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难道研究这个真的会火?

 微笑如酒 2017-04-17

2017-04-17 

聊聊跟科研有关的感想心得,如基金,文章和实验。

没错,今天聊的是“微肽”。

lncRNA编码能力早有耳闻,2002年就有研究者发现lncRNA能编码微肽的现象,并且这些编码的微肽均有一定的功能。时隔多年,Eric Olson于2015年报道了一条在现有定义下的lncRNA(lncRNA要不要改名啊喂,这篇文章可能颠覆你对lncRNA的理解……),它在骨骼肌中特异性表达,其序列中含有编码区域,并且验证其可编码一种微肽,该多肽长度为46个氨基酸,其结构与受磷蛋白、肌脂蛋白类似,可抑制SERCA表达。SERCA 是一种跨膜10 次的阳离子转运ATP ,在心肌细胞钙稳态的调节中其重要作用。这表明lncRNA编码的微肽在生理或生物学中能起到很重要的调控作用。

Eric Olson发现LINC00948含有ORF,并且这块ORF区域能编码一条微肽(MLN),通过ISH检测到在骨骼肌中的表达

2016年,Eric Olson又在Science上报道了另一条lncRNA编码微肽的能力。LOC100507537的ORF能编码一条含有34个氨基酸的微肽(DWORF),其在小鼠心脏中高表达,能调控肌肉的收缩。DWORF能增强SERCA活性,替换SERCA抑制剂如受磷蛋白、肌脂蛋白以及上述的微肽MLN

这很有趣,Eric Olson前后发现了两条lncRNA编码的多肽功能居然相反。

Noncoding RNAs Not So Noncoding

Ruth Williams在2016年发文表示,很多的Noncoding RNAs并非真正的Noncoding,并列举了多个物种间非编码RNA编码微肽的信息(见上图)。

虽然lncRNA已被发现有数万条,其数量还在不断增加,但是绝大数的lncRNA本身的功能依然未知。另外可读框架(ORF)可以存在于lncRNA中,但是ORF的编码蛋白的可能性与其长度有关,越长的ORF编码的可能性越高。那么很有可能之前很多的短链ORF均被忽略了。

当然并不是所有的lncRNA均能编码蛋白或多肽。Guttman表示约有5%的lncRNA具有编码能力,并且有些lncRNA可能会编码多个微肽。这对于没有赶得上趟的研究者来说,“微肽”会不会又是一个新世界的大门呢?

今年1月份,Pier Pandolfi报道了lncRNA LINC00961可以被翻译成一条长度为90个氨基酸的微肽SPAR。SPAR在mTORC1蛋白复合物活性调节方面起着重要的调控作用:可以特异性阻断mTORC1感应氨基酸刺激的能力。通过动物实验证明SPAR能调控肌肉再生以及修复肌肉损伤。这表明该微肽在生理学中同样起着重要作用。

是不是有点心动呢?仿佛CNS在招手的感觉~

参考文献:

1 A micropeptide encoded by a putative long noncoding RNA regulates muscle performance.Cell. 2015 Feb 12;160(4):595-606.

2 A peptide encoded by a transcript annotated as long noncoding RNA enhances SERCA activity in muscle.Science. 2016 Jan 15;351(6270):271-5. 

3 http://www./?articles.view/articleNo/46150/title/Noncoding-RNAs-Not-So-Noncoding/

4 mTORC1 and muscle regeneration are regulated by the LINC00961-encoded SPAR polypeptide.Nature. 2017 Jan 12;541(7636):228-232. 

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