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把众多的细菌分为两大类，革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。
常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、李式杆菌属、丹毒丝菌属、肾杆菌属、芽孢杆菌属、梭菌属、分歧杆菌属、放线菌属、奴卡菌属、棒状杆菌属、红球菌属、丹毒杆菌、气肿疽杆菌、结核杆菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等；
常见的革兰氏阴性菌有:伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布式杆菌、流感副流感杆菌、卡他杆菌、不动杆菌属、耶尔森菌属、嗜肺军团菌、绿脓杆菌、（副）百日咳杆菌、志贺菌属、巴斯德菌属、霍乱弧菌、副溶血性杆菌及脑膜炎双球菌等。
G+ 球菌：金黄色葡萄球菌（葡萄球菌属）、乙型溶血性链球（链球菌属）、
肺炎链球菌（链球菌属）
G—球菌：淋球菌、脑膜炎双球菌（奈瑟菌属）
G+ 杆菌：白喉杆菌（棒状杆菌属）、结核杆菌（分歧杆菌属）抗酸菌
麻风杆菌（分歧杆菌属）抗酸菌
G—杆菌：大肠杆菌（埃希菌属）、伤寒杆菌、副伤寒杆菌、 志贺痢疾杆菌、
福式痢疾杆菌、宋内痢疾杆菌（志贺菌属）、百日咳杆菌（包特菌属）、
肠炎杆菌（沙门菌属）、绿脓杆菌（假单胞菌属）、
在治疗上，大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感；而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感，而对链霉素、氯霉素等敏感。所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌，在选择抗生素方面意义重大。
附：革兰氏阳性细菌和阴性细菌感染可选药物清单
一、革兰氏阳性细菌
1.主要抗革兰氏阳性菌的抗生素与抗菌药
青霉素类：青霉素G，青霉素V
耐青霉素酶的青霉素：唑西林，邻氯西林，二氯西林，氟氯西林，甲氧西林，萘夫西林等
内酰胺酶抑制剂合剂：阿莫西林／克拉维酸，氨苄西林／舒巴坦，氨苄西林／舒巴坦等
大环内酯类： 一代：红霉素，柱晶白霉素，乙酰螺旋霉素，麦迪霉素
二代：罗红霉素，克拉霉素，阿奇霉素，地红霉素
林可霉素类：林可霉素，克林霉素
链阳霉素类：奎奴普丁／达福普汀
糖 肽 类：万古霉素，去甲基万古霉素，替考拉宁
嗯唑烷酮类：利奈唑酮
其 他：利福平，夫西地酸，杆菌肽
2.具有良好抗革兰氏阳性菌作用的广谱抗生素与抗菌药
广谱青霉 素：氨苄西林，阿莫西林
头 孢 菌 素：第一、二、四代头孢菌素
碳 青 霉 烯：亚胺培南，培尼培南，美洛培南
青 霉 烯：法罗培南
氨 基 糖 苷：庆大霉素，阿米卡星，阿贝卡星
四 环 素 类：多西环素，米诺环素
其他类抗生素：氯霉素，甲砜霉素，磷霉素
氟喹诺酮：环丙沙星，氧氟沙星，托氟沙星，司帕沙星，莫西沙星，加替沙星
磺 胺 类：磺胺甲嗯唑／甲氧苄啶(SMZ/TMP)
3.抗结核分枝杆菌的药物
链霉素，异烟肼，利福平，乙胺丁醇，吡嚓酰胺，对氨基水杨酸
4.抗革兰氏阳性厌氧菌的药物
抗生素：青霉素，大环内酯，克林霉素，多西环素，β-内酰胺酶抑制剂合剂
硝基咪唑类药物：甲硝唑，替硝唑
难辩梭菌：甲硝唑(口服)，万古霉素(口服)，杆菌肽(口服)
5.抗放线菌的药物
青霉素，大环内酯，克林霉素，多西环素
二、革兰氏阴性细菌
1.具有良好抗革兰氏阴性细菌作用的广谱抗生素
广谱青霉素类：氨苄西林，阿莫西林
对铜绿假单胞菌有效的广谱青霉素类：羧苄西林，磺苄西林，美洛西林，哌拉西林，
阿帕西林，天冬西林
头孢菌素类：第一、二、三、四代头孢菌素
头 霉素 类：头孢西丁，头孢美唑，头孢替坦，头孢米诺，头孢拉腙
β-内酰胺酶抑制剂复合剂类：阿莫西林/克拉维酸，替卡西林/克拉维酸，氨苄西林/舒巴坦，
阿哌拉西林/三唑巴坦
碳青霉烯类：亚胺培南，帕尼培南，美洛培南，比阿培南
青 霉 烯类：呋罗培南
氨基糖苷类：链霉素，卡那霉素，庆大霉素，妥布霉素，小诺霉素，西索米星，福提霉素，
大观霉素，依替米星，阿贝卡星
四环素 类：四环素，多西环素，米诺环素
其他类抗生素：氯霉素，甲砜霉素，磷霉素
2.具有良好抗革兰氏阴性细菌作用的广谱抗菌药
喹诺酮类：诺氟沙星，环丙沙星，氧氟沙星，左氧氟沙星，司帕沙星，莫西沙星
加替沙星
磺胺与甲氧苄啶类：SIZ，SMZ，SD，SMD，SASP，SMZ/TMP，溴莫普林
硝基呋喃类：呋喃妥因，呋喃唑酮，呋喃西林
3.主要抗革兰氏阴性菌的抗生素与抗菌药
脂酰化环肽类：多粘菌素，多粘菌素
脒型与甲氧基型青霉素类：匹美西林，巴美西林，替莫西林
专抗铜绿假单胞菌的头孢菌素类：头孢磺啶
单环β-内酰胺类：氨曲南，卡芦莫南
4.抗革兰氏阴性厌氧菌的药物
抗 生 素类：多西环素，β-内酰胺酶抑制剂合剂
硝基咪唑类：甲硝唑，替硝唑，奥硝唑
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