【原】抽丝剥茧：生信初学者如何快速组装一台高性价比的服务器？

健明 2021-07-14

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我在想为什么可以学会芯片分析，但总学不会RNA-seq？

答案：芯片分析只要是台电脑就可以上手，但是RNA-seq，没有一台像样的服务器，谈何容易。

于是我就准备从头组装一台服务器。

结果：组装成功并用了三天入门RNA-seq。

首先最恐怖的问题：

电脑零基础能组装自己的服务器么？

我问了一下Jimmy，他说，刚好有个小伙伴自己组装了一台工作站，你可以参考下，我说，把配置清单给我：

1.cpu 至强E5-2683-v3 1个
2.内存64g，DDR4-RECC
3.主板微星99A RAIDER
4.硬盘: 希捷2T机械硬盘，
5.三星960 EVO 256g固态硬盘

最终我也联系到了那位小伙伴（广西医科大学），发现他把配件买齐后，已经配置好了，所以这个事情给了我很大信心。和优秀的人在一起，视野会开阔许多。

好吧，其实这时候不担心会不会组装，担心的是这样的配置，能不能带得动RNA-seq以及其他的生物信息分析。

我就问了一下暑假学习的老师（陈连福老师），他说你这个够用，但是作为专业的生信工作人员，你得上四路，4个CPU，内存要大（256g起步），硬盘要大（4T起步），机器要专业，价格要公道。我说，说那么多，没用，我预算就这么点钱，您比着给个建议吧

他说，我觉得我自己组装的这个DL580G7服务器就挺好，4个CPU，40核80线程，256g内存，所有耗材都是在某宝上攒的，共花费16000。后面问了下业内人士，这么点钱搞下来的都是高手。
我就说，你给我配置清单呗：

E7-4870 4个
内存 8g乘以32条=256g
DL580G7 主板带笼子（来自退伍专业服务器）
硬盘 2T乘以4
电源 4个
内存扩展板 4个
风扇

我拿着清单去某宝查了一下，确实搞不下来，更主要的原因就是我对这个东西一点都不懂。专业的事情交给专业的人来做，我就问他，能不能付费给你，你帮我搞一个一样一样的，他说可以，但是组装服务器有风险，cpu点亮是个难题，来回调货很耗时间，组装好了调试也花时间，但是我的可以直接卖给你，但是要加收服务费，
我说好，接受！

但是最后因为时间的问题以及我要把他放在家里（专业的放在家里不合适），我决定自己组装，这也是学习的过程。就参照一开始广西医科大学那位朋友单个CPU的配置。

首先我有了4路这个概念，所以我折中选择双路，我自己觉得更新获取新的概念很重要，很多时候我们懵逼多半是因为脑子里面完全没有这个概念而已，比如在组装的过程中我又知道了RAID模式，磁盘阵列卡等概念。

李笑来说过，人与人之间的差异就是正确的概念量的大小。

既然选择了双路，我也懒得换CPU，就用那个E5-2683-V3，买两个就行。

CPU：Intel/Xeon E5-2683-V3 正式版CPU 原装散片 14核心28线程（2个）

可是这时候问题来了，双路是需要主板支持的，所以我又看了一下双路的主板，这时候我的脑子里面已经有了兼容这个概念，所以我就检索能够支持E5-2683-V3的双路主板，最终找到了这个

主板：全新超微X10DAI LGA2011-3 C612 双路E5-2600V3V4 图形工作站主板
这个主板支持16根内存插槽，方便以后升级。

然后我又注意到这个主板写了支持的机箱，我才知道，原来主板换了，也要换机箱，我看到这家店里也卖机箱，专业的服务器机箱，我说就在你家买，你把主板和机箱配好了再给我寄过来吧，最后在店家的提醒下，又买了两个cpu的风扇。

机箱：超微SC745TQ-920B 图形工作站塔式机箱 920W电源 8*SATA热插拔
CPU风扇：DIY组装网烁WASO 3U2011 五热管四线侧吹静音工作站散热器两个

现在最重要的就是内存，问了一下群里的朋友，人家直接回复说，DDR4，RECC，2333频率，其实我也不懂这些是什么东西，我也不关心参数什么的。专业的事情让专业的人来做，我听就行了。随即跟电脑城的朋友联系，买了4根三星的内存

内存：三星专业服务器内存 DDR4 RECC 16g 4个

其实到了这一步，一个服务器的框架基本就形成了，除了硬盘啥都可以不要。
但是我同时考虑到一个问题，万一，我是说万一，将来不做生物信息学分析，这个机器怎么办呢？我想我能不能给他配点东西让他能够输入，输出，当一台强大的家用电脑用呢？
所以我又买了一块显示屏：

显示屏：三星C27F591FD 27英寸新品曲面1800R曲率液晶

又买了一个键盘，

机械键盘：海盗船K65红轴

买了个鼠标

鼠标：Logitech/罗技MX MASTER无线大师鼠标蓝牙优联双模式鼠标

我想用另一块硬盘装windows系统和黑苹果系统，而且我之前也体会到了固态硬盘的威力

固态硬盘：Intel SSD 256g 1个

后来又了解到我的主板没有集成显卡，我想到后面要处理图片，所以又整了个入门级别的专业图形卡

显卡：丽台Quadro K620专业设计图形工作站绘图2G显卡

这个图形卡支持双接口，DP接口和HDMI接口，考虑到我的笔记本电脑是HDMI接口，所以又购置了一根DP线用于连接服务器

绿联发烧款 dp线4K高清DP1.2连接线公对公Dell hp displayport线

考虑到实验室网速太慢，准备把机子放在家里面，但是只能用WiFi，所以又买了个无线网卡，考虑到后面要安装黑苹果系统，所以选的是不需要安装驱动的网卡

无线网卡：Fenvi无线网卡台式机pci-e AR9280双频5G 300M+300Mac免驱

这时候我扛着在网上买来的的东西去电脑城找人安装，我想自己查一查网络也可能学会，但是我不喜欢这样做，这需要学习成本，而且专业的事情要交给专业的人来做，对我来说，最需要的是，生信练习，我巴不得有人能够直接把服务器放到我家里，我打开电脑就能用，这时候我根本不想体验动手的乐趣。

电脑城的朋友恰巧收购了一台惠普二手的服务器，就把上面的光驱和硬盘卸载下来卖给了我。

硬盘: 惠普2T 7200转两块
光驱: 惠普原装

讲到硬盘这里还有个小插曲，为还专门写了一段:

我在购买硬盘的时候，观察到硬盘上会写有这样的标志，6Gb/s。
实际上这个标志我看了很多遍，直到我配置服务器时才注意到。

学习一项新的技能，看世界就多了一个维度，这种感觉就像刚背了单词，再去做题时总是会碰到，刚买了新车，发现满大街都是一样的车。但是呢，单词就在那里，没有变过，汽车就在街上，不增不减。改变的是我们的注意力，扩增的是知识结构，从此那些相关的点就会自动填充进来。

我的使用经验告诉我，没有哪一个硬盘达到过这个速度，即使是我特别喜欢的固态硬盘也远远达不到这个要求，那么这个6Gb/s是啥意思呢？
我回家后查阅了一些资料，暂时的理解是这样子的：
SATA（Serial ATA）口的硬盘又叫串口硬盘，是未来PC机硬盘的趋势，现已基本取代了传统的PATA硬盘。SATA的优势：支持热插拔，传输速度快，执行效率高。

SATA分为SATA1.0和SATA2.0和SATA3.0，最大传输速度分别是150M/s和300M/s和600M/s

SATA3.0又叫SATA 6GB/s接口，这个所谓接口速度6GB/s，6GB/s=1024M*6/s=6144M/s≈6000M/s，然而上文提过，SATA3.0最大传输速度600M/s，看起来是矛盾的，但是我们要注意，6Gb/s的b是小写，而GB，MB的B是大写，

这两个b的意思不一样！！！！！
6Gb/s = 6 Giga-bits /second

bit(s) = 比特位，缩写b
Byte(s) = 字节，缩写B

比特位（bit）
来自英文bit，音译为“比特”，表示二进制位。位是计算机内部数据储存的最小单位，11010100是一个8位二进制数。一个二进制位只可以表示0和1两种状态（21）；两个二进制位可以表示00、01、10、11四种（22）状态；三位二进制数可表示八种状态（23）……。
字节（byte）
字节来自英文Byte，音译为“拜特”，习惯上用大写的“B”表示。
字节是计算机中数据处理的基本单位。计算机中以字节为单位存储和解释信息，规定一个字节由八个二进制位构成即1个字节等于8个比特（1Byte=8bit）。八位二进制数最小为00000000，最大为11111111；通常1个字节可以存入一个ASCII码，2个字节可以存放一个汉字国标码。 1Byte = 8bits

所以1Gb = 1/8 GB=128 MB

也就是说
6Gb/s = 6/8 GB/s = 0.75 GB/s = 750 MB/s，

1B=8b。但是硬盘是8/10传输。每10位里只有8个数据位，2个校验位。所以虽然传输了10b但是只有8b是数据。所以要打8折，
所以6Gb/s得最终得传输数据速度是750乘以0.8=600MB/s
而这个600是理论上的最大值，实际上在传输过程中还有约10%的损耗，所以最终，大概传输速度是600乘以0.9=540M/s,这还是固态硬盘的速度，所以世面上的固态硬盘大多说自己的最大速度是550M/s，真实速度大概是200M/s左右。

如果换成机械硬盘，SATA 6Gb/s的意思只是说这个硬盘支持的接口是SATA3，并不代表他的速度。机械硬盘真实的传输速度大概是40M左右。

所以，6Gb/s只是告诉我们这个硬盘是SATA3接口，不要想多了,不要想多了。