符合所需。

  5. 树状结构词表:可看出该 MeSH Term 的上下层词汇。


确认该词汇就是您要查的 MeSH Term 后,点选右方「Add to Search Builder」,即可添加查询指令至空白方框中:



若希望结合其他 MeSH Term 一起查询,在不关闭视窗的状况下,继续于上方查询框输入下一个词汇,找到后,先选择结合逻辑(AND、OR、NOT),再点选「Add to Search Builder」,添加查询指令:



确认想查询的 MeSH Terms 都已经添加完成后,点选「Search PubMed」,即可将指令送入 PubMed 查询:




网站编辑:sun
标签: pubmed数据库   pubmed   MeSH    

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