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【资源】miRNA数据库及靶基因分析软件 miRNA数据库及靶基因分析软件1.miRBase: http://www.mirbase.orgmiRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要...
手把手教你设计引物(图文并茂) 不知不觉几年下来自己也快毕业了,感谢丁香园这些年来的帮助。以cDNA为例,普遍的一种方法是上PUBMED中GENE栏搜索找到cDNA那栏,但PUBMED导出序列不太方便,我介绍个网站 http://asia.ensembl.org/index.html 1. 输入目的基因,进入。7. 然后根据可以根据你感兴趣的序列设计引物了,比如我在分别在第6和第7外显...
对于基因启动子,可以按照本贴提供的第二种方法进行查找,如果道友们不放心的话,也可以自己用启动子分析软件进行分析。根据启动子的定义,本着不漏过错过的原则,可以选择基因翻译起始位点(ATG)上游4000bp下游1000bp共5000bp的碱基片段进行分析。总得说来,我前面提到的ARTS基因用上述软件分析的启动子序列与genecopoeia公司给出的启动子序...
新技术捕获miRNA靶标。一项称为miR-TRAP的简单新技术可以捕获这一复合物,从而使研究人员更易于鉴别出miRNA的靶标。Rana 说:“这种方法可以被广泛应用于生理条件下任意数量的疾病模型中发现miRNA靶标。miR-TRAP将有助于在RNA领域的缺口处搭起桥梁,使研究人员能够更好地了解诸如癌症等疾病,靶向它们的遗传基础开发出新的诊断和治疗策略。随着...
搞懂环状RNA(circRNA),看这篇就够了。环状RNA研究的历史?(3)与传统的线型RNA(linear RNA,含5'和3'末端)不同,circRNA分子呈封闭环状结构,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比线性RNA更稳定;一种模型认为pre-RNA 的转录过程中由于RNA发生了部分折叠,拉近了原本非相邻的外显子,从而发生了外显子跳跃( exon skipping ) ,使得被跨越的区域形...
闵家胤先生具体从六个方面论证了人类知识的“哲学的科学化”过程:①各门科学在哲学的体内孕育成熟,先后都自立门户,哲学被科学瓜分了,哲学的领地被科学化掉了;这种方法,看到的仅仅是科学和哲学相互作用和相互转化的一个方向,他并没有看到,科学和哲学的具体内在融合的统一性关系,在这种统一性的关系中,“哲学的科学化”同时也具有“科学...
(2) circRNA分子呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响,比线性RNA更稳定, 不易被降解; (3)许多circRNA表达水平与线性RNA的表达水平相当, 一些circRNA的表达水平甚至超过它们的线性异构体10倍; (4)大多数来自蛋白质编码基因的外显子; (5)一些circRNA拥有 MRE,能与miRNA相互作用; (6)大部分是非编码RNA。除了与miRNA相互作用外,circRNA至少还可能...
中科院陈玲玲最新Nature综述:环状RNA的秘密。与线性RNA相比,环状RNA受到的关注比较少,也比较难于研究。举例来说,环状RNA很难与其它RNA区分开,扩增或片段化会破坏RNA环,而且早期RNA测序的分析算法会过滤掉环状RNA的标志性序列。环状RNA呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响不易降解,比线性RNA稳定得多。越来越多的证据表明,环状RNA具有重...
Cell:发现ADAR1酶在RNA编辑和RNAi中的新机制。ADAR1在RNA编辑和RNAi中的功能是不同的,这主要是通过分别形成ADAR1/ADAR1同源二聚体或者Dicer酶/ADAR1异源二聚体复合物来实现的。siRNA不仅能引导RISC切割同源单链mRNA,而且可作为引物与靶RNA结合并在RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRP)作用下合成更多新的dsRNA,新合成的dsRNA再由...
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