【原】灰度分析和细胞计数神器：Image J(附软件下载)

作者：解螺旋·叶子

如需转载请注明来源：解螺旋·医生科研助手

导语

Image J是NIH推出的分子生物分析软件，使用方便，简单易学。与PS比起来，Image J有个强大的优势，就是分析处理的结果比较受到普遍承认，不会被怀疑作假（小保方晴子哭晕在厕所）。

Image J用于生物医学领域最多的就是条带灰度值分析（DNA电泳或者Western Blot条带分析）和细胞计数。来具体看看怎么操作。

条带灰度值分析

打开Image J软件，在File里打开图片，并且转化为8-bit灰度图(Image→Type→8bit)。

方框工具选择并画出条带，然后选择Analyze→Gels→Select First Lane。

最后按Analyze→Gels→plot Lanes，就会出现山峰样图。

但这样是不够的，要把每个山峰分开。这就用到了直线功能，把下面都封口后点击"魔棒"。分别点击每个峰下方的区域，在"Results" 里就会出现面积，表示相应条带的灰度值。

如果要测多个条带的灰度，就用在Select First Lane后，点Select Next Lane来复选。这里注意，每个框的形状大小必须是一样的。

分析图像中的颗粒数(细胞计数)

打开Image J软件，在File里打开图片，并且转化为8-bit灰度图(Image→Type→8bit)。

这种黑底的图数起来非常困难，需要反相下变成白底图。框定区域后，选择Edit→Invert。

比之前清楚多了吧，再设置下阈值（Image→Adjust→Threshold）。经过调整后对比非常明显。

最后，进入 Analyze→Analyze Particles, 键入微粒大小的下限和上限，并且选择显示轮廓（Show outlines）和显示结果(Display Results)。点击ok，被计数的微粒将显示轮廓和编号。每个微粒的结果在结果窗口中被显示。

比起自己数可快多了。

回复"IJ"可下载软件。