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最近在做启动子区的克隆，真的是很让人恼火啊，前前后后差不多快两个月了，实验还是没有太大的进展，PCR得到的条带不是很理想，而且非特异性条带特别的多，让人欲哭无泪啊。不过最近运气不错啊，得到高人指点迷津，发现了之前的一直忽视而又没想到的问题，淘了点非常不错的酶，实验还行，心情也跟着舒畅许多！我想跟道友们分享的是一定要向会的人多请教，高人一句话，肯定胜过自己瞎琢磨。而且要仔细分析，才能不忽视重点。呵呵，啰嗦了。 对于基因启动子，可以按照本贴提供的第二种方法进行查找，如果道友们不放心的话，也可以自己用启动子分析软件进行分析。根据启动子的定义，本着不漏过错过的原则，可以选择基因翻译起始位点（ATG）上游4000bp下游1000bp共5000bp的碱基片段进行分析。综合多篇相关文献提供的启动子分析软件，可以用到FirstEF（http://rulai./tools/FirstEF/）、PromoterScan(http://www-bimas.cit./molbio/proscan/)、Berkeley Drosophila Genome Project （http://www./seq_tools/promoter.html）、softberry-fprom(http://linux1./berry.phtml?topic=fprom&group=programs&subgroup=promoter)及promoterInspector进行分析。其中最好的应该是promoterInspector，许多篇文章都直接采用的是这个软件的分析结果，但有点遗憾的是这个软件是收费的，试用前也要先注册，我很想用这个软件的，如果哪位道友能够提供相关帮助的话，将不胜感激啊。总得说来，我前面提到的ARTS基因用上述软件分析的启动子序列与genecopoeia公司给出的启动子序列还是吻合的，这里就不在详细介绍上述各软件的分析情况，很简单的。对于转录调控元件的分析，我也不是很懂，实验还没做到那一步，以后做到了再说  。
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