马云说：阿里巴巴能到今天，全靠一份坚持和运气

1999年以马云为首的18人在马云位于杭州市的公寓内创立阿里巴巴集团；集团的首个网站是英文全球批发贸易市场阿里巴巴，阿里巴巴集团推出专注于国内批发贸易的中国交易市场（现称“1688”）

1999年10月，在马云的积极奔走之下，阿里巴巴集团从数家投资机构融资第一笔投资500万美元。2000年1月，距离第一笔融资3个月后，阿里巴巴集团从软银等数家投资机构融资2,000万美元

2000年9月，阿里巴巴集团举办首届西湖论剑，马云、王志东、丁磊、张朝阳、王峻涛为代表的互联网精英讨论业界重要议题，马云甚至把金庸邀请过来当嘉宾。当天，马云穿的是短袖的白衬衫；丁磊穿着一件牛仔衬衫，还是没穿袜子；张朝阳照例穿他的搜狐广告衫，可能想为搜狐再增加些眼球的注意力；王峻涛刚下飞机就买了两条绸缎对襟衫，明里为金大侠拜寿，实际上想“骗取”金大侠的签名。

2001年，成立第三年时，阿里巴巴确定了自己的使命和价值观，年底注册用户数量超过100万。2002年12月，成立第四个年头时，阿里巴巴实现了正向现金流，公司跨越了第一个财务里程碑。

2003年，非典爆发了，阿里巴巴集团于非典型性肺炎爆发、所有员工接受隔离期间照常运作，马云带领阿里员工日夜奋战，在自己的公寓中创立了淘宝网，结果由此一炮走红，非典成就了阿里巴巴第一块基石。

2004年7月，淘宝网发布让买家与卖家进行即时文字、语音及视频沟通的PC版通讯软件阿里旺旺。这一年的12月，现时为阿里巴巴集团关联公司的第三方网上支付平台支付宝推出。

快速发展的阿里巴巴成为资本市场的宠儿。2005年8月，阿里巴巴集团与雅虎达成战略合作，雅虎以10亿美元加上雅虎中国的全部资产兑换阿里巴巴集团39%普通股(完全摊薄),并获得35%投票权，交易完成后，雅虎也成为阿里巴巴集团最大的股东，并获得其董事会四个席位中的一席。同时持有雅虎和阿里巴巴股份的软银，被认为是这场交易中最大的受益者。2005年10月，阿里巴巴接管了雅虎中国。

2007年11月6日，主营B2B业务的阿里巴巴网络有限公司在香港联交所主板挂牌上市，开盘价30港元，比发行价高出122.2%。以此计算，市值达到1515.7亿港元。马云在接受采访时表示，“至今只会收发电子邮件和上网找信息，就连使用DVD都有困难，更从未在网络上买过一样东西，阿里巴巴能到今天的地步，全靠1份坚持和运气。阿里巴巴能在内陆市场写下好成绩，是因为内陆IT环境不成熟，包括IT人才亦有所欠缺，中小企业无法打造自有的网络环境，给阿里巴巴的发展提供了机会。”