本次研讨班主题: 如何寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的lncRNA 虽然近年来lncRNA的研究成为生物医学领域的大热门,陆续有新的lncRNA序列被报道,但是绝大多数lncRNA的功能和作用机制仍不清楚。本课程将结合CRISPR/Cas9基因编辑技术与lncRNA两大研究热点,分析如何使用已建立的CRISPR/Cas9 lncRNA library寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的lncRNA,以及如何进一步开展后续的lncRNA功能和作用机制研究。本次课程将从背景介绍、研究思路、案例分析三个方面,系统、全面并深入浅出地介绍和分析lncRNA的研究策略,内容涵盖实验方案设计、研究手段运用以及具体案例分析及有关lncRNA研究必备实验方法的操作要点,授课对象面向生物、医学领域的科研工作人员。
Functional analysis of lncRNAs through CRISPR/Cas9-based library screening (Experimental approaches) 什么是lncRNA? lncRNA的定义、特点、分类、功能 如何去寻找疾病或信号通路中关键的调控性lncRNA? library screen lncRNA profiling 如何利用CRISPR/Cas9 lncRNA library筛选疾病或信号通路中关键的调控性lncRNA? 直接利用CRISPR/Cas9 lncRNA library寻找关键性lncRNA 利用报告基因结合CRISPR/Cas9 lncRNA library寻找关键性lncRNA 如何验证筛选出的lncRNA的可靠性? lncRNA过表达 lncRNA knockout. 实验方案和课题设计 辅导学员课题设计 解答具体实验操作问题
莫寅元教授:1956年出生杭州,1982年毕业于浙江大学。1991年获美国华盛顿州立大学植物病理博士学位。1992-1994年在美国华盛顿州了大学微生物博士后研究。曾就职于孟菲斯St. Jude 儿童研究医院、芝加哥伊利诺州大学。参与美国CDMRP项目,NIH项目和我国国家自然项目评选。现为密西西比大学医学中心癌症研究院药理、毒理学教授,癌症项目主要负责人。主要研究mirRNA 和长非编码RNA在肿瘤发生、发展中的作用及药物的抵抗。 第一天课程安排:
9:00-10:20 Introduction Discovery of lncRNAs Characteristics of lncRNAs Significance of lncRNAs Classification of lncRNAs LncRNA-mediated gene regulation How to select lncRNAs of your interest Database search (lncRNA targets; TCGA; and Lncipedia etc)
10:00-10:40 Tea break
10:40-12:00 CRISPR/Cas9 basics How CRISPR/Cas9 works gRNA design (online programs) sgRNA vs dual gRNAs LncRNA KO, gene silencing and gene activation Generation of KO or gene activation libraries Rescue Genome browser (https://genome./FAQ/FAQblat.html)
12:00-14:00 Lunch
14:00-15:20 Screening approaches CRISPR/Cas9-based library screening Direct screening Reporter assisted screening Types of reporters Target validation
15:20-15:40 Tea break
15:40-15:10 Examples of screening
15:10-16:00 Q&A, consultation for project design 第二天没有具体课程,安排学员们与莫教授深入交流 莫教授会给有兴趣的学员做单独指导lncRNA文库筛选与实验设计 声明 illustration 本次培训班是非编码RNA学习的拓展提高班,凡是参加过4.15号北京非编码RNA学习班的学员,可以享受每位500元优惠! 主办方:医药加平台,上海遐永医药科技有限公司 酒店推荐: 上海中兴和泰酒店 【收费标准】 2200元每位,优惠措施:5月10号之前确认报名及转账的优惠200元,可以开正规会务发票,授课期间发放纸质邀请函(盖章)。 注册费包含电子版教材、午餐等费用,但不包括住宿费和晚餐。 报名方式: |
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