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壶菌门(Chytrdiomycota) 壶菌纲 (Chytrdiomycetes) 节壶菌属(Physoderma) 结合菌门 根霉属 Rhizopus 毛霉属 Mucor 梨头霉属 Absidia 笄霉属 Choanephora 子囊菌 白粉菌目 单丝壳属 Sphaerotheca 叉丝单囊壳属Podosphaera 布氏白粉属 Blumeria 白粉菌属 Erysiphe 钩丝壳属 Uncinula 叉丝壳属 Microsphaera 球针壳属 Phyllactinia 内丝白粉属 (Leveillula) 核菌 赤霉属Gibberella 麦角菌属 Claviceps 长喙壳属 Ceratocystis 小丛壳属 Glomerella 疔座菌属Polystigma 顶囊壳属 Gaeumannomyces 黑腐皮壳属 Valsa 绿核菌属 Ustilaginoidea 小煤炱属Meliola 腔菌 多腔菌目Myriangiales 痂囊腔菌属 Elsinoe 座囊菌目Dothideales 球腔菌属 Mycosphaerella 球座菌属Guignardia 格孢腔目Pleaporales 旋孢腔菌属 Cochlioblus 格孢腔菌属 Pleospora 黑星菌属Venturia 盘菌 核盘菌属 Sclerotinia 担子菌门 柄锈菌属(Puccinia) 胶锈菌属（Gymnosporangium) 多胞锈菌属（Phragmidium ） 单胞锈菌属（Uromyces ） 层锈菌属（Phakopsora） 栅锈菌属（Melampsora） 黑粉菌属(Ustilago) 条黑粉菌属(Urocystis ) 叶黑粉菌属(Entyloma) 腥黑粉菌属( Tilletia ) 轴黑粉菌属(Sphacelotheca) 尾孢黑粉菌属(Neovossia )
半知菌 丝核菌属Rhizoctonia 小菌核属Sclerotium 丛梗孢属Monilia 轮枝孢属Verticillium 曲霉属Aspergillus 粉孢属Oidium 青霉属Penicillium 链格孢属Alternaria 梨孢属Pyricularia 葡萄孢属Botrytis 尾孢属Cercospora 褐孢霉属（Fulvia） 枝孢属Cladosporium 内脐蠕孢属Drechslera 平脐蠕孢属Bipolaris 突脐蠕孢属Exserohilum 弯孢属Curvularia 黑星孢属Fusicladium 柱隔孢属Ramularia 镰孢属(Fusarium ) 绿核菌属(Ustilaginoidea ) 炭疽菌属(Colletotrichum ) 痂圆孢属(Sphaceloma) 盘二孢属(Marssonina ) 茎点霉属（Phoma） 叶点霉属(Phyllosticta ) 拟茎点霉属(Phomopsis) 大茎点菌属(Macrophoma ) 壳囊孢属(Cytospora) 壳二孢属(Ascochyta ) 色二孢属(Diplodia) 壳针孢属(Septoria) 根肿菌 根肿菌属 Plasmodiophora 粉痂菌属 Spongospora 多黏霉属 (Polymyxa) 卵菌 水霉属(Saprolegnia) 绵霉属(Achlya) 腐霉属 (Pythium) 疫霉属(Phytophthora) 霜疫霉属(Peronophythora) 指梗霉属(Sclerospora) 霜霉属(Peronospora) 单轴霉属(Plasmopara)也称直梗霉属 假霜霉属(Pseudoperonospora) 盘梗霉属(Bremia)
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