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 1964-1995年，尤里·格里戈洛维奇（Yuri
Grigorovich）出任大剧院的艺术总监，从此大剧院的芭蕾舞剧揭开了新的一页，几乎每一部新作品都充满了对艺术新的追求和探索。他的舞剧注重戏剧结构，舞蹈场面丰富多采，动作设计新颖流畅，吸收了许多俄罗斯民间舞素材。他编导的《宝石花的传说》（1959）和《爱情的传说》（1965）被认为是苏联芭蕾史上里程碑式的作品，曾在国内外许多舞台上演出，受到一致赞扬，被认为是继承古典芭蕾遗产并加以创新的成功之作。从《宝石花的传说》中已有萌芽的交响舞蹈手法，此后他即探索交响化手法，在以后的代表作《英雄诗篇》（1964）、《斯巴达克斯》（1968，获列宁奖金）、《伊凡雷帝》（1975）、《安加拉河》（1976，获苏联国家奖金）《黄金时代》（1982）等中交响化手法进一步发展。与此同时，格里戈罗维奇在继承发展俄罗斯古典芭蕾传统方面作出不少贡献，他重新编排的古典芭蕾舞剧《睡美人》（1963和1973）、《胡桃夹子》（1966）、《天鹅湖》（1969）、《蕾蒙达》（1984）、《吉赛尔》（1986）等，还两次重排普罗科菲耶夫的舞剧《罗密欧与朱丽叶》（2幕版本，1978；3幕版本，1979）。在这些新演出本中，格里戈罗维奇努力从音乐内涵出发，追求音乐与舞蹈的有机结合，体现出时代精神，揭示原作深刻的哲理性和诗的意境，交响编舞法在其中
Yury Grigorovich after
receiving the Order of
Merit for the Fatherland
award in 2007.
得到了广泛和充分的运用，同样倍受欢迎。在编舞时，他擅长以精练的舞蹈语汇，具体形象地刻画人物的性格特征和内心感受，常用人数众多、变化无穷的群舞场面烘托整体演出气氛，凝聚戏剧矛盾高潮，因此许多作品呈现出震撼人心的史诗般气魄。在此期间成功推出了许多杰出的舞蹈家，包括；埃卡泰里纳·吉尔特兹（Yekaterina
Geltzer），瓦西里·蒂霍米罗夫（Vasily Tikhomirov）和玛丽娅·普利谢茨卡娅（Maya
Plisetskaya）。大剧院把格里戈罗维奇的交响芭蕾的代表作《宝石花的传说》和《爱情的传说》列入保留剧目。2008年，格里戈罗维奇重新担任莫斯科大剧院芭蕾舞团的总编导。
1995- 1998年，弗拉基米尔·瓦西里耶夫（Vladimir
Vasiliev）担任莫斯科大剧院芭蕾舞团的艺术总监。大剧院的创作趋势是邀请国外的导演和演员参加大剧院剧目的演出：芭蕾舞《巴黎圣母院》、肖斯塔科维奇的《明亮的小溪》（拉特曼斯基，2003年）。这期间还恢复了柴科夫斯基的《天鹅湖》、格拉祖诺夫的《雷蒙达》、梅利科夫的《爱情传奇》（编导：格利戈洛维奇）等剧目的演出。
1998-2000年，阿列克谢·法捷耶契夫（Aleksei Fadeyechev）成为艺术总监。
2000-2003年，鲍里斯·阿基莫夫（Boris Akimov）被任命为艺术总监。
今日的莫斯科大剧院芭蕾舞团，以华丽精湛的群舞技巧和壮观逼真的布景和服装仍然是世界上最著名及最大的芭蕾舞团。莫斯科大剧院芭蕾舞团的演出风格，已经发展成为非同一般的的表演风格：长期以来莫斯科大剧院芭蕾舞团在世界芭蕾舞坛屹立不摇的地位，其舞者在表演时，作重在体能和情绪的展现，艺术风格热情洋溢、技巧出众，富于俄罗斯民族色彩，更加丰富多彩并爆发外放的典型特征，整个舞团的演出雍容华贵，场景浩大，格调高雅，有着史诗一般的氛围，结合技术和舞台的表现能力来展现强烈的戏剧性。这种风格通常归因于戈尔斯基在莫斯科大剧院与圣彼得堡马林斯基芭蕾舞团在历史上竞争的传统，而玛丽娅芭蕾舞团是纯洁和精致典雅、古典更西方化。
芭蕾舞团拥有约220名舞者，其中群舞演员约为120名。芭蕾舞团的运作是一个分级系统，与其他欧洲主要的芭蕾舞团采用的方法类似，作为主要演员（Principals）是排名高级的舞者，依次是首席独舞（Lead
Soloist），第一独舞（First Soloist），独舞（Soloist）和群舞（Corps de
Ballet）。由于其规模较大，芭蕾舞团设有两个芭蕾舞剧团在运作。主要任务是参与大剧院芭蕾，歌剧中的舞蹈演出，拥有如此庞大的编制，也说明是于有一所专业教学以及严格训练的附设舞蹈学校息息相关，舞蹈学校学制分6年制和9年制两种，自1961年还开办了两年制的舞蹈教师进修班。教学内容以芭蕾为主，另设有5年制的民间舞蹈专修科。
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