精准医学之肿瘤研究，不可不知道的数据库！

导语：作为在生信领域混迹多年的业内人士，如果有人问我，今年生命科学最火的领域是什么，我会毫不犹豫地回答：精准医学！

再问：精准医学里面最火的又是什么？

再答：确定肯定以及一定就是肿瘤精准医学了！

大家注意到了吗？最近几年，与肿瘤精准医学相关的会议、报道、文章，简直就是铺天盖地，再加上名人效应的发酵，好不热闹，如果你是做肿瘤研究的，却没有跟“精准”沾上点边，都会怀疑自己是不是out了！

热闹归热闹，利用精准医学的研究手段攻克肿瘤疾病是一个长远而艰巨的目标，它需要我们静下心来，脚踏实地地一步步推进！

今天，我就来给大家提供一些肿瘤研究领域最常用的数据库资源。在大数据时代，数据就是金矿！是我们研究成败与质量的重要因素！

以下重要的数据库，值得关注！ 

1、COSMIC：主要记录与人类各种类型癌症相关的体细胞突变信息，这个数据库对于突变位点的信息记录较为详细，包括文献出处、样品名称、组织类型、涉及到的癌症种类和具体的突变内容，这个库既有对某一基因突变现象的综合统计，也有对针对某一肿瘤组织或癌症细胞系的所有突变信息统计。这个数据库对学术是免费的，但是商业用途需要支付一定的费用。

官网链接：http://cancer./cosmic 

2、ClinVar： 美国NIH维护的一个免费数据库，旨在对生殖细胞和体细胞的变异进行临床解释，用得很广泛，做这方面生物信息研究的人几乎都用过这个数据库。

官网链接：http://www.ncbi.nlm./clinvar/

3、HGMD：人类基因突变数据库。从1996年开始，由英国Cardiff的医学遗传研究所维护，来源主要是文献上的由遗传所引起的疾病的种系变异。两年前的版本是免费的，但是有近两年的更新的版本需要收费。

官网链接：http://www.hgmd./ac/index.php

4、OMIM：在线人类孟德尔遗传信息，从1960年开始，由约翰霍普金斯大学医学院的研究人员维护，有2万左右的人类基因和遗传疾病的详细目录。OMIM包含了支持基因与疾病关系和疾病机理的代表性基因变异。也是免费的。

官网链接：http://www./

5、The Cancer Genome Atlas（TCGA）：由美国国立癌症研究所和国家人类基因组研究所（National Human Genome Research Institute，NHGRI）资助，关注与癌症的发生和发展相关的分子突变图谱。

官网链接：http://cancergenome./ 

上面几个是最常用的，其实类似的数据库还有很多，它们各有侧重，参考《肿瘤生物信息学数据库》里面的资料，以下列表你一定用得上：

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