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小明进入实验室两个月后，老板把他叫过去了：“我们这个蛋白即影响MDM2也影响P53，你去查查哪些蛋白能影响这两个蛋白，把这些共同作用的蛋白都找出来” 小明点头哈腰的说“是，是，是，我马上就去查，明天向您汇报！”。 “终于不用天天刷瓶子洗罐子了，属于我的时代已经来临！我要准备大干一番，显示我超凡的科研能力”小明心里暗自说道。 当然，找资料得上pubmed，别人上pubmed都是百度搜索pubmed，小明当然不能和他们一样，直接在浏览器下面输入https://www.ncbi.nlm./pubmed/，一个字符都不带差的，然后再潇洒用力地敲了下回车键，他觉得只有这样才能显示他的与众不同、独特的个性、恣意妄为的人生观。再在搜索框里面输入“p53 MDM2”，一切显得这么自然，如鱼得水！ 到此你可能会想到今天介绍的是Pubmed的使用了，No，今天我们介绍一个既能装逼又实用的软件Cytoscape。今天我们就来学学如何用cytoscape来搜索基因之间相互作用。我们先看看这个软件能够做出的结果图是怎样的：
1. 首先我们要下载cytoscape这个软件，打开http://www.，有没有被这个背景图惊艳？ 在安装cytoscape之前还需要安装一个jre 8，这个是一个java运行的环境： 注意根据你的系统选择不同的java8. 2. 安装好了之后打开的界面如下： 3. Cytoscape所有的功能都是app插件模式，我们需要哪一种功能就安装哪一种，我们点击菜单栏“Apps->App manager”，如下图所示，选择“AgilentLiteratureSearch”，并安装。 4. 安装好了之后，你可以在菜单栏的App下面出现一个 Agilent Literature Search，点击打开： 5. 在上面弹出的窗口中，在Terms输入框内输入你要搜索的基因名字，如“p53”，多个基因按回车区分，然后其他不用理会，直接上图中红色箭头所指位置，稍等片刻： 6. 上图中红色框内就是搜索到相关的文献。 此时回到cytoscape主界面： 7. 这已经把他们之间相互作用的网络显示出来了，修改左边的“style”调整线条和字体。如下：
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