忘了早点告诉你：原来基金的基因综述这么写！

导读

　　酸菜提醒：基金的季节又来了！

　　又要开始写基金了，小伙伴们一看到基金两个字就开始头疼，要写啥基因要老板来定，接着是查综述文献，翻译整理，写分子综述。要知道，综述文章是最最难懂的……

　　小伙伴提问：实验设计是差不多，流程也能模块化，但就是这基因综述不好编啊……怎么办？有没有啥快点的办法能写点分子综述出来啊？

　　答：那要用NCBI了！

　　NCBI？是查序列么？当然不是！用NCBI就是要挖掘更多可能的信息！

　　我们从最基本的开始：我们经常使用NCBI的Gene （http://www.ncbi.nlm./gene/）。用Hotair来做个例子吧，这个是比较火的LncRNA。

　　点开后，首先就可以看到一个Summary，这就是对这个基因的整体分析了。但有了这个还不够，向下拉，可以发现一个叫做GeneRIF的栏目，这个栏目主要是注释了已有的对该基因的功能的报道。

　　点进See all，可看到所有的功能注释及文献表格。

　　接下去我们要用的一个NCBI搜索页面是IEB，大家估计听都没听过NCBI的信息工程部（IEB，Information Engineering Branch），想想也和基因的功能什么扯不上关系，IEB确实有两个很实用的工具，一个是Aceview，另一个是Spidey。

　　Spidey主要做的是基因Blast，比如你做RACE获得了一个mRNA，但不知道是哪个基因，也不知道在哪个位置，用这个工具来Blast，能找出外显子内含子的分布，不过这对分子综述写作来说帮助不大，但作为一个技能，酸菜劝你还是先记下为上！

　　Aceview（http://www.ncbi.nlm./IEB/Research/Acembly/index.html）主要是对基因的一种注释，对于基因的位置上下游，基因的功能，可能互作的基因，都有注释。同时，还可以采用Blast的方法，来搜索序列，获得序列所对应的基因的信息。蛮方便的不是么？但是有个小问题，就是里面所包含的信息基本上都是2010年前的信息，所以对于功能所注释的文章而言，有点弱了。

　　要是需要些与各种疾病相关的内容怎么办？我们可以进入到NCBI的Clin Var页面（http://www.ncbi.nlm./clinvar/）进行搜索，用PTEN做个例子。点击进入后，即可看见与PTEN相关的疾病表型，但这些表型内有良性的及不确定表型等，需要一个个去查看哦。

　　最后讲讲OMIM（Online Mendelian Inheritance in Man）：人的孟德尔遗传网（http://www.ncbi.nlm./omim）。一款公布在公众医学（PUBMED）上的资料库，支持在线搜索。主要内容是遗传和变异的基因的相关信息。其中对基因是如何克隆的，以及表达的描述，都是非常详尽的。同时也都附有相关文献的链接。用来做分子综述的参考也是没话说的！

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